More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1360 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1360  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 114 aa  218  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00509  cation transporter  47.79 
 
 		 125 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2409  multidrug resistance protein MdtJ  48.18 
 
 		 147 aa  95.9  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00258719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2020  multidrug resistance protein MdtJ  48.62 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.993103  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2131  small multidrug resistance protein  48.62 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001962  spermidine export protein mdtJ  48.67 
 
 		 134 aa  94.4  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2766  small multidrug resistance protein  49.53 
 
 		 122 aa  94  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.131803  normal  0.0168064 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3791  putative drug efflux transporter  47.79 
 
 		 122 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.773212  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1911  multidrug efflux system protein MdtJ  49.53 
 
 		 120 aa  90.9  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44520  putative drug efflux transporter  47.37 
 
 		 122 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.44142 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2305  small multidrug resistance protein  47.17 
 
 		 117 aa  89.7  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.148395  normal  0.149185 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01569  multidrug efflux system transporter  46.9 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2043  small multidrug resistance protein  46.9 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.899542  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2310  multidrug efflux system protein MdtJ  46.9 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1807  multidrug efflux system protein MdtJ  46.9 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1786  multidrug efflux system protein MdtJ  46.9 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1599  multidrug efflux system protein MdtJ  46.9 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.62917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1674  multidrug efflux system protein MdtJ  46.9 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01559  hypothetical protein  46.9 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2030  multidrug efflux system protein MdtJ  46.9 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.712996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0063  small multidrug resistance protein  44.04 
 
 		 137 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1691  multidrug efflux system protein MdtJ  49.04 
 
 		 120 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.190656  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1592  multidrug efflux system protein MdtJ  49.04 
 
 		 120 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.999303 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1651  multidrug efflux system protein MdtJ  49.04 
 
 		 120 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1858  multidrug efflux system protein MdtJ  49.04 
 
 		 120 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.636253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1812  small multidrug resistance protein  45.95 
 
 		 144 aa  84.3  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1583  multidrug efflux system protein MdtJ  49.04 
 
 		 120 aa  84  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.159233 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0718  small multidrug resistance protein  39.25 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2060  small multidrug resistance protein  42.86 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1188  SMR family multidrug efflux pump  42.86 
 
 		 113 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0556  SMR family multidrug efflux pump  42.86 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1307  SMR family multidrug efflux pump  42.86 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0450  small multidrug resistance protein  36.73 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.724767 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  36.36 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  36.11 
 
 		 116 aa  71.6  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1088  small multidrug resistance protein  34.65 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0798  SMR family multidrug efflux transporter  33.96 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.621925  normal  0.0234862 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  39.58 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2406  SMR family multidrug efflux pump  39.47 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.374447  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2779  multidrug resistance protein  31.68 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  36.08 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  36.08 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3071  small multidrug resistance protein  35.64 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.425013  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2603  small multidrug resistance protein  32.32 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  31.68 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  34.34 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1080  conserved hypothetical protein, putative multidrug resistance efflux protein  38.89 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.644229  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  36 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1863  small multidrug resistance protein  36.08 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3289  small multidrug resistance protein  26.32 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1481  small multidrug resistance protein  35 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1460  small multidrug resistance protein  35 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4057  small multidrug resistance protein  35.64 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.797471  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2905  small multidrug resistance protein  35.42 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0939249  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4701  small multidrug resistance protein  34 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3228  multidrug efflux protein  38.54 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0308245  hitchhiker  0.000780201 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0813  multidrug efflux protein  38.54 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.109831  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2036  multidrug efflux protein  38.54 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1102  small multidrug resistance protein  32.99 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0986  small multidrug resistance protein  35.92 
 
 		 291 aa  63.9  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1535  small multidrug resistance protein  33 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1079  small multidrug resistance protein  33 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1559  small multidrug resistance protein  33 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.219332  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1603  multidrug efflux protein  38.54 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4979  multidrug resistance protein  32 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0536  small multidrug resistance protein  36 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568122  normal  0.0651219 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0541  small multidrug resistance protein  31 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.730216  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1095  SMR drug efflux transporter  31.63 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.1863  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5038  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0352813  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4930  small multidrug resistance protein  34 
 
 		 110 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.984602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0388  SMR family multidrug efflux pump  34.02 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1815  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  34.02 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.701999  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1673  small multidrug resistance protein  32 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.107144 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1730  SMR family multidrug efflux pump  34.02 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1245  SMR family multidrug efflux pump  34.02 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0774  SMR family multidrug efflux pump  34.02 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15362  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1984  SMR family multidrug efflux pump  34.02 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4802  small multidrug resistance protein  34 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.123188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2505  SMR family multidrug efflux pump  31.96 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1832  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  34.02 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.935098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  31.48 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1583  SMR family multidrug efflux transporter  31 
 
 		 108 aa  62  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.352831  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4979  small multidrug resistance protein  34 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.174415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  32.32 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  32.32 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  31.48 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0871  small multidrug resistance protein  32.67 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3404  putative transporter  33.64 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1584  multidrug efflux protein  34.62 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.339035  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4116  sugE protein  32.29 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0488  small multidrug resistance protein  33 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0280081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4436  sugE protein  32.29 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1973  small multidrug resistance protein  34.65 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0150  quaternary ammonium compound-resistance protein QacEdelta1  34.62 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.928712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4701  small multidrug resistance protein  30.1 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00493  multidrug efflux protein  36.46 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  30.97 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00498  hypothetical protein  36.46 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.95244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>