More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1785 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01568  multidrug efflux system transporter  100 
 
 		 109 aa  204  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2044  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 109 aa  204  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1600  multidrug efflux system protein MdtI  100 
 
 		 109 aa  204  4e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1785  multidrug efflux system protein MdtI  100 
 
 		 109 aa  204  4e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01558  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  204  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2031  multidrug efflux system protein MdtI  100 
 
 		 109 aa  204  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.660204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1806  multidrug efflux system protein MdtI  100 
 
 		 109 aa  204  4e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1673  multidrug efflux system protein MdtI  100 
 
 		 109 aa  204  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2309  multidrug efflux system protein MdtI  100 
 
 		 109 aa  204  4e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.924563 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1912  multidrug efflux system protein MdtI  90.83 
 
 		 109 aa  192  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1857  multidrug efflux system protein MdtI  83.49 
 
 		 109 aa  183  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.915726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1652  multidrug efflux system protein MdtI  83.49 
 
 		 109 aa  183  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1690  multidrug efflux system protein MdtI  83.49 
 
 		 109 aa  183  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.119702  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1593  multidrug efflux system protein MdtI  83.49 
 
 		 109 aa  183  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1584  multidrug efflux system protein MdtI  83.49 
 
 		 109 aa  183  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.163608 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2408  multidrug efflux system protein MdtI  74.31 
 
 		 109 aa  156  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00085161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2130  multidrug efflux system protein MdtI  74.31 
 
 		 109 aa  156  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2019  multidrug efflux system protein MdtI  74.31 
 
 		 109 aa  156  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.993103  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2765  multidrug efflux system protein MdtI  78.9 
 
 		 109 aa  148  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.19873  normal  0.0165196 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44530  multidrug efflux system protein MdtI  63.64 
 
 		 109 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.435072 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3793  multidrug efflux system protein MdtI  63.64 
 
 		 109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0064  small multidrug resistance protein  55.1 
 
 		 110 aa  90.1  8e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2405  SMR family multidrug efflux pump  46.15 
 
 		 111 aa  83.6  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.308067  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0721  small multidrug resistance protein  53.95 
 
 		 80 aa  83.6  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2061  small multidrug resistance protein  48.35 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1813  small multidrug resistance protein  43.75 
 
 		 112 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4701  small multidrug resistance protein  39.22 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00510  cation transporter  44.21 
 
 		 109 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  41.84 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001961  spermidine export protein mdtI  44.21 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  41.84 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1308  SMR family multidrug efflux pump  45.57 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.907311  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1189  SMR family multidrug efflux pump  45.57 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0555  SMR family multidrug efflux pump  44.3 
 
 		 102 aa  72  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6952  small multidrug resistance protein  47.96 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1772  multidrug transporter EmrE  34.69 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.132035 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1835  multidrug transporter EmrE  34.69 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.997367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1684  multidrug transporter EmrE  34.69 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487331  normal  0.0413845 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2304  small multidrug resistance protein  38.04 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.145308 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1957  small multidrug resistance protein  42.86 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.504961 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  35.71 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2350  putative methyl viologen/ethidium resistance transmembrane protein  38.14 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000392235  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1774  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  34.69 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324074  normal  0.0937038 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1501  multidrug transporter EmrE  33.67 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21028  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  39.39 
 
 		 110 aa  67  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2946  small multidrug resistance protein  35.71 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3102  small multidrug resistance protein  37.76 
 
 		 109 aa  66.6  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0377  small multidrug resistance protein  35.35 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  38.14 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  32.99 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1234  small multidrug resistance protein  40.4 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2787  small multidrug resistance protein  40.4 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0231795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4057  small multidrug resistance protein  40.43 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.797471  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  32.99 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  32.99 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  32.99 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0271  small multidrug resistance protein  34.34 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  32.04 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  37.37 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0159  multidrug efflux transporter  35.35 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0763675  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  37.37 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0172  small multidrug resistance protein  39.36 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0118  small multidrug resistance protein  37.62 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2208  quaternary ammonium compound-resistance protein  35.71 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.831863  normal  0.342211 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1914  small multidrug resistance protein  35.71 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1804  multidrug resistance protein, SMR family protein  35.71 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  31.07 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1079  conserved hypothetical protein, putative multidrug resistance efflux protein  38.1 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.902407  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  35.64 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  35.64 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0871  small multidrug resistance protein  32.65 
 
 		 114 aa  63.5  0.0000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0731  small multidrug efflux pump  30.3 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3228  multidrug efflux protein  35.71 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0308245  hitchhiker  0.000780201 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1361  small multidrug resistance protein  44.09 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3009  small multidrug resistance protein  34.69 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1437  small multidrug resistance protein  32.32 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3425  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681644  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2779  multidrug resistance protein  36.54 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0813  multidrug efflux protein  34.69 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.109831  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3008  small multidrug resistance protein  37.23 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1603  multidrug efflux protein  34.69 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352426 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2036  multidrug efflux protein  34.69 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1110  small multidrug resistance protein  34.09 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200886  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0986  small multidrug resistance protein  37.76 
 
 		 291 aa  61.6  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3466  small multidrug resistance protein  35.35 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4527  small multidrug resistance protein  38.38 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0730  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  36.08 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2603  small multidrug resistance protein  36.73 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  38 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0657  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3259  small multidrug resistance protein  37.23 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0796  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 		 107 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4263  small multidrug resistance protein  38 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4225  small multidrug resistance protein  31.31 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.023296 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0062  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  37.76 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.766173 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003631  quaternary ammonium compound-resistance protein  31.96 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0798  SMR family multidrug efflux transporter  36.08 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.621925  normal  0.0234862 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2543  small multidrug resistance protein  36.08 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544067  normal  0.553791 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>