192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3345 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3345  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 106 aa  201  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0912633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3553  small multidrug resistance protein  77.36 
 
 		 107 aa  146  9e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31070  cation/cationic drug transporter  59.43 
 
 		 106 aa  107  5e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.438868  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4976  small multidrug resistance protein  53.77 
 
 		 109 aa  96.7  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0616597 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12490  cation/cationic drug transporter  53.27 
 
 		 106 aa  94  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2988  small multidrug resistance protein  53.7 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282135  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3554  small multidrug resistance protein  51.46 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2987  small multidrug resistance protein  59.6 
 
 		 115 aa  91.3  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112994  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3346  small multidrug resistance protein  52.88 
 
 		 108 aa  88.6  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0550769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2866  small multidrug resistance protein  50.49 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2910  small multidrug resistance protein  50.49 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2896  small multidrug resistance protein  50.49 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38630  cation/cationic drug transporter  42.99 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0987  small multidrug resistance efflux protein  45.87 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25874  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31080  cation/cationic drug transporter  50.98 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.234075  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4527  small multidrug resistance protein  49.53 
 
 		 107 aa  72  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4975  small multidrug resistance protein  48.24 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0590431 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2867  small multidrug resistance protein  54.35 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2911  small multidrug resistance protein  54.35 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2897  small multidrug resistance protein  54.35 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216047  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6952  small multidrug resistance protein  43.12 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3074  small multidrug resistance protein  43.56 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219411  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0627  small multidrug resistance protein  42.59 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  43.81 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  43.81 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1762  small multidrug resistance protein  36.45 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2410  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  39.42 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1319  small multidrug resistance protein  41.28 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0145783  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4263  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  41.75 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3102  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2946  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 		 109 aa  57  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0828  small multidrug resistance protein  39.62 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.251219  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0986  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3008  small multidrug resistance protein  41.58 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3259  small multidrug resistance protein  41.58 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  41.35 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06909  hypothetical protein  29.91 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0172  small multidrug resistance protein  42.16 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644659  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2779  multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1236  small multidrug resistance protein  36.89 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0437  small multidrug resistance protein  40.2 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.453624  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1088  small multidrug resistance protein  38.1 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3466  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1670  small multidrug resistance protein  37.74 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.774613  hitchhiker  0.00381818 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  38.1 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1884  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2543  small multidrug resistance protein  41.58 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544067  normal  0.553791 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1481  small multidrug resistance protein  43.14 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545995  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  38.83 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3353  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1460  small multidrug resistance protein  43.14 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1638  efflux-multidrug resistance protein  35.92 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.381762  hitchhiker  0.000000419533 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4478  quaternary ammonium compound-resistance protein  42.59 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.513  normal  0.735408 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  38.83 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1673  small multidrug resistance protein  42.16 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.107144 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1245  SMR family multidrug efflux pump  43.14 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2364  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1984  SMR family multidrug efflux pump  43.14 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3071  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.425013  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03363  emrE protein  33.33 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1730  SMR family multidrug efflux pump  43.14 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0388  SMR family multidrug efflux pump  43.14 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1815  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  43.14 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.701999  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1832  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  43.14 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.935098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0774  SMR family multidrug efflux pump  43.14 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15362  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  35.92 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  35.92 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3289  small multidrug resistance protein  35.19 
 
 		 126 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0450  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 109 aa  51.2  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.724767 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0798  SMR family multidrug efflux transporter  37.25 
 
 		 108 aa  51.2  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.621925  normal  0.0234862 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0871  small multidrug resistance protein  38.54 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0657  small multidrug resistance protein  39.22 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2205  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2208  quaternary ammonium compound-resistance protein  34.91 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.831863  normal  0.342211 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1914  small multidrug resistance protein  34.91 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1769  small multidrug resistance protein  34.95 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1804  multidrug resistance protein, SMR family protein  34.91 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0731  small multidrug efflux pump  34.65 
 
 		 114 aa  50.4  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1826  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 		 109 aa  50.4  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273746  normal  0.470725 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2505  SMR family multidrug efflux pump  42.16 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65990  SMR multidrug efflux transporter  38.24 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00317706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4701  small multidrug resistance protein  34.95 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2478  small multidrug resistance protein  44.44 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02486  hypothetical protein  34.74 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4701  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1079  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1437  small multidrug resistance protein  29.91 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1559  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.219332  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4057  small multidrug resistance protein  35.92 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.797471  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2512  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2603  small multidrug resistance protein  36.94 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5725  SMR multidrug efflux transporter  37.25 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1535  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4930  small multidrug resistance protein  34.65 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.984602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4979  small multidrug resistance protein  34.65 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.174415  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>