19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0916 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0916  Fis family transcriptional regulator  100 
 
 
93 aa  179  8.000000000000001e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0897  hypothetical protein  48.91 
 
 
278 aa  80.5  0.000000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.631213  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1262  hypothetical protein  47.13 
 
 
300 aa  65.1  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.12197 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0316  hypothetical protein  49.23 
 
 
281 aa  58.5  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.238675  normal  0.667988 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.93 
 
 
317 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  36.84 
 
 
294 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0112  hypothetical protein  39.13 
 
 
298 aa  47.4  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0251  hypothetical protein  34.21 
 
 
305 aa  44.7  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0391  hypothetical protein  35.14 
 
 
331 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  32.32 
 
 
293 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.03 
 
 
340 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00182068 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.86 
 
 
309 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000255385 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 
307 aa  41.2  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  42.86 
 
 
293 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  36.11 
 
 
297 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  31.33 
 
 
301 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1368  hypothetical protein  33.33 
 
 
306 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.496352  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  36.9 
 
 
319 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 
309 aa  40  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>