More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1807 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01569  multidrug efflux system transporter  100 
 
 		 121 aa  232  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2043  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 121 aa  232  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.899542  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1599  multidrug efflux system protein MdtJ  100 
 
 		 121 aa  232  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.62917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1674  multidrug efflux system protein MdtJ  100 
 
 		 121 aa  232  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1807  multidrug efflux system protein MdtJ  100 
 
 		 121 aa  232  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2030  multidrug efflux system protein MdtJ  100 
 
 		 121 aa  232  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.712996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1786  multidrug efflux system protein MdtJ  100 
 
 		 121 aa  232  1.0000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2310  multidrug efflux system protein MdtJ  100 
 
 		 121 aa  232  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01559  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  232  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1651  multidrug efflux system protein MdtJ  83.9 
 
 		 120 aa  188  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1858  multidrug efflux system protein MdtJ  83.9 
 
 		 120 aa  188  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.636253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1592  multidrug efflux system protein MdtJ  83.9 
 
 		 120 aa  188  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.999303 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1691  multidrug efflux system protein MdtJ  83.9 
 
 		 120 aa  187  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.190656  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1583  multidrug efflux system protein MdtJ  89.91 
 
 		 120 aa  186  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.159233 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1911  multidrug efflux system protein MdtJ  81.36 
 
 		 120 aa  183  6e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2766  small multidrug resistance protein  68.91 
 
 		 122 aa  154  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.131803  normal  0.0168064 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2409  multidrug resistance protein MdtJ  66.37 
 
 		 147 aa  143  6e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00258719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2020  multidrug resistance protein MdtJ  67.57 
 
 		 147 aa  143  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.993103  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2131  small multidrug resistance protein  67.57 
 
 		 147 aa  143  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44520  putative drug efflux transporter  52.14 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.44142 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3791  putative drug efflux transporter  54.72 
 
 		 122 aa  103  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.773212  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00509  cation transporter  43.9 
 
 		 125 aa  90.9  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1360  small multidrug resistance protein  46.9 
 
 		 114 aa  87.4  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001962  spermidine export protein mdtJ  42.98 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0063  small multidrug resistance protein  41.82 
 
 		 137 aa  83.6  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2305  small multidrug resistance protein  42.72 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.148395  normal  0.149185 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2406  SMR family multidrug efflux pump  35.34 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.374447  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1812  small multidrug resistance protein  37.01 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0718  small multidrug resistance protein  36.45 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2060  small multidrug resistance protein  35.85 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  37.5 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  37.5 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  36.61 
 
 		 120 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  36.61 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  36.61 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  36.61 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0437  small multidrug resistance protein  38.83 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.453624  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  33.64 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  33.64 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1188  SMR family multidrug efflux pump  38.89 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  31.78 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  31.78 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  35.09 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1307  SMR family multidrug efflux pump  38.89 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  37.25 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0556  SMR family multidrug efflux pump  38.89 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3554  small multidrug resistance protein  37.14 
 
 		 107 aa  62  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0360  multidrug resistance protein, Smr family  35.64 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0357  SMR family multidrug efflux pump  36.54 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0313  SMR family multidrug efflux pump  34.65 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0296  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  34.65 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0300  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  34.65 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0328  SMR family multidrug efflux pump  34.65 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3346  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0550769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  32.32 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4946  multidrug resistance protein, Smr family  34.65 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0374  multidrug resistance protein, Smr family  34.65 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  35.35 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0402  multidrug resistance protein, Smr family  34.65 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0151896  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0308  small multidrug resistance protein  33.66 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0307  small multidrug resistance protein  35.58 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4057  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.797471  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31080  cation/cationic drug transporter  34.82 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.234075  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4069  small multidrug resistance protein  35.35 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302029  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0908  sugE protein  35.35 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000097747  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4289  sugE protein  35.35 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.093578  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3957  small multidrug resistance protein; quaternary ammonium compound-resistance protein  35.35 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0085456  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3968  small multidrug resistance protein; quaternary ammonium compound-resistance protein  35.35 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  31.31 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4344  sugE protein  35.35 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.970862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4325  sugE protein  35.35 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.80388  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4233  sugE protein  35.35 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3289  small multidrug resistance protein  28.91 
 
 		 126 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2987  small multidrug resistance protein  29.82 
 
 		 115 aa  57  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112994  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2905  small multidrug resistance protein  34.34 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0939249  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4930  small multidrug resistance protein  29.41 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.984602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1659  small multidrug resistance protein  30.39 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119593  normal  0.110471 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3353  small multidrug resistance protein  34.34 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3466  small multidrug resistance protein  35.42 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4755  small multidrug resistance protein  30.17 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.504307  normal  0.07446 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1080  conserved hypothetical protein, putative multidrug resistance efflux protein  37.04 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.644229  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2779  multidrug resistance protein  29.09 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4116  sugE protein  34.34 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2364  small multidrug resistance protein  32.32 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4979  small multidrug resistance protein  29.41 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.174415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4436  sugE protein  34.34 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3071  small multidrug resistance protein  34.26 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.425013  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3545  small multidrug resistance protein  30.43 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4802  small multidrug resistance protein  30.21 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.123188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1102  small multidrug resistance protein  34 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5038  small multidrug resistance protein  35.14 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0352813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1735  small multidrug resistance protein  32.35 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0536  small multidrug resistance protein  28.57 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568122  normal  0.0651219 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1319  small multidrug resistance protein  32.32 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0145783  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0354  SMR family multidrug efflux pump  35.35 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1769  small multidrug resistance protein  33 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0476  small multidrug resistance protein  33.96 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.651583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1584  multidrug efflux protein  33.04 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.339035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3716  small multidrug resistance protein  28.95 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>