More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2765 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2765  multidrug efflux system protein MdtI  100 
 
 		 109 aa  202  8e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.19873  normal  0.0165196 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2019  multidrug efflux system protein MdtI  84.4 
 
 		 109 aa  177  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.993103  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2408  multidrug efflux system protein MdtI  84.4 
 
 		 109 aa  177  4e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00085161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2130  multidrug efflux system protein MdtI  84.4 
 
 		 109 aa  177  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1912  multidrug efflux system protein MdtI  81.65 
 
 		 109 aa  171  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1652  multidrug efflux system protein MdtI  75.23 
 
 		 109 aa  157  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1593  multidrug efflux system protein MdtI  75.23 
 
 		 109 aa  157  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1690  multidrug efflux system protein MdtI  75.23 
 
 		 109 aa  157  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.119702  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1584  multidrug efflux system protein MdtI  75.23 
 
 		 109 aa  157  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.163608 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1857  multidrug efflux system protein MdtI  75.23 
 
 		 109 aa  157  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.915726  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01568  multidrug efflux system transporter  78.9 
 
 		 109 aa  149  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01558  hypothetical protein  78.9 
 
 		 109 aa  149  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2044  small multidrug resistance protein  78.9 
 
 		 109 aa  149  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1785  multidrug efflux system protein MdtI  78.9 
 
 		 109 aa  149  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2309  multidrug efflux system protein MdtI  78.9 
 
 		 109 aa  149  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.924563 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2031  multidrug efflux system protein MdtI  78.9 
 
 		 109 aa  149  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.660204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1673  multidrug efflux system protein MdtI  78.9 
 
 		 109 aa  149  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1806  multidrug efflux system protein MdtI  78.9 
 
 		 109 aa  149  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1600  multidrug efflux system protein MdtI  78.9 
 
 		 109 aa  149  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44530  multidrug efflux system protein MdtI  63.64 
 
 		 109 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.435072 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3793  multidrug efflux system protein MdtI  67.05 
 
 		 109 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0064  small multidrug resistance protein  53.12 
 
 		 110 aa  92  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1813  small multidrug resistance protein  43.75 
 
 		 112 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2061  small multidrug resistance protein  49.46 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0721  small multidrug resistance protein  54.17 
 
 		 80 aa  77.8  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2405  SMR family multidrug efflux pump  41.76 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.308067  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  38.78 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  38.78 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1234  small multidrug resistance protein  39.39 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2350  putative methyl viologen/ethidium resistance transmembrane protein  40.4 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000392235  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001961  spermidine export protein mdtI  43.16 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6952  small multidrug resistance protein  47.96 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00510  cation transporter  42.11 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  36.73 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3228  multidrug efflux protein  37.76 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0308245  hitchhiker  0.000780201 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1774  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  36 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324074  normal  0.0937038 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  43.56 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1835  multidrug transporter EmrE  36 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.997367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1684  multidrug transporter EmrE  36 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487331  normal  0.0413845 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1772  multidrug transporter EmrE  36 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.132035 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0813  multidrug efflux protein  36.73 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.109831  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2036  multidrug efflux protein  36.73 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1603  multidrug efflux protein  36.73 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352426 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4701  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  37.62 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  37.62 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1501  multidrug transporter EmrE  35 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21028  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4057  small multidrug resistance protein  40.43 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.797471  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2304  small multidrug resistance protein  34.86 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.145308 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1957  small multidrug resistance protein  41.76 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.504961 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2946  small multidrug resistance protein  35.71 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00493  multidrug efflux protein  35.71 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1189  SMR family multidrug efflux pump  42.17 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1308  SMR family multidrug efflux pump  42.17 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.907311  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0271  small multidrug resistance protein  36.36 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00498  hypothetical protein  35.71 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.95244  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  34.69 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  34.69 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  35.35 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5038  small multidrug resistance protein  37.76 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0352813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0555  SMR family multidrug efflux pump  40.96 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  34.69 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0377  small multidrug resistance protein  35.35 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  34.69 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2787  small multidrug resistance protein  40.4 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0231795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3102  small multidrug resistance protein  36.73 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  34.34 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  34.34 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  34.69 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  33.67 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0657  small multidrug resistance protein  35.35 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2204  small multidrug resistance protein  38.75 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.148347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0552  multidrug ABC transporter  38.75 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2603  small multidrug resistance protein  34.69 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0118  small multidrug resistance protein  40.59 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1437  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0731  small multidrug efflux pump  33.66 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0986  small multidrug resistance protein  36.7 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1196  small multidrug resistance protein  37.76 
 
 		 122 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0871  small multidrug resistance protein  35.29 
 
 		 114 aa  62  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  31.31 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  38.78 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3425  small multidrug resistance protein  34.34 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681644  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3009  small multidrug resistance protein  35.64 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1914  small multidrug resistance protein  35.64 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  35.71 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1804  multidrug resistance protein, SMR family protein  35.64 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2208  quaternary ammonium compound-resistance protein  35.64 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.831863  normal  0.342211 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0159  multidrug efflux transporter  33.33 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0763675  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1884  small multidrug resistance protein  38.78 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0730  small multidrug resistance protein  34.78 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06909  hypothetical protein  35 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1361  small multidrug resistance protein  43 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1584  multidrug efflux protein  38.14 
 
 		 153 aa  60.1  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.339035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1088  small multidrug resistance protein  31.68 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1617  small multidrug resistance protein  32.65 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3008  small multidrug resistance protein  32.41 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0339  small multidrug resistance protein  36 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4225  small multidrug resistance protein  32.32 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.023296 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>