More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4262 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4262  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 122 aa  228  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4263  small multidrug resistance protein  51.92 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0987  small multidrug resistance efflux protein  46.15 
 
 		 107 aa  92.8  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25874  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4527  small multidrug resistance protein  41.12 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38630  cation/cationic drug transporter  41.9 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0172  small multidrug resistance protein  41.51 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  37.04 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  37.04 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2512  small multidrug resistance protein  36.79 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2946  small multidrug resistance protein  32.73 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0627  small multidrug resistance protein  34.29 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4976  small multidrug resistance protein  37.74 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0616597 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1319  small multidrug resistance protein  45.24 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0145783  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0339  small multidrug resistance protein  35.51 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1762  small multidrug resistance protein  36.45 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1878  small multidrug resistance protein  37.86 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337942  normal  0.058805 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1236  small multidrug resistance protein  31.82 
 
 		 109 aa  70.1  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  34.31 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2478  small multidrug resistance protein  40.59 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2158  small multidrug resistance protein  35.92 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  34.31 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  35.64 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0853  small multidrug resistance protein  32.04 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  38.24 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  30.48 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  30.48 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4254  small multidrug resistance protein  41.84 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  31.43 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  30.48 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  31.43 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0685  small multidrug resistance protein  33.01 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2650  small multidrug resistance protein  36.89 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0773  sugE protein  35.92 
 
 		 105 aa  67  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.757365  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2080  small multidrug resistance protein  36.89 
 
 		 104 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235888  normal  0.293882 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3102  small multidrug resistance protein  34.58 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0780  sugE protein  35.92 
 
 		 105 aa  67  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1950  small multidrug resistance protein  33.02 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.498297  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  30.48 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4585  small multidrug resistance protein  42.5 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.631388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  32.73 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  34.62 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  32.73 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2505  SMR family multidrug efflux pump  34.91 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3008  small multidrug resistance protein  35.92 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3195  small multidrug resistance protein  39.22 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141243 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1088  small multidrug resistance protein  32.08 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3611  small multidrug resistance protein  33.02 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2235  small multidrug resistance protein  33.64 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4068  small multidrug resistance protein  35.29 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4409  small multidrug resistance protein  40.82 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0420  small multidrug resistance protein  37.62 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1773  DMT superfamily multidrug efflux pump  37.62 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.251074  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1437  small multidrug resistance protein  33.65 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0100  sugE protein  34.95 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3554  small multidrug resistance protein  36.11 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0616  small multidrug resistance protein  36.79 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.88639  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  31.78 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2515  small multidrug resistance protein  33.01 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.686448  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2526  small multidrug resistance protein  38.1 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158974  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  36.36 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  36.36 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3259  small multidrug resistance protein  34.95 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2779  multidrug resistance protein  30 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1584  multidrug efflux protein  36.75 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.339035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0455  multidrug resistance protein SugE, putative  37.86 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0150  quaternary ammonium compound-resistance protein QacEdelta1  36.75 
 
 		 115 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.928712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0828  small multidrug resistance protein  30.91 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.251219  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3403  small multidrug resistance protein  31.13 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5609  small multidrug resistance protein  35.92 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.329891  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4387  small multidrug resistance protein  39.8 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1102  small multidrug resistance protein  31.31 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2896  small multidrug resistance protein  35.9 
 
 		 114 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0763  small multidrug resistance protein  33.01 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0159  multidrug efflux transporter  32.69 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0763675  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2305  small multidrug resistance protein  35.92 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0996  small multidrug resistance protein  35.92 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.762024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1670  small multidrug resistance protein  35.92 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2866  small multidrug resistance protein  35.9 
 
 		 114 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2282  small multidrug resistance protein  35.92 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2910  small multidrug resistance protein  35.9 
 
 		 114 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1574  small multidrug resistance protein  38.1 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0271  small multidrug resistance protein  34.31 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6952  small multidrug resistance protein  40.19 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0488  small multidrug resistance protein  29.36 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0280081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3425  small multidrug resistance protein  32.69 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681644  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0377  small multidrug resistance protein  33.98 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1016  small multidrug resistance protein  37.14 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3713  small multidrug resistance protein  33.98 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0570  small multidrug resistance protein  42.86 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1501  multidrug transporter EmrE  25.47 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21028  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1835  multidrug transporter EmrE  25.47 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.997367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1313  small multidrug resistance protein  33.01 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.177322 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1684  multidrug transporter EmrE  25.47 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487331  normal  0.0413845 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0062  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  37.61 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.766173 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1772  multidrug transporter EmrE  25.47 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.132035 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2027  small multidrug resistance protein  35.92 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.067086  normal  0.084051 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2198  small multidrug resistance protein  34.95 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2608  small multidrug resistance protein  36.89 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  36.08 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8161  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.32554 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>