112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1949 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 277 aa  537  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0296573  normal  0.100068 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  96.75 
 
 		 277 aa  504  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3416  hypothetical protein  49.45 
 
 		 276 aa  264  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2841  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.86 
 
 		 306 aa  259  4e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4271  hypothetical protein  52.96 
 
 		 285 aa  240  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.564552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4020  hypothetical protein  52.06 
 
 		 285 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.799358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4347  hypothetical protein  52.06 
 
 		 285 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3756  hypothetical protein  52.43 
 
 		 285 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.83129  normal  0.119763 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2290  hypothetical protein  51.24 
 
 		 275 aa  235  6e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.825928 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6007  hypothetical protein  52.4 
 
 		 287 aa  235  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1673  hypothetical protein  52.81 
 
 		 303 aa  229  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0779725  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0011  hypothetical protein  49.28 
 
 		 280 aa  228  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5892  hypothetical protein  48.75 
 
 		 280 aa  226  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3474  DMT family permease  47.58 
 
 		 280 aa  221  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0071  integral membrane protein  51.92 
 
 		 278 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.13911  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1570  hypothetical protein  51.92 
 
 		 278 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232738  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1482  hypothetical protein  51.92 
 
 		 278 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.133803  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4620  hypothetical protein  47.45 
 
 		 278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.331328 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3577  hypothetical protein  47.12 
 
 		 284 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4193  putative 10 TMS drug/metabolite exporter, DME family, DMT superfamily  51.94 
 
 		 280 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0556115 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.19 
 
 		 281 aa  208  6e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.632965 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4521  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.31 
 
 		 278 aa  206  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0836  hypothetical protein  46.54 
 
 		 278 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2940  hypothetical protein  47.92 
 
 		 280 aa  203  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0704111  hitchhiker  0.00163659 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4230  hypothetical protein  54.09 
 
 		 251 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.220159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0286  hypothetical protein  50.36 
 
 		 293 aa  201  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3366  hypothetical protein  47.1 
 
 		 278 aa  195  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4709  hypothetical protein  47.81 
 
 		 278 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3089  hypothetical protein  48.63 
 
 		 280 aa  189  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5239  hypothetical protein  48.91 
 
 		 278 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4911  hypothetical protein  46.21 
 
 		 278 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3007  hypothetical protein  46.21 
 
 		 278 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.558663  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5359  hypothetical protein  46.21 
 
 		 278 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4689  hypothetical protein  42.12 
 
 		 285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2580  hypothetical protein  38.25 
 
 		 281 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0865  hypothetical protein  40.66 
 
 		 295 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0566496  normal  0.513013 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1099  hypothetical protein  41.06 
 
 		 281 aa  169  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.112723 
 
 
-
 
NC_004310  BR0706  hypothetical protein  37.46 
 
 		 281 aa  167  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.77 
 
 		 278 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2138  hypothetical protein  38.55 
 
 		 280 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.186321  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0498  hypothetical protein  39.29 
 
 		 303 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146008  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4078  integral membrane protein  37.59 
 
 		 286 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4128  integral membrane protein  37.59 
 
 		 286 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4023  integral membrane protein  37.59 
 
 		 286 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4007  integral membrane protein  37.59 
 
 		 286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4186  integral membrane protein  37.59 
 
 		 277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0697  hypothetical protein  36.75 
 
 		 281 aa  162  8.000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3717  hypothetical protein  36.74 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657811  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.5 
 
 		 286 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2218  hypothetical protein  37.99 
 
 		 278 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0823132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1930  putative integral membrane protein DUF6  40 
 
 		 279 aa  159  6e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211906  hitchhiker  0.0000000927699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0566  DMT family permease  38.35 
 
 		 278 aa  158  7e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.7079  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1474  hypothetical protein  44.75 
 
 		 277 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0501  hypothetical protein  44.75 
 
 		 277 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.777031  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0404  hypothetical protein  44.75 
 
 		 327 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2134  hypothetical protein  44.75 
 
 		 354 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0818  hypothetical protein  44.75 
 
 		 354 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1326  putative permease protein  39.13 
 
 		 278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3337  hypothetical protein  37.79 
 
 		 281 aa  152  4e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2117  hypothetical protein  44.12 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107207  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0997  hypothetical protein  41.73 
 
 		 286 aa  146  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5358  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.65 
 
 		 279 aa  143  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.961807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3941  hypothetical protein  35.69 
 
 		 280 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.177323  normal  0.483872 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0532  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.33 
 
 		 273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0613856  normal  0.397799 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0642  hypothetical protein  35.64 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29520  membrane protein  41.54 
 
 		 282 aa  133  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5275  hypothetical protein  35.06 
 
 		 277 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1927  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.63 
 
 		 277 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.642083  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07010  hypothetical protein  34.55 
 
 		 276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1215  hypothetical protein  34.96 
 
 		 300 aa  129  6e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1941  hypothetical protein  34.75 
 
 		 302 aa  127  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.192478  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0492  hypothetical protein  34.7 
 
 		 277 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1831  hypothetical protein  48.55 
 
 		 356 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4973  hypothetical protein  33.69 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4846  hypothetical protein  33.69 
 
 		 277 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0252834  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5022  hypothetical protein  32.97 
 
 		 277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2724  hypothetical protein  32.84 
 
 		 300 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.35059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1842  drug/metabolite exporter (DME) family protein  33.93 
 
 		 301 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.129137  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0491  hypothetical protein  33.93 
 
 		 301 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.177704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1761  hypothetical protein  33.11 
 
 		 290 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0150156  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3082  hypothetical protein  37.01 
 
 		 277 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0631  hypothetical protein  34.6 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.945692 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5906  hypothetical protein  33.45 
 
 		 287 aa  98.2  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0810  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.78 
 
 		 293 aa  98.2  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3629  hypothetical protein  33.78 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.539858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3034  hypothetical protein  33.1 
 
 		 299 aa  96.7  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.77 
 
 		 293 aa  96.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5448  hypothetical protein  31.37 
 
 		 327 aa  95.9  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0881  hypothetical protein  33.68 
 
 		 303 aa  94.7  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.443506  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1129  hypothetical protein  30.56 
 
 		 288 aa  92.4  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.475409 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3482  hypothetical protein  31.51 
 
 		 290 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.183799 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1649  DMT family permease  32.88 
 
 		 290 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.799428  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1866  hypothetical protein  33.56 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2854  hypothetical protein  33.08 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1077  hypothetical protein  31.56 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.407086 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30570  membrane protein  31.12 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.09 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2949  hypothetical protein  27.15 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2742  hypothetical protein  25.41 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2052  hypothetical protein  25.61 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00300116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>