79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3280 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3280  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.280639  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2900  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.55 
 
 		 300 aa  132  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.554893  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2661  hypothetical protein  39.85 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0546751  normal  0.338735 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1593  hypothetical protein  35.94 
 
 		 305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0905154  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4055  hypothetical protein  34.55 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0849  hypothetical protein  32.72 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000531  permease  31.9 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05355  hypothetical protein  31.58 
 
 		 308 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2974  hypothetical protein  31.67 
 
 		 319 aa  115  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5155  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.45 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0193  hypothetical protein  34.47 
 
 		 305 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.677346 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0190  hypothetical protein  31.54 
 
 		 321 aa  93.6  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5086  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.3 
 
 		 338 aa  92.4  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2255  hypothetical protein  29.17 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3496  hypothetical protein  27.05 
 
 		 306 aa  88.6  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.366073 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.01 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1093  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.52 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.728348  normal  0.207927 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3503  hypothetical protein  25.45 
 
 		 307 aa  80.1  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.66 
 
 		 303 aa  79  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0367363  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.03 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3071  hypothetical protein  33.83 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0374727  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0776  integral membrane protein  25.18 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1084  hypothetical protein  28.46 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  27.24 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2141  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.17 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.735788  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0513  hypothetical protein  28.47 
 
 		 168 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  26.88 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4910  hypothetical protein  26.88 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000131826 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  28.78 
 
 		 297 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  27.94 
 
 		 302 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  27.07 
 
 		 299 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  27.07 
 
 		 299 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  27.07 
 
 		 299 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  27.84 
 
 		 302 aa  52.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  26.58 
 
 		 345 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  27.94 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1447  hypothetical protein  24.91 
 
 		 299 aa  52.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  27.94 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.26 
 
 		 291 aa  50.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6147  hypothetical protein  30.26 
 
 		 299 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5782  hypothetical protein  30.26 
 
 		 299 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  27.84 
 
 		 302 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.7 
 
 		 291 aa  49.7  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  25 
 
 		 313 aa  49.3  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  26.24 
 
 		 299 aa  48.9  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2630  hypothetical protein  27.23 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.815333 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6627  hypothetical protein  29.74 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  26.42 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1447  hypothetical protein  30.77 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000141757  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.17 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1950  hypothetical protein  24.91 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.24178  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  26.67 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  27 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  29.9 
 
 		 314 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4618  hypothetical protein  27.43 
 
 		 286 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  24.27 
 
 		 309 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.73 
 
 		 292 aa  47  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  25.82 
 
 		 329 aa  46.6  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.16 
 
 		 309 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.07 
 
 		 286 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3558  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.52 
 
 		 297 aa  46.2  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  30.41 
 
 		 328 aa  45.8  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  25.87 
 
 		 293 aa  45.8  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  25.24 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  26.96 
 
 		 311 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  25.57 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  27.68 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05223  hypothetical protein  26.04 
 
 		 305 aa  43.9  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0301  hypothetical protein  25 
 
 		 341 aa  43.5  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  27.45 
 
 		 325 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7691  hypothetical protein  30.05 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.327195 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4645  hypothetical protein  27.24 
 
 		 297 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430538  normal  0.037772 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.78 
 
 		 309 aa  43.5  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.32 
 
 		 320 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  26.51 
 
 		 306 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  24.76 
 
 		 309 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  25.77 
 
 		 308 aa  42.7  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  25.64 
 
 		 297 aa  42.7  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  25.36 
 
 		 286 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>