157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5155 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5155  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 327 aa  619  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2974  hypothetical protein  68.23 
 
 		 319 aa  383  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2900  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.21 
 
 		 300 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.554893  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2661  hypothetical protein  43.15 
 
 		 299 aa  162  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0546751  normal  0.338735 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1593  hypothetical protein  38.69 
 
 		 305 aa  152  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0905154  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0849  hypothetical protein  34.86 
 
 		 288 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.79 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1093  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.58 
 
 		 301 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.728348  normal  0.207927 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3280  hypothetical protein  33.45 
 
 		 305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.280639  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3071  hypothetical protein  37.54 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0374727  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0776  integral membrane protein  31.54 
 
 		 281 aa  108  8.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2255  hypothetical protein  29.72 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0193  hypothetical protein  32.41 
 
 		 305 aa  93.6  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.677346 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3496  hypothetical protein  26.13 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.366073 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000531  permease  25.17 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.18 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0367363  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.75 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3503  hypothetical protein  26.78 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4055  hypothetical protein  32.06 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2141  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.79 
 
 		 327 aa  77  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.735788  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05355  hypothetical protein  26.55 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5086  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.92 
 
 		 338 aa  75.1  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.48 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  30.1 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.3 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0190  hypothetical protein  28.75 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  30.84 
 
 		 303 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  25.6 
 
 		 274 aa  62.4  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  32.45 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  32.45 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  32.45 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.86 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  30.27 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2402  hypothetical protein  25.5 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  29.59 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  29.59 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  32.08 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  30.24 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1446  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.17 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  29.69 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  28.81 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1550  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.1 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.213106  normal  0.0477313 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.76 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  27.06 
 
 		 331 aa  57  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.12 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.62 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  24.91 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  26.58 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.69 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1956  hypothetical protein  27.65 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  27.71 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.65 
 
 		 309 aa  55.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0513  hypothetical protein  28.47 
 
 		 168 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  29.39 
 
 		 293 aa  55.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  27.5 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4618  hypothetical protein  26.32 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139965 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2183  hypothetical protein  30.8 
 
 		 314 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  24.68 
 
 		 305 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  28.17 
 
 		 312 aa  53.5  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  28.32 
 
 		 308 aa  53.5  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  23.59 
 
 		 309 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  26.09 
 
 		 305 aa  52.8  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1262  hypothetical protein  29.25 
 
 		 300 aa  52.8  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.12197 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  23.76 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1695  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.91 
 
 		 314 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.173483  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  26.28 
 
 		 320 aa  52.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  27.07 
 
 		 295 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2739  permease, drug/metabolite transporter superfamily  23.76 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000046973  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1766  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.91 
 
 		 314 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.548508  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  27.43 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08620  predicted permease, DMT superfamily  24.89 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  29.44 
 
 		 345 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1084  hypothetical protein  31.48 
 
 		 299 aa  50.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.29 
 
 		 287 aa  50.4  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  27.59 
 
 		 299 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  26.19 
 
 		 304 aa  50.1  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  27.01 
 
 		 299 aa  49.7  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  29.13 
 
 		 311 aa  50.1  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  28.81 
 
 		 294 aa  49.7  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  26.43 
 
 		 310 aa  49.7  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3740  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.77 
 
 		 305 aa  49.7  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  29.52 
 
 		 301 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.23 
 
 		 291 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3580  hypothetical protein  30.33 
 
 		 294 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122357  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.11 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  27.18 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  27.53 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0191207 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2091  hypothetical protein  26.1 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1867  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.25 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  22.81 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  27.6 
 
 		 329 aa  48.5  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  26.02 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.06 
 
 		 291 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  27.47 
 
 		 313 aa  48.1  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.06 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  26.67 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5389  hypothetical protein  30.94 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7634  DMT family permease  23.39 
 
 		 317 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0332  hypothetical protein  23.79 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.156874  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0350  hypothetical protein  23.79 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>