67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3151 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 303 aa  558  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0367363  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0849  hypothetical protein  40.07 
 
 		 288 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.93 
 
 		 301 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1093  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.56 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.728348  normal  0.207927 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3071  hypothetical protein  42.2 
 
 		 311 aa  142  7e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0374727  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4055  hypothetical protein  36.46 
 
 		 318 aa  129  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000531  permease  34.15 
 
 		 308 aa  115  7.999999999999999e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05355  hypothetical protein  34.01 
 
 		 308 aa  112  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0193  hypothetical protein  33.97 
 
 		 305 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.677346 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2255  hypothetical protein  31.27 
 
 		 291 aa  98.2  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3280  hypothetical protein  34.66 
 
 		 305 aa  96.7  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.280639  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5086  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.12 
 
 		 338 aa  94.7  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0190  hypothetical protein  33.2 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2974  hypothetical protein  32.89 
 
 		 319 aa  92.4  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2900  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.46 
 
 		 300 aa  87  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.554893  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34 
 
 		 310 aa  82.4  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5155  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.18 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1593  hypothetical protein  31.62 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0905154  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0776  integral membrane protein  23.67 
 
 		 281 aa  75.5  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2661  hypothetical protein  33.58 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0546751  normal  0.338735 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3503  hypothetical protein  24.34 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2141  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.55 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.735788  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3496  hypothetical protein  24.11 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.366073 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  28.98 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.18 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2803  hypothetical protein  29.56 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0513  hypothetical protein  32.06 
 
 		 168 aa  53.1  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  22.69 
 
 		 309 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6431  hypothetical protein  32.56 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.275967  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3809  integral membrane protein  25.84 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.770617  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1462  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.13 
 
 		 333 aa  50.8  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3338  hypothetical protein  29.06 
 
 		 309 aa  50.1  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.53 
 
 		 305 aa  49.7  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689039  normal  0.0602464 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  28.06 
 
 		 304 aa  49.7  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.83 
 
 		 314 aa  49.7  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  20.82 
 
 		 312 aa  49.3  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.52 
 
 		 305 aa  49.3  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00477347 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  31.32 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.81 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6176  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 315 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.090411 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1956  hypothetical protein  27.17 
 
 		 318 aa  47.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.61 
 
 		 293 aa  47  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  29.17 
 
 		 309 aa  47  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  27.84 
 
 		 308 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.94 
 
 		 306 aa  46.2  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  26.32 
 
 		 300 aa  46.6  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1383  hypothetical protein  27.84 
 
 		 308 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.23 
 
 		 310 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2946  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.72 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  26.09 
 
 		 329 aa  45.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  27.84 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  27.78 
 
 		 335 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4618  hypothetical protein  28.37 
 
 		 316 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139965 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  22.59 
 
 		 287 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2630  hypothetical protein  31.85 
 
 		 309 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.815333 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0514  hypothetical protein  30.69 
 
 		 141 aa  43.5  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  26.12 
 
 		 308 aa  43.9  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  27.1 
 
 		 313 aa  43.5  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0515  hypothetical protein  30.47 
 
 		 301 aa  43.5  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.04 
 
 		 299 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0367  hypothetical protein  29.94 
 
 		 305 aa  43.1  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00833341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1524  hypothetical protein  29.94 
 
 		 305 aa  43.1  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.94 
 
 		 325 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0960  hypothetical protein  25.31 
 
 		 296 aa  42.7  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.734629  normal  0.602427 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  28.72 
 
 		 308 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0925  hypothetical protein  25.31 
 
 		 296 aa  42.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.83 
 
 		 289 aa  42.4  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>