178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_12490 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_12490  cation/cationic drug transporter  100 
 
 		 106 aa  203  7e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2988  small multidrug resistance protein  61.17 
 
 		 108 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282135  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4976  small multidrug resistance protein  56.73 
 
 		 109 aa  102  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0616597 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3345  small multidrug resistance protein  53.27 
 
 		 106 aa  94  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0912633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2987  small multidrug resistance protein  56.31 
 
 		 115 aa  90.5  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112994  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31070  cation/cationic drug transporter  50.48 
 
 		 106 aa  84  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.438868  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3554  small multidrug resistance protein  50.96 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2866  small multidrug resistance protein  53 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2910  small multidrug resistance protein  53 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2896  small multidrug resistance protein  53 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3346  small multidrug resistance protein  49.06 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0550769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0987  small multidrug resistance efflux protein  50 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25874  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4527  small multidrug resistance protein  48.57 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3553  small multidrug resistance protein  52.38 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2867  small multidrug resistance protein  53.26 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2911  small multidrug resistance protein  53.26 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2897  small multidrug resistance protein  53.26 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216047  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4975  small multidrug resistance protein  55.42 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0590431 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31080  cation/cationic drug transporter  46.6 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.234075  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38630  cation/cationic drug transporter  39.05 
 
 		 108 aa  67  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3074  small multidrug resistance protein  42.42 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219411  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0627  small multidrug resistance protein  41.41 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1319  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0145783  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6952  small multidrug resistance protein  41.51 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  42.57 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  42.57 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4478  quaternary ammonium compound-resistance protein  40.57 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.513  normal  0.735408 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2410  small multidrug resistance protein  43.56 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1762  small multidrug resistance protein  36.19 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3353  small multidrug resistance protein  39.18 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  41.05 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1670  small multidrug resistance protein  40.62 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.774613  hitchhiker  0.00381818 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0339  small multidrug resistance protein  33.66 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  41.05 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  35.24 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  37.62 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2072  small multidrug resistance protein  37.62 
 
 		 114 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4930  small multidrug resistance protein  38.95 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.984602  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  33.33 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  34.62 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  33.33 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4802  small multidrug resistance protein  38.95 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.123188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  33.33 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  33.65 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0488  small multidrug resistance protein  36.84 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0280081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4979  small multidrug resistance protein  38.95 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.174415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2946  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0536  small multidrug resistance protein  37.89 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568122  normal  0.0651219 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3071  small multidrug resistance protein  36.54 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.425013  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  34.65 
 
 		 108 aa  52  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1973  small multidrug resistance protein  37.37 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4263  small multidrug resistance protein  35.64 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5493  small multidrug resistance protein  37 
 
 		 114 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.659529  normal  0.39797 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  34.65 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  34.65 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  33.98 
 
 		 109 aa  51.2  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  35.64 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3466  small multidrug resistance protein  34.65 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1769  small multidrug resistance protein  35.64 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0450  small multidrug resistance protein  38.61 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.724767 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0986  small multidrug resistance protein  34.95 
 
 		 291 aa  50.4  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1236  small multidrug resistance protein  31.68 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0062  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  36.54 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.766173 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2779  multidrug resistance protein  30.69 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3077  small multidrug resistance protein  34.34 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2692  small multidrug resistance protein  40.24 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2787  small multidrug resistance protein  35.71 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0231795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0657  small multidrug resistance protein  33.67 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13082  multi-drug transport integral membrane protein mmr  37.35 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3102  small multidrug resistance protein  34.65 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03363  emrE protein  37.37 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0118  small multidrug resistance protein  35.64 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0798  SMR family multidrug efflux transporter  34.62 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.621925  normal  0.0234862 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0871  small multidrug resistance protein  34.74 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1863  small multidrug resistance protein  27.78 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1638  efflux-multidrug resistance protein  31.73 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.381762  hitchhiker  0.000000419533 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02486  hypothetical protein  33 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1911  multidrug efflux system protein MdtJ  28.43 
 
 		 120 aa  47.4  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  29.41 
 
 		 113 aa  47.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01568  multidrug efflux system transporter  31.68 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2044  small multidrug resistance protein  31.68 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1785  multidrug efflux system protein MdtI  31.68 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1600  multidrug efflux system protein MdtI  31.68 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2309  multidrug efflux system protein MdtI  31.68 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.924563 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003631  quaternary ammonium compound-resistance protein  34 
 
 		 118 aa  47  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01558  hypothetical protein  31.68 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2031  multidrug efflux system protein MdtI  31.68 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.660204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1673  multidrug efflux system protein MdtI  31.68 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1806  multidrug efflux system protein MdtI  31.68 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1476  SMR drug efflux transporter  36.59 
 
 		 108 aa  47  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1095  SMR drug efflux transporter  32.99 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.1863  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1826  small multidrug resistance protein  33.68 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273746  normal  0.470725 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  31.68 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1912  multidrug efflux system protein MdtI  34.31 
 
 		 109 aa  47  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1102  small multidrug resistance protein  30.21 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2208  quaternary ammonium compound-resistance protein  33.68 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.831863  normal  0.342211 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2512  small multidrug resistance protein  33.96 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1730  SMR family multidrug efflux pump  33.66 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>