More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0339 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0339  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 111 aa  213  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13082  multi-drug transport integral membrane protein mmr  72.16 
 
 		 107 aa  118  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0987  small multidrug resistance efflux protein  46.67 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25874  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1762  small multidrug resistance protein  46.73 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0627  small multidrug resistance protein  44.86 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2036  multidrug efflux protein  43.69 
 
 		 110 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4527  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1603  multidrug efflux protein  45.92 
 
 		 110 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352426 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0813  multidrug efflux protein  44.9 
 
 		 110 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.109831  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38630  cation/cationic drug transporter  42.86 
 
 		 108 aa  87.4  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  49 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3353  small multidrug resistance protein  44.76 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3228  multidrug efflux protein  43.88 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0308245  hitchhiker  0.000780201 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1884  small multidrug resistance protein  46.6 
 
 		 107 aa  84.3  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00493  multidrug efflux protein  43.88 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00498  hypothetical protein  43.88 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.95244  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  46.53 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  46.53 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  47.06 
 
 		 116 aa  82.8  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1245  SMR family multidrug efflux pump  47.17 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0388  SMR family multidrug efflux pump  47.17 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1984  SMR family multidrug efflux pump  47.17 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1815  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  47.17 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.701999  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1730  SMR family multidrug efflux pump  47.17 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1832  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  47.17 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.935098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0774  SMR family multidrug efflux pump  47.17 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15362  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0657  small multidrug resistance protein  41.75 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0172  small multidrug resistance protein  44.55 
 
 		 111 aa  80.1  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2505  SMR family multidrug efflux pump  45.28 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4478  quaternary ammonium compound-resistance protein  47.62 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.513  normal  0.735408 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  40.57 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  40.54 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  41.58 
 
 		 110 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  41.58 
 
 		 110 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1617  small multidrug resistance protein  43.56 
 
 		 110 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2257  small multidrug resistance protein  42.57 
 
 		 110 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.709004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2072  small multidrug resistance protein  39.22 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4701  small multidrug resistance protein  45.28 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2350  putative methyl viologen/ethidium resistance transmembrane protein  43.88 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000392235  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0871  small multidrug resistance protein  41.75 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4755  small multidrug resistance protein  39.62 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.504307  normal  0.07446 
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  36.94 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1535  small multidrug resistance protein  43.4 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0450  small multidrug resistance protein  44.9 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.724767 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1079  small multidrug resistance protein  43.4 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  36.94 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1559  small multidrug resistance protein  43.4 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.219332  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2787  small multidrug resistance protein  37.74 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0231795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0062  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  40.59 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.766173 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1673  small multidrug resistance protein  43.4 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.107144 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5038  small multidrug resistance protein  42.72 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0352813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1914  small multidrug resistance protein  43.75 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1804  multidrug resistance protein, SMR family protein  43.75 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  41.58 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2208  quaternary ammonium compound-resistance protein  43.75 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.831863  normal  0.342211 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2512  small multidrug resistance protein  40.78 
 
 		 108 aa  72  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  33.33 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1481  small multidrug resistance protein  42.45 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1460  small multidrug resistance protein  42.45 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1719  small multidrug resistance protein  36.79 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241026 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3321  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00184251  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  33.33 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0798  SMR family multidrug efflux transporter  46.53 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.621925  normal  0.0234862 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6952  small multidrug resistance protein  43.56 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4057  small multidrug resistance protein  37.74 
 
 		 112 aa  72  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.797471  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  33.33 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1735  small multidrug resistance protein  41.58 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  33.33 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1659  small multidrug resistance protein  42.57 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119593  normal  0.110471 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2603  small multidrug resistance protein  38.83 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  33.33 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2502  quaternary ammonium efflux pump, 4 TMS small multidrug resistance (SMR) family, GacE  39.22 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85484  normal  0.536214 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1319  small multidrug resistance protein  40.19 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0145783  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1088  small multidrug resistance protein  37.62 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4585  small multidrug resistance protein  49.38 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.631388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3008  small multidrug resistance protein  38.61 
 
 		 113 aa  70.1  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3102  small multidrug resistance protein  42.11 
 
 		 109 aa  70.1  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  33.01 
 
 		 120 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1095  SMR drug efflux transporter  38.24 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.1863  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2897  small multidrug resistance protein  41.41 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.904986 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1863  small multidrug resistance protein  37.14 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1177  small multidrug resistance protein  36.63 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000160416  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2779  multidrug resistance protein  35.64 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3289  small multidrug resistance protein  37.11 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1392  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1973  small multidrug resistance protein  44.79 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1769  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3259  small multidrug resistance protein  38.61 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1397  small multidrug resistance protein  36.54 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1672  small multidrug resistance protein  36.54 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.737958  normal  0.915426 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1234  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1583  SMR family multidrug efflux transporter  45.1 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.352831  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3466  small multidrug resistance protein  34.95 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3404  putative transporter  38.32 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02486  hypothetical protein  37.89 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40170  putative transporter  38.32 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0731  small multidrug efflux pump  36.89 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1236  small multidrug resistance protein  34.26 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2083  small multidrug resistance protein  40.45 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000894022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>