More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1863 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1863  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 123 aa  246  6e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1102  small multidrug resistance protein  69.52 
 
 		 107 aa  161  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1095  SMR drug efflux transporter  63.89 
 
 		 108 aa  144  6e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.1863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  52.88 
 
 		 120 aa  120  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  52.88 
 
 		 120 aa  120  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1476  SMR drug efflux transporter  55.66 
 
 		 108 aa  120  9e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  50.96 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  51.92 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  51.92 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  50.96 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3077  small multidrug resistance protein  53.06 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1719  small multidrug resistance protein  45.05 
 
 		 116 aa  107  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241026 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1177  small multidrug resistance protein  46.15 
 
 		 109 aa  103  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000160416  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3353  small multidrug resistance protein  46.23 
 
 		 106 aa  102  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0308  small multidrug resistance protein  45.63 
 
 		 107 aa  100  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0374  multidrug resistance protein, Smr family  44.66 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0313  SMR family multidrug efflux pump  44.66 
 
 		 107 aa  98.6  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0296  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  44.66 
 
 		 107 aa  98.6  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0300  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  44.66 
 
 		 107 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0328  SMR family multidrug efflux pump  44.66 
 
 		 107 aa  98.6  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4946  multidrug resistance protein, Smr family  44.66 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0360  multidrug resistance protein, Smr family  43.69 
 
 		 107 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0402  multidrug resistance protein, Smr family  43.69 
 
 		 107 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0151896  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2325  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 107 aa  97.4  6e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0357  SMR family multidrug efflux pump  44.66 
 
 		 107 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0307  small multidrug resistance protein  44.66 
 
 		 107 aa  94.4  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1583  SMR family multidrug efflux transporter  45.63 
 
 		 108 aa  93.6  8e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.352831  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4755  small multidrug resistance protein  44.66 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.504307  normal  0.07446 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2091  small multidrug resistance protein  44.57 
 
 		 100 aa  90.9  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.818483  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  42.16 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1319  small multidrug resistance protein  44.34 
 
 		 106 aa  86.3  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0145783  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2072  small multidrug resistance protein  38.24 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0798  SMR family multidrug efflux transporter  41.75 
 
 		 108 aa  85.5  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.621925  normal  0.0234862 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0172  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 		 111 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  41.51 
 
 		 109 aa  84.7  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  41.51 
 
 		 109 aa  84.3  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  40.2 
 
 		 116 aa  84.3  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4057  small multidrug resistance protein  41.41 
 
 		 112 aa  83.6  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.797471  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1088  small multidrug resistance protein  39.45 
 
 		 109 aa  84  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3289  small multidrug resistance protein  39.22 
 
 		 126 aa  84  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2512  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 108 aa  83.6  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  40.82 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5038  small multidrug resistance protein  40.62 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0352813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3071  small multidrug resistance protein  40.82 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.425013  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2083  small multidrug resistance protein  44.12 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000894022  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  39.62 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3247  small multidrug efflux pump  37.74 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.848781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1973  small multidrug resistance protein  41.24 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1236  small multidrug resistance protein  36.27 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1870  sugE protein  38.68 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.437905  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0373  sugE protein  38.68 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1399  suppresses groEL, may be chaperone  38.68 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1257  SMR family multidrug efflux pump  38.68 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303472  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1249  SMR family multidrug efflux pump  38.68 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0777  sugE protein  38.68 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590294  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1090  sugE protein  38.68 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2731  small multidrug resistance protein  37.25 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000850052  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  37.61 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3102  small multidrug resistance protein  37.76 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  40.59 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  36.46 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  36.46 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2779  multidrug resistance protein  37.76 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0780  sugE protein  41.35 
 
 		 105 aa  79  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  37.74 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3403  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 105 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  37.74 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  40.59 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2603  small multidrug resistance protein  39.36 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  39.22 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1313  small multidrug resistance protein  35.85 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.177322 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1027  sugE protein  36.79 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0871  small multidrug resistance protein  41.49 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0281  small multidrug resistance protein  36.54 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1659  small multidrug resistance protein  38.89 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119593  normal  0.110471 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2897  small multidrug resistance protein  41.86 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.904986 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0987  small multidrug resistance efflux protein  33.64 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25874  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0996  small multidrug resistance protein  34.91 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.762024  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  35.09 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2198  small multidrug resistance protein  36.79 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2320  small multidrug resistance protein  36.79 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3404  putative transporter  36.79 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1762  small multidrug resistance protein  39.25 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  34.86 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  34.86 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0773  sugE protein  40.38 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.757365  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2027  small multidrug resistance protein  36.27 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.067086  normal  0.084051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3009  small multidrug resistance protein  38.24 
 
 		 109 aa  76.6  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  36.79 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1403  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0526825  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6952  small multidrug resistance protein  39.25 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3008  small multidrug resistance protein  42.22 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2305  small multidrug resistance protein  33.96 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38630  cation/cationic drug transporter  34.29 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1670  small multidrug resistance protein  33.96 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4585  small multidrug resistance protein  41.33 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.631388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40170  putative transporter  36.79 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2282  small multidrug resistance protein  33.96 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>