More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1262 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1262  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  563  1e-160  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.12197 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0897  hypothetical protein  58.67 
 
 		 278 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.631213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0316  hypothetical protein  52.19 
 
 		 281 aa  248  9e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.238675  normal  0.667988 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  31.72 
 
 		 293 aa  96.3  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  27.14 
 
 		 297 aa  94  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.08 
 
 		 292 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  26.6 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  30.64 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.11 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  27.18 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.26 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0953  hypothetical protein  28.62 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100703  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1857  hypothetical protein  26.48 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.943988  normal  0.125772 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  22.36 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2183  hypothetical protein  34.68 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  28.94 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.62 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.66 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1695  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.78 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.173483  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  24.73 
 
 		 303 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  25.37 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  25.37 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  27.6 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1766  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.78 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.548508  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  25 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  25 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  23.94 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  28.82 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3425  hypothetical protein  29.02 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  25 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  25 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  25 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.1 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  24.63 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  24.63 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  31.95 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3550  hypothetical protein  28.67 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2701  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.12 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  23.86 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  30.99 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.3 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  22.58 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.16 
 
 		 309 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  29.7 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.16 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  31.67 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  26.7 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  25 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.95 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3662  hypothetical protein  32.29 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186688 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  31.94 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  22.18 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  27.61 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  28.99 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  23.05 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  29.67 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.05 
 
 		 307 aa  68.9  0.00000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  22.18 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1370  hypothetical protein  29.47 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  22.49 
 
 		 303 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  22.49 
 
 		 303 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3233  hypothetical protein  30 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1277  hypothetical protein  28.9 
 
 		 310 aa  68.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.507228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  23.18 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  23.63 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.56 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  22.18 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  22.37 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  22.84 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  22.37 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  29.18 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  22.84 
 
 		 303 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.68 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  29.82 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4228  drug/metabolite exporter family protein  22.91 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  26.87 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  24.79 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.86 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  27.05 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  30.32 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.06 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0334  hypothetical protein  28.57 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  29.35 
 
 		 345 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1521  hypothetical protein  24.03 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.851073  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0919  hypothetical protein  21.76 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  24.01 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  29.58 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3740  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.17 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2723  hypothetical protein  24.34 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0916  Fis family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 93 aa  65.1  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4605  transporter, EamA family  22.55 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4387  EamA family protein  22.55 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  23.79 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4726  eama family protein  22.55 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.58 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.86 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00477347 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4240  drug/metabolite exporter family protein  22.55 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.84 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  27.63 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>