111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0011 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0011  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  541  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5892  hypothetical protein  86.43 
 
 
280 aa  480  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3474  DMT family permease  86.43 
 
 
280 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4193  putative 10 TMS drug/metabolite exporter, DME family, DMT superfamily  86.07 
 
 
280 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0556115 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2841  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.93 
 
 
306 aa  231  8.000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.28 
 
 
277 aa  228  6e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0296573  normal  0.100068 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2290  hypothetical protein  48.91 
 
 
275 aa  226  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.825928 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.63 
 
 
277 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3756  hypothetical protein  44.24 
 
 
285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.83129  normal  0.119763 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6007  hypothetical protein  44.04 
 
 
287 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3416  hypothetical protein  42.24 
 
 
276 aa  192  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4020  hypothetical protein  43.07 
 
 
285 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.799358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4347  hypothetical protein  43.07 
 
 
285 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4271  hypothetical protein  44.49 
 
 
285 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.564552  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1673  hypothetical protein  44.16 
 
 
303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0779725  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4521  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.7 
 
 
278 aa  178  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0836  hypothetical protein  41.33 
 
 
278 aa  172  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0286  hypothetical protein  45.22 
 
 
293 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4620  hypothetical protein  39.86 
 
 
278 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.331328 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4230  hypothetical protein  43.32 
 
 
251 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.220159  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3366  hypothetical protein  43.01 
 
 
278 aa  165  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0071  integral membrane protein  42.64 
 
 
278 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.13911  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4709  hypothetical protein  44.12 
 
 
278 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328299  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1570  hypothetical protein  42.64 
 
 
278 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232738  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1482  hypothetical protein  42.64 
 
 
278 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.133803  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2580  hypothetical protein  36.49 
 
 
281 aa  163  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4007  integral membrane protein  37.28 
 
 
286 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4186  integral membrane protein  37.05 
 
 
277 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1099  hypothetical protein  38.99 
 
 
281 aa  159  5e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.112723 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4078  integral membrane protein  37.05 
 
 
286 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4128  integral membrane protein  37.05 
 
 
286 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4023  integral membrane protein  37.05 
 
 
286 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0706  hypothetical protein  35.09 
 
 
281 aa  157  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3577  hypothetical protein  40.36 
 
 
284 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4689  hypothetical protein  38.04 
 
 
285 aa  155  8e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673663  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5239  hypothetical protein  44.85 
 
 
278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0697  hypothetical protein  34.39 
 
 
281 aa  151  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3007  hypothetical protein  44.12 
 
 
278 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.558663  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5359  hypothetical protein  44.12 
 
 
278 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2138  hypothetical protein  38.15 
 
 
280 aa  150  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.186321  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4911  hypothetical protein  43.75 
 
 
278 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.18 
 
 
281 aa  146  5e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.632965 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3089  hypothetical protein  41.91 
 
 
280 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.68 
 
 
286 aa  142  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.51 
 
 
278 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570084  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2117  hypothetical protein  43.17 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107207  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5358  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.26 
 
 
279 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.961807  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0566  DMT family permease  36.03 
 
 
278 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.7079  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3717  hypothetical protein  35.16 
 
 
283 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657811  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2218  hypothetical protein  35.66 
 
 
278 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0823132  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0865  hypothetical protein  36.33 
 
 
295 aa  137  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0566496  normal  0.513013 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1474  hypothetical protein  41.29 
 
 
277 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0501  hypothetical protein  41.29 
 
 
277 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.777031  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0404  hypothetical protein  41.29 
 
 
327 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2134  hypothetical protein  41.29 
 
 
354 aa  135  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0818  hypothetical protein  41.29 
 
 
354 aa  135  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1326  putative permease protein  35.14 
 
 
278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182128  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0532  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.47 
 
 
273 aa  133  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0613856  normal  0.397799 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1930  putative integral membrane protein DUF6  33.94 
 
 
279 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211906  hitchhiker  0.0000000927699 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3337  hypothetical protein  36.61 
 
 
281 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0498  hypothetical protein  34.93 
 
 
303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146008  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2940  hypothetical protein  35.91 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0704111  hitchhiker  0.00163659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4973  hypothetical protein  35.74 
 
 
277 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4846  hypothetical protein  35.74 
 
 
277 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0252834  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5022  hypothetical protein  35.38 
 
 
277 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0492  hypothetical protein  35.48 
 
 
277 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5275  hypothetical protein  34.67 
 
 
277 aa  122  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0642  hypothetical protein  34.78 
 
 
276 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1215  hypothetical protein  30.88 
 
 
300 aa  119  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1927  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.4 
 
 
277 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.642083  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07010  hypothetical protein  33.69 
 
 
276 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5448  hypothetical protein  34.58 
 
 
327 aa  113  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1842  drug/metabolite exporter (DME) family protein  31.79 
 
 
301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.129137  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0491  hypothetical protein  31.79 
 
 
301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.177704  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2724  hypothetical protein  31.41 
 
 
300 aa  108  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.35059  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1941  hypothetical protein  30.5 
 
 
302 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.192478  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1831  hypothetical protein  41.01 
 
 
356 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0810  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.55 
 
 
293 aa  102  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0997  hypothetical protein  37.59 
 
 
286 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0631  hypothetical protein  30.34 
 
 
301 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.945692 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3941  hypothetical protein  32.96 
 
 
280 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.177323  normal  0.483872 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.2 
 
 
293 aa  98.2  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3082  hypothetical protein  34.69 
 
 
277 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3629  hypothetical protein  34.48 
 
 
293 aa  95.5  9e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.539858  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0881  hypothetical protein  32.99 
 
 
303 aa  94.7  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.443506  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3034  hypothetical protein  33.22 
 
 
299 aa  94  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29520  membrane protein  33.58 
 
 
282 aa  92.8  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1761  hypothetical protein  30.58 
 
 
290 aa  87.4  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0150156  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3482  hypothetical protein  33.62 
 
 
290 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.183799 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1866  hypothetical protein  33.48 
 
 
290 aa  86.3  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1649  DMT family permease  33.19 
 
 
290 aa  85.5  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.799428  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1077  hypothetical protein  33.6 
 
 
297 aa  80.1  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.407086 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2949  hypothetical protein  26.78 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0541  hypothetical protein  28.47 
 
 
301 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5906  hypothetical protein  30.99 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1129  hypothetical protein  29.01 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.475409 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2742  hypothetical protein  25.67 
 
 
308 aa  67  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04883  hypothetical protein  25.17 
 
 
301 aa  65.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2854  hypothetical protein  28.94 
 
 
282 aa  58.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1643  hypothetical protein  23.69 
 
 
290 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>