More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2692 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2692  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 106 aa  198  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1762  small multidrug resistance protein  56.19 
 
 		 108 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  47.17 
 
 		 109 aa  96.7  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  47.17 
 
 		 109 aa  96.7  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  43.4 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  51.49 
 
 		 109 aa  95.5  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0172  small multidrug resistance protein  48.54 
 
 		 111 aa  94.7  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  43.4 
 
 		 120 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  44.12 
 
 		 120 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  45.1 
 
 		 120 aa  94.4  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  45.1 
 
 		 120 aa  94.4  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  45.1 
 
 		 120 aa  94  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1319  small multidrug resistance protein  51.89 
 
 		 106 aa  94  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0145783  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4478  quaternary ammonium compound-resistance protein  58.1 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.513  normal  0.735408 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  52 
 
 		 116 aa  93.2  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  46.67 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  47.17 
 
 		 108 aa  87.4  5e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1088  small multidrug resistance protein  43.14 
 
 		 109 aa  87.4  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1583  SMR family multidrug efflux transporter  44 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.352831  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1102  small multidrug resistance protein  44.66 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3353  small multidrug resistance protein  47.06 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  43.56 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  43.56 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  46.53 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  45.28 
 
 		 109 aa  84.7  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0987  small multidrug resistance efflux protein  45.79 
 
 		 107 aa  84  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25874  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0798  SMR family multidrug efflux transporter  43 
 
 		 108 aa  84  6e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.621925  normal  0.0234862 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2208  quaternary ammonium compound-resistance protein  46.39 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.831863  normal  0.342211 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2512  small multidrug resistance protein  44.12 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1914  small multidrug resistance protein  46.39 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1476  SMR drug efflux transporter  45.35 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1804  multidrug resistance protein, SMR family protein  46.39 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4755  small multidrug resistance protein  47.17 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.504307  normal  0.07446 
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  50 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1095  SMR drug efflux transporter  45.63 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.1863  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  50 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4057  small multidrug resistance protein  38.68 
 
 		 112 aa  82.8  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.797471  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1177  small multidrug resistance protein  46.46 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000160416  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2257  small multidrug resistance protein  43.69 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.709004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  48.94 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1863  small multidrug resistance protein  38.83 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0339  small multidrug resistance protein  47.57 
 
 		 111 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1617  small multidrug resistance protein  42.72 
 
 		 110 aa  80.9  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0450  small multidrug resistance protein  45.1 
 
 		 109 aa  80.1  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.724767 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0828  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.251219  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3102  small multidrug resistance protein  44.34 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3071  small multidrug resistance protein  40.2 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.425013  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0871  small multidrug resistance protein  44.9 
 
 		 114 aa  80.1  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2072  small multidrug resistance protein  43.4 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2325  small multidrug resistance protein  40.38 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2787  small multidrug resistance protein  48.51 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0231795  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0313  SMR family multidrug efflux pump  38.68 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0296  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  38.68 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0300  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  38.68 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4946  multidrug resistance protein, Smr family  38.68 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0062  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  45.54 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.766173 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0328  SMR family multidrug efflux pump  38.68 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0271  small multidrug resistance protein  37.86 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1501  multidrug transporter EmrE  41.75 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21028  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0374  multidrug resistance protein, Smr family  38.68 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4585  small multidrug resistance protein  51.85 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.631388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0402  multidrug resistance protein, Smr family  38.68 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0151896  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1769  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0360  multidrug resistance protein, Smr family  37.74 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3425  small multidrug resistance protein  37.86 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0308  small multidrug resistance protein  38.68 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1774  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  41.75 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324074  normal  0.0937038 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0357  SMR family multidrug efflux pump  37.74 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1884  small multidrug resistance protein  47.96 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1835  multidrug transporter EmrE  41.75 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.997367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1684  multidrug transporter EmrE  41.75 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487331  normal  0.0413845 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1772  multidrug transporter EmrE  41.75 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.132035 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4527  small multidrug resistance protein  45.71 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0159  multidrug efflux transporter  36.89 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0763675  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1236  small multidrug resistance protein  39.62 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  40.38 
 
 		 113 aa  76.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0377  small multidrug resistance protein  35.92 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0307  small multidrug resistance protein  37.74 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1973  small multidrug resistance protein  47.06 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1659  small multidrug resistance protein  45 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119593  normal  0.110471 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3466  small multidrug resistance protein  40.59 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4225  small multidrug resistance protein  36.89 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.023296 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3289  small multidrug resistance protein  42.86 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3077  small multidrug resistance protein  41.67 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2083  small multidrug resistance protein  40.57 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000894022  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2543  small multidrug resistance protein  44 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544067  normal  0.553791 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0408  quaternary ammonium compound-resistance protein  45.24 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1234  small multidrug resistance protein  42.86 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2779  multidrug resistance protein  40.57 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38630  cation/cationic drug transporter  40.95 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2946  small multidrug resistance protein  40.57 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1584  multidrug efflux protein  46.74 
 
 		 153 aa  72  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.339035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3228  multidrug efflux protein  40.4 
 
 		 110 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0308245  hitchhiker  0.000780201 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2505  SMR family multidrug efflux pump  43.62 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2036  multidrug efflux protein  40.4 
 
 		 110 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4701  small multidrug resistance protein  40.43 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2410  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 111 aa  72  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1603  multidrug efflux protein  40.4 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352426 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0150  quaternary ammonium compound-resistance protein QacEdelta1  46.74 
 
 		 115 aa  72  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.928712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0813  multidrug efflux protein  40.4 
 
 		 110 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.109831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>