More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4263 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4263  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 108 aa  194  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38630  cation/cationic drug transporter  47.06 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0627  small multidrug resistance protein  39.62 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0987  small multidrug resistance efflux protein  42.45 
 
 		 107 aa  73.6  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25874  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4527  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 		 107 aa  72  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  41.58 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4262  small multidrug resistance protein  51.92 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4057  small multidrug resistance protein  40.78 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.797471  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3259  small multidrug resistance protein  38.61 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3008  small multidrug resistance protein  37.62 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0172  small multidrug resistance protein  41.41 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1460  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1481  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1673  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.107144 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1535  small multidrug resistance protein  42.57 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1079  small multidrug resistance protein  42.57 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1559  small multidrug resistance protein  42.57 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.219332  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  38.61 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  38.61 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4701  small multidrug resistance protein  42.57 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2526  small multidrug resistance protein  43.48 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158974  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4976  small multidrug resistance protein  36.19 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0616597 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04008  SugE  40.95 
 
 		 104 aa  63.5  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  36.89 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  36.89 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  39.56 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  39.56 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1912  multidrug efflux system protein MdtI  39 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2478  small multidrug resistance protein  42.39 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3713  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2779  multidrug resistance protein  37.36 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0420  small multidrug resistance protein  39.13 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2364  small multidrug resistance protein  38.61 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1773  DMT superfamily multidrug efflux pump  39.13 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.251074  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2336  small multidrug resistance protein  41.3 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155364  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6417  small multidrug resistance protein  40.22 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1762  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2410  small multidrug resistance protein  34.04 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  36.27 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  38.83 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1659  small multidrug resistance protein  38.24 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119593  normal  0.110471 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2945  small multidrug resistance protein  38.61 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46208  normal  0.904124 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  39.56 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1313  small multidrug resistance protein  37.23 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.177322 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0570  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2072  small multidrug resistance protein  30.1 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2502  quaternary ammonium efflux pump, 4 TMS small multidrug resistance (SMR) family, GacE  37.5 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85484  normal  0.536214 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1735  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 		 112 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5038  small multidrug resistance protein  39.56 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0352813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  38.04 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1016  small multidrug resistance protein  41.41 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4585  small multidrug resistance protein  39.76 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.631388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3466  small multidrug resistance protein  32.69 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2543  small multidrug resistance protein  35.64 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544067  normal  0.553791 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  38.04 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0657  small multidrug resistance protein  36.89 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1878  small multidrug resistance protein  41.49 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337942  normal  0.058805 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  38.04 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3312  small multidrug resistance protein  42.39 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0627719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4019  small multidrug resistance protein  36.84 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3247  small multidrug efflux pump  38.04 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.848781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  40.22 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2988  small multidrug resistance protein  35.85 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282135  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  37.14 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1701  small multidrug resistance protein  36.84 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218727 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1870  sugE protein  40 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.437905  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1399  suppresses groEL, may be chaperone  40 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0339  small multidrug resistance protein  33.01 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  38.3 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2505  SMR family multidrug efflux pump  37.5 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2897  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.904986 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1257  SMR family multidrug efflux pump  40 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303472  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1090  sugE protein  40 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8162  transporter  34.29 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.237194 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0777  sugE protein  40 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590294  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3195  small multidrug resistance protein  44.74 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141243 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0373  sugE protein  40 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1249  SMR family multidrug efflux pump  40 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0853  small multidrug resistance protein  31.73 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2515  small multidrug resistance protein  34.74 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.686448  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3345  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0912633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1576  small multidrug resistance protein  32.94 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.554715  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4701  small multidrug resistance protein  35.24 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0685  small multidrug resistance protein  34.58 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  32.63 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  30.93 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1256  small multidrug resistance protein  35.79 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359766 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0982  small multidrug resistance protein  39.13 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.900184  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  35.87 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  30.93 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2257  small multidrug resistance protein  36.27 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.709004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  35.87 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  35.87 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  35.87 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1617  small multidrug resistance protein  36.27 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  35.87 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  35.87 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  35.87 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0511297 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1027  sugE protein  37.89 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1815  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  37.62 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.701999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>