More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1188 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_1188  SMR family multidrug efflux pump  100 
 
 		 113 aa  210  4.9999999999999996e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0556  SMR family multidrug efflux pump  98.23 
 
 		 113 aa  207  3e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1307  SMR family multidrug efflux pump  97.35 
 
 		 113 aa  191  4e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1080  conserved hypothetical protein, putative multidrug resistance efflux protein  80 
 
 		 113 aa  150  4e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.644229  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2305  small multidrug resistance protein  43.86 
 
 		 117 aa  103  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.148395  normal  0.149185 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00509  cation transporter  47.22 
 
 		 125 aa  97.4  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001962  spermidine export protein mdtJ  47.17 
 
 		 134 aa  91.7  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1360  small multidrug resistance protein  42.86 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1812  small multidrug resistance protein  38.1 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3466  small multidrug resistance protein  39.22 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1911  multidrug efflux system protein MdtJ  40.95 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0063  small multidrug resistance protein  37.62 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3791  putative drug efflux transporter  39.22 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.773212  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44520  putative drug efflux transporter  39.22 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.44142 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  40.21 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2030  multidrug efflux system protein MdtJ  38.89 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.712996  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01569  multidrug efflux system transporter  38.89 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2043  small multidrug resistance protein  38.89 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.899542  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1674  multidrug efflux system protein MdtJ  38.89 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1807  multidrug efflux system protein MdtJ  38.89 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1786  multidrug efflux system protein MdtJ  38.89 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01559  hypothetical protein  38.89 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1599  multidrug efflux system protein MdtJ  38.89 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.62917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0657  small multidrug resistance protein  37.25 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2310  multidrug efflux system protein MdtJ  38.89 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2766  small multidrug resistance protein  36.19 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.131803  normal  0.0168064 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  39 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1583  multidrug efflux system protein MdtJ  38.1 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.159233 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1858  multidrug efflux system protein MdtJ  38.1 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.636253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1592  multidrug efflux system protein MdtJ  38.1 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.999303 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1651  multidrug efflux system protein MdtJ  38.1 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0871  small multidrug resistance protein  35.29 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1691  multidrug efflux system protein MdtJ  38.1 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.190656  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0718  small multidrug resistance protein  34 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4057  small multidrug resistance protein  34.02 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.797471  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2020  multidrug resistance protein MdtJ  36.19 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.993103  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2409  multidrug resistance protein MdtJ  36.19 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00258719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2131  small multidrug resistance protein  36.19 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2060  small multidrug resistance protein  31.78 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1196  small multidrug resistance protein  34.29 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  35.35 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  35.35 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  34.34 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  37.62 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3077  small multidrug resistance protein  38 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3259  small multidrug resistance protein  39.18 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1826  small multidrug resistance protein  36 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273746  normal  0.470725 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3008  small multidrug resistance protein  38.14 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3353  small multidrug resistance protein  34 
 
 		 106 aa  63.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  34.26 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  33.33 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  33.33 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  33.33 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3289  small multidrug resistance protein  35.29 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0731  small multidrug efflux pump  32.35 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2787  small multidrug resistance protein  35.64 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0231795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  32 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  32 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1236  small multidrug resistance protein  34 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0118  small multidrug resistance protein  36 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0798  SMR family multidrug efflux transporter  32.04 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.621925  normal  0.0234862 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  34.95 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0307  small multidrug resistance protein  35.58 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  31.43 
 
 		 110 aa  60.1  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  30 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  30 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0986  small multidrug resistance protein  29.36 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0172  small multidrug resistance protein  34.69 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2083  small multidrug resistance protein  37.96 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000894022  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2779  multidrug resistance protein  32.67 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  32.71 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0271  small multidrug resistance protein  33.01 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  36.17 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1088  small multidrug resistance protein  31.68 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0437  small multidrug resistance protein  35.29 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.453624  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2512  small multidrug resistance protein  32.08 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2988  small multidrug resistance protein  31.78 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282135  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2692  small multidrug resistance protein  39.33 
 
 		 106 aa  57  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  34.69 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0062  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  35 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.766173 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2350  putative methyl viologen/ethidium resistance transmembrane protein  32.98 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000392235  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  34.69 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0377  small multidrug resistance protein  32.04 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1437  small multidrug resistance protein  29.13 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3716  small multidrug resistance protein  30.77 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1762  small multidrug resistance protein  35.92 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3009  small multidrug resistance protein  28.71 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4527  small multidrug resistance protein  31.07 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2887  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.014423 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1638  efflux-multidrug resistance protein  33.65 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.381762  hitchhiker  0.000000419533 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1730  SMR family multidrug efflux pump  29.59 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1815  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  29.59 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.701999  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3102  small multidrug resistance protein  31.48 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1245  SMR family multidrug efflux pump  29.59 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0774  SMR family multidrug efflux pump  29.59 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15362  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1984  SMR family multidrug efflux pump  29.59 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0388  SMR family multidrug efflux pump  29.59 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1673  small multidrug resistance protein  33.66 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.107144 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1884  small multidrug resistance protein  29.7 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1863  small multidrug resistance protein  26.79 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>