117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0776 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0776  integral membrane protein  100 
 
 		 281 aa  556  1e-157  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3496  hypothetical protein  41.04 
 
 		 306 aa  219  6e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.366073 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3503  hypothetical protein  37.28 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0849  hypothetical protein  28.21 
 
 		 288 aa  119  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1593  hypothetical protein  32.8 
 
 		 305 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0905154  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.74 
 
 		 310 aa  115  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2255  hypothetical protein  31.21 
 
 		 291 aa  113  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2974  hypothetical protein  29.3 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2900  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.92 
 
 		 300 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.554893  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5155  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.21 
 
 		 327 aa  87  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0193  hypothetical protein  27.53 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.677346 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2661  hypothetical protein  25.8 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0546751  normal  0.338735 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.33 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3071  hypothetical protein  26.71 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0374727  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  27.15 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.67 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0367363  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1093  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.16 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.728348  normal  0.207927 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3280  hypothetical protein  25.18 
 
 		 305 aa  68.9  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.280639  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4055  hypothetical protein  25.09 
 
 		 318 aa  68.9  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5086  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.56 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 		 291 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  25.18 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  24.5 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  24.82 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05355  hypothetical protein  25.1 
 
 		 308 aa  62.4  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  23.32 
 
 		 329 aa  62  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4910  hypothetical protein  24.82 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000131826 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  25.81 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.7 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3338  hypothetical protein  24.73 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  25.26 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  25.76 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  23.61 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2141  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.86 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.735788  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001333  hypothetical protein  24.21 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000132961  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0190  hypothetical protein  22.71 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.21 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05223  hypothetical protein  24.21 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0367  hypothetical protein  32.58 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00833341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1524  hypothetical protein  32.58 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  23.47 
 
 		 302 aa  52.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1447  hypothetical protein  24.64 
 
 		 299 aa  52.8  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.26 
 
 		 292 aa  52.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55720  hypothetical protein  24.01 
 
 		 296 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  24.12 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0925  hypothetical protein  25.27 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0960  hypothetical protein  24.91 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.734629  normal  0.602427 
 
 
-
 
NC_003296  RS02196  hypothetical protein  24.37 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  24.55 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000531  permease  21.4 
 
 		 308 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4645  hypothetical protein  25.27 
 
 		 297 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430538  normal  0.037772 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  24.42 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2227  hypothetical protein  26.57 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000184555  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  22.81 
 
 		 310 aa  50.4  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  23.96 
 
 		 303 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  23.96 
 
 		 303 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  23.96 
 
 		 303 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  23.47 
 
 		 303 aa  50.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0926  hypothetical protein  26.43 
 
 		 295 aa  49.7  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  25.17 
 
 		 295 aa  49.7  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  23.96 
 
 		 303 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  23.29 
 
 		 293 aa  49.3  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1415  integral membrane protein  31.5 
 
 		 305 aa  49.3  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.123619  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  23.96 
 
 		 303 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  24.89 
 
 		 299 aa  48.9  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0924  hypothetical protein  25.27 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  23.5 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  23.5 
 
 		 303 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.4 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  24.2 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4453  hypothetical protein  24.26 
 
 		 296 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309026 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4919  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.23 
 
 		 297 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3842  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.23 
 
 		 297 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.319423 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4854  hypothetical protein  24.73 
 
 		 296 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.22 
 
 		 305 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.22 
 
 		 305 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.38 
 
 		 301 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08620  predicted permease, DMT superfamily  23.37 
 
 		 307 aa  46.6  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  24.89 
 
 		 299 aa  46.2  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3558  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.2 
 
 		 297 aa  46.2  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.18 
 
 		 297 aa  46.2  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  21.55 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3381  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.56 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0614  hypothetical protein  25 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.33 
 
 		 289 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1205  hypothetical protein  24.24 
 
 		 317 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0875949  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2362  hypothetical protein  30.26 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483253  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0987  protein of unknown function DUF6 transmembrane  19.78 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1277  hypothetical protein  25 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.507228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3454  hypothetical protein  26.32 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407979  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2803  hypothetical protein  28.03 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6176  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.98 
 
 		 315 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.090411 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.58 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  22.63 
 
 		 303 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  27.04 
 
 		 311 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.87 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1462  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.03 
 
 		 333 aa  43.9  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  25.17 
 
 		 304 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0909  hypothetical protein  26.56 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  25.52 
 
 		 304 aa  43.5  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>