113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0498 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0498  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  586  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146008  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0566  DMT family permease  91.01 
 
 		 278 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.7079  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2218  hypothetical protein  90.29 
 
 		 278 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0823132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1930  putative integral membrane protein DUF6  61.87 
 
 		 279 aa  321  8e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211906  hitchhiker  0.0000000927699 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.13 
 
 		 281 aa  199  6e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.632965 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4689  hypothetical protein  40.65 
 
 		 285 aa  186  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3577  hypothetical protein  43.64 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4271  hypothetical protein  40 
 
 		 285 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.564552  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0706  hypothetical protein  38.21 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4020  hypothetical protein  38.52 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.799358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4347  hypothetical protein  38.52 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1673  hypothetical protein  38.03 
 
 		 303 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0779725  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2580  hypothetical protein  38.57 
 
 		 281 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4186  integral membrane protein  39.07 
 
 		 277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4078  integral membrane protein  38.71 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4128  integral membrane protein  38.71 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4023  integral membrane protein  38.71 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4007  integral membrane protein  38.71 
 
 		 286 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.35 
 
 		 278 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.29 
 
 		 277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0296573  normal  0.100068 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6007  hypothetical protein  37.77 
 
 		 287 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0697  hypothetical protein  37.5 
 
 		 281 aa  162  9e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0532  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.85 
 
 		 273 aa  159  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0613856  normal  0.397799 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2940  hypothetical protein  39.77 
 
 		 280 aa  159  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0704111  hitchhiker  0.00163659 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3717  hypothetical protein  34.69 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657811  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3756  hypothetical protein  39.58 
 
 		 285 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.83129  normal  0.119763 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1326  putative permease protein  38.16 
 
 		 278 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0865  hypothetical protein  35.69 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0566496  normal  0.513013 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1099  hypothetical protein  34.89 
 
 		 281 aa  152  8.999999999999999e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.112723 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.35 
 
 		 277 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3089  hypothetical protein  40 
 
 		 280 aa  149  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0286  hypothetical protein  39.05 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3366  hypothetical protein  37.5 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4709  hypothetical protein  39.42 
 
 		 278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2841  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.2 
 
 		 306 aa  143  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2290  hypothetical protein  33.82 
 
 		 275 aa  142  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.825928 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3007  hypothetical protein  40.15 
 
 		 278 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.558663  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5359  hypothetical protein  40.15 
 
 		 278 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4911  hypothetical protein  39.78 
 
 		 278 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0836  hypothetical protein  36.63 
 
 		 278 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2138  hypothetical protein  34.06 
 
 		 280 aa  138  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.186321  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4620  hypothetical protein  34.51 
 
 		 278 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.331328 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3337  hypothetical protein  37.4 
 
 		 281 aa  135  9e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4521  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.19 
 
 		 278 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5239  hypothetical protein  39.42 
 
 		 278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0011  hypothetical protein  34.93 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07010  hypothetical protein  33.33 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4193  putative 10 TMS drug/metabolite exporter, DME family, DMT superfamily  37.31 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0556115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.63 
 
 		 286 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0642  hypothetical protein  32.96 
 
 		 276 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0997  hypothetical protein  38.97 
 
 		 286 aa  129  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5358  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.5 
 
 		 279 aa  129  8.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.961807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0071  integral membrane protein  38.64 
 
 		 278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.13911  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1570  hypothetical protein  38.64 
 
 		 278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232738  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1482  hypothetical protein  38.64 
 
 		 278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.133803  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0404  hypothetical protein  39.18 
 
 		 327 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2134  hypothetical protein  39.18 
 
 		 354 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0818  hypothetical protein  39.18 
 
 		 354 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3416  hypothetical protein  31.27 
 
 		 276 aa  125  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1474  hypothetical protein  39.18 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0501  hypothetical protein  39.18 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.777031  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3474  DMT family permease  34.62 
 
 		 280 aa  122  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4230  hypothetical protein  39.29 
 
 		 251 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.220159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5892  hypothetical protein  33.58 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3941  hypothetical protein  33.59 
 
 		 280 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.177323  normal  0.483872 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5275  hypothetical protein  32 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1927  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.02 
 
 		 277 aa  117  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.642083  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4973  hypothetical protein  32.17 
 
 		 277 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4846  hypothetical protein  32.17 
 
 		 277 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0252834  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5022  hypothetical protein  31.82 
 
 		 277 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2117  hypothetical protein  37.59 
 
 		 292 aa  112  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107207  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0492  hypothetical protein  30.91 
 
 		 277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29520  membrane protein  34.32 
 
 		 282 aa  105  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2724  hypothetical protein  30.68 
 
 		 300 aa  99.8  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.35059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1842  drug/metabolite exporter (DME) family protein  30.24 
 
 		 301 aa  96.3  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.129137  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0491  hypothetical protein  30.24 
 
 		 301 aa  96.3  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.177704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0631  hypothetical protein  32.35 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.945692 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3082  hypothetical protein  34.15 
 
 		 277 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1831  hypothetical protein  38.32 
 
 		 356 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1215  hypothetical protein  28.51 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5448  hypothetical protein  32.51 
 
 		 327 aa  87  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2854  hypothetical protein  31.69 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3482  hypothetical protein  31.03 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.183799 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1941  hypothetical protein  30.48 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.192478  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3629  hypothetical protein  32.19 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.539858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0810  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.42 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1649  DMT family permease  29.96 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.799428  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1866  hypothetical protein  28.42 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0881  hypothetical protein  32.74 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.443506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1761  hypothetical protein  27.15 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0150156  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.99 
 
 		 286 aa  68.9  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1077  hypothetical protein  32.26 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.407086 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0541  hypothetical protein  29.9 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1643  hypothetical protein  27.37 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04883  hypothetical protein  25.48 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2742  hypothetical protein  25.65 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30570  membrane protein  29.72 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0433  hypothetical protein  30.99 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0468  hypothetical protein  30.99 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.784774  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>