97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1265 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1265  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 104 aa  195  2.0000000000000003e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0308  small multidrug resistance protein  33.65 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0296  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  31.73 
 
 		 107 aa  52.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0328  SMR family multidrug efflux pump  31.73 
 
 		 107 aa  52.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3229  hypothetical protein  28.28 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.995435  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0300  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  31.73 
 
 		 107 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0313  SMR family multidrug efflux pump  31.73 
 
 		 107 aa  52.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  34.62 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  35.35 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0360  multidrug resistance protein, Smr family  31.73 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0402  multidrug resistance protein, Smr family  32.69 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0151896  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0374  multidrug resistance protein, Smr family  31.73 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4946  multidrug resistance protein, Smr family  31.73 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0357  SMR family multidrug efflux pump  31.73 
 
 		 107 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0307  small multidrug resistance protein  34.31 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1911  multidrug efflux system protein MdtJ  29.7 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  34.58 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3791  putative drug efflux transporter  29.13 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.773212  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2196  small multidrug resistance protein  28.57 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.241986 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44520  putative drug efflux transporter  28.16 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.44142 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3729  transporter protein  33.33 
 
 		 118 aa  47.8  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000221526  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0826  hypothetical protein  35.11 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0062  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  31.78 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.766173 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0437  small multidrug resistance protein  38.81 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.453624  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3425  small multidrug resistance protein  25.25 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681644  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0271  small multidrug resistance protein  27.27 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1786  multidrug efflux system protein MdtJ  28 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5038  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0352813  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01569  multidrug efflux system transporter  28 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3637  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.700642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1599  multidrug efflux system protein MdtJ  28 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.62917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2030  multidrug efflux system protein MdtJ  28 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.712996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1807  multidrug efflux system protein MdtJ  28 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1674  multidrug efflux system protein MdtJ  28 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2043  small multidrug resistance protein  28 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.899542  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1774  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  27.08 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324074  normal  0.0937038 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01559  hypothetical protein  28 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0159  multidrug efflux transporter  24.24 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0763675  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1826  small multidrug resistance protein  32.04 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273746  normal  0.470725 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00740  multidrug efflux SMR transporter  32.86 
 
 		 90 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3077  small multidrug resistance protein  36.67 
 
 		 106 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2310  multidrug efflux system protein MdtJ  28 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3289  small multidrug resistance protein  38.16 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1835  multidrug transporter EmrE  27.08 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.997367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0488  small multidrug resistance protein  28.57 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0280081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1684  multidrug transporter EmrE  27.08 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487331  normal  0.0413845 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0451  small multidrug resistance protein  26.96 
 
 		 116 aa  45.1  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.580088  hitchhiker  0.00482726 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2966  hypothetical protein  35.21 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1772  multidrug transporter EmrE  27.08 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.132035 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1501  multidrug transporter EmrE  26.04 
 
 		 112 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21028  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4225  small multidrug resistance protein  25.25 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.023296 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1437  small multidrug resistance protein  28.28 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0150  quaternary ammonium compound-resistance protein QacEdelta1  37.04 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.928712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1651  multidrug efflux system protein MdtJ  26.47 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0172  small multidrug resistance protein  34.38 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1592  multidrug efflux system protein MdtJ  26.47 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.999303 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1858  multidrug efflux system protein MdtJ  26.47 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.636253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1583  multidrug efflux system protein MdtJ  26.47 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.159233 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1691  multidrug efflux system protein MdtJ  26.47 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.190656  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1584  multidrug efflux protein  35.29 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.339035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2476  transporter  29.91 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000067585  decreased coverage  0.00107573 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  27.88 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1769  small multidrug resistance protein  28.43 
 
 		 109 aa  42.7  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2787  small multidrug resistance protein  36.23 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0231795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  34.43 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3009  small multidrug resistance protein  32.79 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  27.88 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  26 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0118  small multidrug resistance protein  36.11 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  34.43 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2512  small multidrug resistance protein  35.82 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2766  small multidrug resistance protein  25.74 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.131803  normal  0.0168064 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0377  small multidrug resistance protein  26.26 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  32.79 
 
 		 120 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  32.79 
 
 		 120 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1638  efflux-multidrug resistance protein  28.28 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.381762  hitchhiker  0.000000419533 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0718  small multidrug resistance protein  33.87 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1516  small multidrug resistance protein  38.89 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2325  small multidrug resistance protein  36.67 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2020  multidrug resistance protein MdtJ  26.17 
 
 		 147 aa  41.2  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.993103  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2409  multidrug resistance protein MdtJ  26.17 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00258719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2131  small multidrug resistance protein  26.17 
 
 		 147 aa  41.2  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1804  multidrug resistance protein, SMR family protein  34.85 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2208  quaternary ammonium compound-resistance protein  34.85 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.831863  normal  0.342211 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1914  small multidrug resistance protein  34.85 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4701  small multidrug resistance protein  34.38 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3353  small multidrug resistance protein  28.87 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2694  hypothetical protein  33.9 
 
 		 108 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0853  hypothetical protein  30.99 
 
 		 139 aa  40.4  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0100048  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  27 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  27 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0801  hypothetical protein  30.99 
 
 		 159 aa  40.4  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.351912  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1649  DMT family permease  29.41 
 
 		 290 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.799428  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5060  transporter  30.09 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5055  transporter  30.09 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539508  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1866  hypothetical protein  29.41 
 
 		 290 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1259  putative small multidrug resistance transmembrane protein  25.93 
 
 		 123 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627101  normal  0.60267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>