126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5448 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5448  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  640    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0810  protein of unknown function DUF6 transmembrane  74.06 
 
 		 293 aa  431  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3629  hypothetical protein  78.84 
 
 		 293 aa  431  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.539858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0881  hypothetical protein  74.11 
 
 		 303 aa  419  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.443506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  67.24 
 
 		 293 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1077  hypothetical protein  57.14 
 
 		 297 aa  271  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.407086 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1129  hypothetical protein  42.03 
 
 		 288 aa  203  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.475409 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5906  hypothetical protein  44.48 
 
 		 287 aa  183  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3034  hypothetical protein  41.22 
 
 		 299 aa  179  7e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3482  hypothetical protein  43.2 
 
 		 290 aa  172  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.183799 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1761  hypothetical protein  41.44 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0150156  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1649  DMT family permease  42.61 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.799428  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1866  hypothetical protein  42.4 
 
 		 290 aa  155  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30570  membrane protein  38.23 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.1 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2290  hypothetical protein  35.89 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.825928 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2841  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.73 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0011  hypothetical protein  34.58 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4007  integral membrane protein  31.25 
 
 		 286 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4023  integral membrane protein  30.92 
 
 		 286 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4078  integral membrane protein  30.92 
 
 		 286 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4128  integral membrane protein  30.92 
 
 		 286 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4186  integral membrane protein  31.1 
 
 		 277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5892  hypothetical protein  32.77 
 
 		 280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4020  hypothetical protein  33.21 
 
 		 285 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.799358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4347  hypothetical protein  33.21 
 
 		 285 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4689  hypothetical protein  32.57 
 
 		 285 aa  108  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6007  hypothetical protein  32.98 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3474  DMT family permease  36.44 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4271  hypothetical protein  34.04 
 
 		 285 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.564552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3756  hypothetical protein  34.98 
 
 		 285 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.83129  normal  0.119763 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1673  hypothetical protein  33.57 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0779725  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3717  hypothetical protein  31.27 
 
 		 283 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657811  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3366  hypothetical protein  32.87 
 
 		 278 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4230  hypothetical protein  37.99 
 
 		 251 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.220159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4193  putative 10 TMS drug/metabolite exporter, DME family, DMT superfamily  34.81 
 
 		 280 aa  96.7  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0556115 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.37 
 
 		 277 aa  95.9  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0296573  normal  0.100068 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.89 
 
 		 281 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.632965 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1099  hypothetical protein  30.64 
 
 		 281 aa  95.5  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.112723 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.73 
 
 		 286 aa  93.2  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.79 
 
 		 277 aa  92.8  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4709  hypothetical protein  35.22 
 
 		 278 aa  92.4  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1930  putative integral membrane protein DUF6  33.92 
 
 		 279 aa  92.8  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211906  hitchhiker  0.0000000927699 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2940  hypothetical protein  31.54 
 
 		 280 aa  92.4  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0704111  hitchhiker  0.00163659 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3577  hypothetical protein  33.45 
 
 		 284 aa  91.7  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0286  hypothetical protein  35.56 
 
 		 293 aa  90.9  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0865  hypothetical protein  30.9 
 
 		 295 aa  90.1  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0566496  normal  0.513013 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3416  hypothetical protein  29.18 
 
 		 276 aa  89  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0836  hypothetical protein  30.8 
 
 		 278 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0498  hypothetical protein  32.51 
 
 		 303 aa  87  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146008  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4521  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 		 278 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5358  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.06 
 
 		 279 aa  86.3  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.961807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.45 
 
 		 278 aa  86.3  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4911  hypothetical protein  33.93 
 
 		 278 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3007  hypothetical protein  33.93 
 
 		 278 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.558663  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5359  hypothetical protein  33.93 
 
 		 278 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5239  hypothetical protein  34.38 
 
 		 278 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4620  hypothetical protein  27.33 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.331328 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5275  hypothetical protein  30.14 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0997  hypothetical protein  30.6 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2580  hypothetical protein  28.81 
 
 		 281 aa  84  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0532  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.86 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0613856  normal  0.397799 
 
 
-
 
NC_004310  BR0706  hypothetical protein  30.07 
 
 		 281 aa  82.4  0.000000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2138  hypothetical protein  26.55 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.186321  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2218  hypothetical protein  32.74 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0823132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0404  hypothetical protein  34.06 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0566  DMT family permease  32.38 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.7079  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2134  hypothetical protein  34.06 
 
 		 354 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0818  hypothetical protein  34.06 
 
 		 354 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1474  hypothetical protein  34.06 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0501  hypothetical protein  34.06 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.777031  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3337  hypothetical protein  30.27 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0697  hypothetical protein  29.74 
 
 		 281 aa  79  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1326  putative permease protein  28.81 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000762  permease  27.51 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0492  hypothetical protein  31.16 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4973  hypothetical protein  31.32 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3089  hypothetical protein  32.91 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5022  hypothetical protein  31.52 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4846  hypothetical protein  31.32 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0252834  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1831  hypothetical protein  41.53 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2117  hypothetical protein  33.77 
 
 		 292 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107207  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07010  hypothetical protein  29.75 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04883  hypothetical protein  27.04 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1842  drug/metabolite exporter (DME) family protein  30.67 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.129137  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2949  hypothetical protein  27.99 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0491  hypothetical protein  30.67 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.177704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2724  hypothetical protein  28.15 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.35059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0642  hypothetical protein  29.54 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2742  hypothetical protein  25.48 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0631  hypothetical protein  31.27 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.945692 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0541  hypothetical protein  26.32 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1215  hypothetical protein  28.23 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1927  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.33 
 
 		 277 aa  72.4  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.642083  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3941  hypothetical protein  31.54 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.177323  normal  0.483872 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2052  hypothetical protein  27.18 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00300116  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0071  integral membrane protein  30.11 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.13911  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1570  hypothetical protein  30.11 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232738  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1482  hypothetical protein  30.11 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.133803  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1941  hypothetical protein  31.02 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.192478  normal  0.151746 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>