125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2141 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2141  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
327 aa  631  1e-180  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.735788  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05355  hypothetical protein  31.07 
 
 
308 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000531  permease  30.03 
 
 
308 aa  133  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4055  hypothetical protein  31.94 
 
 
318 aa  120  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0849  hypothetical protein  29.35 
 
 
288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.98 
 
 
301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162538  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1093  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.51 
 
 
301 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.728348  normal  0.207927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2974  hypothetical protein  31.27 
 
 
319 aa  97.4  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5086  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.53 
 
 
338 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3071  hypothetical protein  34.35 
 
 
311 aa  93.2  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0374727  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5155  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.31 
 
 
327 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.79 
 
 
303 aa  87.8  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0367363  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3280  hypothetical protein  26.1 
 
 
305 aa  84  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.280639  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0190  hypothetical protein  29.8 
 
 
321 aa  82  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2661  hypothetical protein  33.56 
 
 
299 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0546751  normal  0.338735 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0776  integral membrane protein  26.48 
 
 
281 aa  78.2  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2255  hypothetical protein  27.3 
 
 
291 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  29.47 
 
 
313 aa  74.7  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2900  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.19 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.554893  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1593  hypothetical protein  27.8 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0905154  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.48 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.92 
 
 
291 aa  67  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.66 
 
 
317 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  25.1 
 
 
303 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  27.99 
 
 
296 aa  62.8  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  25.1 
 
 
303 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  30.4 
 
 
308 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8133  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.38 
 
 
314 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  24.52 
 
 
303 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  30.4 
 
 
308 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  24.44 
 
 
303 aa  61.2  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0193  hypothetical protein  28.71 
 
 
305 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.677346 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1447  hypothetical protein  26.13 
 
 
299 aa  60.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1383  hypothetical protein  29.89 
 
 
308 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  24.44 
 
 
303 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  24.71 
 
 
303 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  24.32 
 
 
303 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  27.19 
 
 
329 aa  58.5  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  23.38 
 
 
303 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  23.7 
 
 
303 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  27.65 
 
 
310 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  23.7 
 
 
303 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3496  hypothetical protein  23.89 
 
 
306 aa  57.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.366073 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  32.22 
 
 
286 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  29.28 
 
 
307 aa  56.6  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  26.48 
 
 
331 aa  55.8  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  26.69 
 
 
311 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0513  hypothetical protein  31.25 
 
 
168 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.91 
 
 
309 aa  54.3  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  24.81 
 
 
302 aa  53.1  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.6 
 
 
286 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  27.8 
 
 
310 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55720  hypothetical protein  27.31 
 
 
296 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  23.08 
 
 
305 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  23.25 
 
 
312 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3611  hypothetical protein  27.83 
 
 
312 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0603638  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  26.01 
 
 
310 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  27.17 
 
 
274 aa  50.8  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.01 
 
 
310 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  27.41 
 
 
310 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  26.07 
 
 
311 aa  50.4  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3550  hypothetical protein  25.68 
 
 
310 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3503  hypothetical protein  23.13 
 
 
307 aa  50.1  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.88 
 
 
310 aa  50.1  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  25.38 
 
 
296 aa  50.1  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3820  hypothetical protein  28.86 
 
 
308 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0953  hypothetical protein  25.08 
 
 
310 aa  49.3  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100703  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001333  hypothetical protein  25.74 
 
 
301 aa  49.3  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000132961  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  26.12 
 
 
301 aa  49.3  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25 
 
 
315 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1472  DMT family permease  22.71 
 
 
296 aa  48.5  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00237302  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3425  hypothetical protein  25.68 
 
 
310 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3157  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.79 
 
 
307 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  27.18 
 
 
310 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  26.33 
 
 
345 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3662  hypothetical protein  27.59 
 
 
303 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.186688 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.06 
 
 
305 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0897  hypothetical protein  25.71 
 
 
278 aa  47.4  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.631213  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 
314 aa  47.8  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2478  hypothetical protein  25.73 
 
 
304 aa  47  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  27.72 
 
 
296 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  24.54 
 
 
300 aa  47  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1462  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 
333 aa  47  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3558  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.57 
 
 
297 aa  46.2  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.23 
 
 
286 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  23.46 
 
 
301 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02196  hypothetical protein  25.59 
 
 
297 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  22.87 
 
 
309 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  28.85 
 
 
308 aa  45.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.45 
 
 
302 aa  45.8  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05223  hypothetical protein  25 
 
 
305 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.29 
 
 
310 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0581  hypothetical protein  24.45 
 
 
280 aa  45.4  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.43 
 
 
289 aa  45.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.33 
 
 
310 aa  45.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1550  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.06 
 
 
315 aa  45.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.213106  normal  0.0477313 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.83 
 
 
301 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1842  DMT family permease  29.44 
 
 
324 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4854  hypothetical protein  27.01 
 
 
296 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  28.92 
 
 
299 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>