78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3496 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3496  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  607  1e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.366073 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3503  hypothetical protein  49.67 
 
 		 307 aa  302  6.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0776  integral membrane protein  41.73 
 
 		 281 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0849  hypothetical protein  28.42 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000531  permease  28.48 
 
 		 308 aa  106  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05355  hypothetical protein  28.57 
 
 		 308 aa  102  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1593  hypothetical protein  29.11 
 
 		 305 aa  94  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0905154  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2900  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.41 
 
 		 300 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.554893  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2974  hypothetical protein  27.53 
 
 		 319 aa  91.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3280  hypothetical protein  27.05 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.280639  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2661  hypothetical protein  27.94 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0546751  normal  0.338735 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5155  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.28 
 
 		 327 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2255  hypothetical protein  26.95 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3071  hypothetical protein  33.61 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0374727  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0193  hypothetical protein  25.7 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.677346 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  26.55 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4055  hypothetical protein  26.94 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.58 
 
 		 301 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5086  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.31 
 
 		 338 aa  67.4  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.66 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0367363  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1093  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.9 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.728348  normal  0.207927 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  29.81 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  27.35 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08620  predicted permease, DMT superfamily  25.45 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  24.81 
 
 		 310 aa  58.9  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  28.3 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  27.27 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0190  hypothetical protein  25.42 
 
 		 321 aa  53.5  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  27.06 
 
 		 301 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.73 
 
 		 304 aa  51.2  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0514  hypothetical protein  29.84 
 
 		 141 aa  50.4  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  27.39 
 
 		 319 aa  50.1  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001333  hypothetical protein  31.36 
 
 		 301 aa  49.7  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000132961  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  25.36 
 
 		 294 aa  49.7  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  22.71 
 
 		 308 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0987  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.44 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1111  hypothetical protein  28.64 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0371  hypothetical protein  25.76 
 
 		 315 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0749298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3558  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.23 
 
 		 297 aa  47.8  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  24.32 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  25.08 
 
 		 322 aa  47  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.88 
 
 		 301 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.36 
 
 		 305 aa  46.6  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.01 
 
 		 291 aa  46.2  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  25 
 
 		 300 aa  46.2  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  24.83 
 
 		 294 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  24.44 
 
 		 305 aa  45.8  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  23.57 
 
 		 329 aa  45.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  23.97 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.23 
 
 		 325 aa  45.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.81 
 
 		 317 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  23.53 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.27 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1230  hypothetical protein  27.84 
 
 		 315 aa  45.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.112754 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3393  transporter, EamA family  25.17 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4910  hypothetical protein  24.73 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000131826 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2617  hypothetical protein  25.1 
 
 		 325 aa  44.3  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.387385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  23.97 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  23.97 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  23.15 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  23.97 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2686  transporter, EamA family  25.93 
 
 		 304 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000188959 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1853  transporter, EamA family  24.83 
 
 		 294 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  23.45 
 
 		 306 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  24.01 
 
 		 293 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1447  hypothetical protein  26.97 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  25.19 
 
 		 303 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  23.99 
 
 		 309 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.57 
 
 		 310 aa  43.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  23.33 
 
 		 313 aa  43.5  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  25.19 
 
 		 303 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  23.05 
 
 		 311 aa  43.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4331  hypothetical protein  28.25 
 
 		 316 aa  42.7  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.33 
 
 		 283 aa  42.7  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  23.66 
 
 		 293 aa  42.7  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6176  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.32 
 
 		 315 aa  42.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.090411 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2469  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.99 
 
 		 293 aa  42.4  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>