109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1831 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1831  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  678    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2134  hypothetical protein  90.98 
 
 
354 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0818  hypothetical protein  90.98 
 
 
354 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0404  hypothetical protein  97.84 
 
 
327 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1474  hypothetical protein  97.6 
 
 
277 aa  332  8e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0501  hypothetical protein  97.6 
 
 
277 aa  332  8e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.777031  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2117  hypothetical protein  86.79 
 
 
292 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107207  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3366  hypothetical protein  67.01 
 
 
278 aa  263  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0286  hypothetical protein  62.26 
 
 
293 aa  248  9e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4709  hypothetical protein  61.04 
 
 
278 aa  245  8e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328299  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4620  hypothetical protein  62.89 
 
 
278 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.331328 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4911  hypothetical protein  60.61 
 
 
278 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3007  hypothetical protein  60.61 
 
 
278 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.558663  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5359  hypothetical protein  60.61 
 
 
278 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5239  hypothetical protein  61.04 
 
 
278 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0836  hypothetical protein  62.57 
 
 
278 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4521  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60.89 
 
 
278 aa  223  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2841  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.78 
 
 
306 aa  161  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2290  hypothetical protein  47.78 
 
 
275 aa  155  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.825928 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.94 
 
 
277 aa  143  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0296573  normal  0.100068 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.94 
 
 
277 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3416  hypothetical protein  39.56 
 
 
276 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4193  putative 10 TMS drug/metabolite exporter, DME family, DMT superfamily  46.11 
 
 
280 aa  124  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0556115 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2218  hypothetical protein  40.59 
 
 
278 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0823132  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5892  hypothetical protein  42.49 
 
 
280 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.29 
 
 
281 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.632965 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0011  hypothetical protein  42.55 
 
 
280 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0566  DMT family permease  42.46 
 
 
278 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.7079  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0071  integral membrane protein  44.27 
 
 
278 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.13911  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1570  hypothetical protein  44.27 
 
 
278 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232738  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1482  hypothetical protein  44.27 
 
 
278 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.133803  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4271  hypothetical protein  43.78 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.564552  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5275  hypothetical protein  41.18 
 
 
277 aa  116  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2138  hypothetical protein  38.2 
 
 
280 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.186321  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1099  hypothetical protein  38.24 
 
 
281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.112723 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2940  hypothetical protein  40.31 
 
 
280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0704111  hitchhiker  0.00163659 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0865  hypothetical protein  37.93 
 
 
295 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0566496  normal  0.513013 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4973  hypothetical protein  39.69 
 
 
277 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4846  hypothetical protein  39.69 
 
 
277 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0252834  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.65 
 
 
278 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570084  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4689  hypothetical protein  40.58 
 
 
285 aa  112  9e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673663  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5022  hypothetical protein  39.69 
 
 
277 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0498  hypothetical protein  39.89 
 
 
303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146008  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1930  putative integral membrane protein DUF6  40.1 
 
 
279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211906  hitchhiker  0.0000000927699 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0492  hypothetical protein  38.76 
 
 
277 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4020  hypothetical protein  42.05 
 
 
285 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.799358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4347  hypothetical protein  42.05 
 
 
285 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1326  putative permease protein  36.79 
 
 
278 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182128  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3717  hypothetical protein  36.05 
 
 
283 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657811  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3474  DMT family permease  41.67 
 
 
280 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3577  hypothetical protein  40.74 
 
 
284 aa  107  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0706  hypothetical protein  38.62 
 
 
281 aa  106  7e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.93 
 
 
286 aa  106  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6007  hypothetical protein  40.66 
 
 
287 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2580  hypothetical protein  37.04 
 
 
281 aa  104  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4007  integral membrane protein  34.43 
 
 
286 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4078  integral membrane protein  34.43 
 
 
286 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4128  integral membrane protein  34.43 
 
 
286 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4023  integral membrane protein  34.43 
 
 
286 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1673  hypothetical protein  40.84 
 
 
303 aa  103  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0779725  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0697  hypothetical protein  38.1 
 
 
281 aa  102  9e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3756  hypothetical protein  42.31 
 
 
285 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.83129  normal  0.119763 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4186  integral membrane protein  34.45 
 
 
277 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5358  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.71 
 
 
279 aa  99  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.961807  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3337  hypothetical protein  38.38 
 
 
281 aa  97.1  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07010  hypothetical protein  37.04 
 
 
276 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0642  hypothetical protein  36.41 
 
 
276 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4230  hypothetical protein  43.28 
 
 
251 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.220159  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0532  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.88 
 
 
273 aa  86.3  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0613856  normal  0.397799 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3089  hypothetical protein  40.78 
 
 
280 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3629  hypothetical protein  36.78 
 
 
293 aa  84  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.539858  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1215  hypothetical protein  31.4 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5448  hypothetical protein  33.51 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.12 
 
 
293 aa  76.6  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0881  hypothetical protein  36.46 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.443506  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0810  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.91 
 
 
293 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1842  drug/metabolite exporter (DME) family protein  29.73 
 
 
301 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.129137  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0491  hypothetical protein  29.73 
 
 
301 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.177704  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2724  hypothetical protein  29.53 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.35059  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0500  hypothetical protein  97.14 
 
 
47 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.94976  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0631  hypothetical protein  31.96 
 
 
301 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.945692 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1927  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.67 
 
 
277 aa  71.6  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.642083  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0997  hypothetical protein  41.23 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5906  hypothetical protein  32.16 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29520  membrane protein  41.21 
 
 
282 aa  68.9  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3941  hypothetical protein  39.19 
 
 
280 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.177323  normal  0.483872 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0402  hypothetical protein  94.29 
 
 
46 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.87941  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1129  hypothetical protein  34.68 
 
 
288 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.475409 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1761  hypothetical protein  34.43 
 
 
290 aa  65.1  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0150156  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3082  hypothetical protein  40.22 
 
 
277 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3034  hypothetical protein  36.09 
 
 
299 aa  62.4  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1866  hypothetical protein  40 
 
 
290 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1649  DMT family permease  38.94 
 
 
290 aa  60.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.799428  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3482  hypothetical protein  33.33 
 
 
290 aa  60.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.183799 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1941  hypothetical protein  29.57 
 
 
302 aa  60.1  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.192478  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2742  hypothetical protein  28.8 
 
 
308 aa  56.2  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1077  hypothetical protein  41.89 
 
 
297 aa  56.2  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.407086 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2052  hypothetical protein  33.58 
 
 
290 aa  55.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00300116  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2854  hypothetical protein  28.02 
 
 
282 aa  53.9  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2949  hypothetical protein  31.62 
 
 
290 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.191447 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>