111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5892 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_5892  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  546  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0011  hypothetical protein  86.43 
 
 
280 aa  480  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3474  DMT family permease  81.07 
 
 
280 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4193  putative 10 TMS drug/metabolite exporter, DME family, DMT superfamily  80.36 
 
 
280 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0556115 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2290  hypothetical protein  48.54 
 
 
275 aa  230  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.825928 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2841  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.74 
 
 
306 aa  227  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.75 
 
 
277 aa  226  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0296573  normal  0.100068 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.35 
 
 
277 aa  215  7e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3756  hypothetical protein  45.09 
 
 
285 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.83129  normal  0.119763 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6007  hypothetical protein  42.81 
 
 
287 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4271  hypothetical protein  44.32 
 
 
285 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.564552  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3416  hypothetical protein  40.07 
 
 
276 aa  185  8e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4020  hypothetical protein  42.75 
 
 
285 aa  185  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.799358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4347  hypothetical protein  42.75 
 
 
285 aa  185  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1673  hypothetical protein  44 
 
 
303 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0779725  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4521  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.07 
 
 
278 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1099  hypothetical protein  39.57 
 
 
281 aa  172  7.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.112723 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4620  hypothetical protein  41.52 
 
 
278 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.331328 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0286  hypothetical protein  43.75 
 
 
293 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0836  hypothetical protein  41.33 
 
 
278 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3366  hypothetical protein  41.91 
 
 
278 aa  166  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4709  hypothetical protein  43.01 
 
 
278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328299  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4230  hypothetical protein  44.59 
 
 
251 aa  161  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.220159  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2580  hypothetical protein  37.68 
 
 
281 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0071  integral membrane protein  41.7 
 
 
278 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.13911  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1570  hypothetical protein  41.7 
 
 
278 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232738  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1482  hypothetical protein  41.7 
 
 
278 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.133803  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4689  hypothetical protein  36.96 
 
 
285 aa  156  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673663  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4007  integral membrane protein  35.46 
 
 
286 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4186  integral membrane protein  34.89 
 
 
277 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3577  hypothetical protein  38.77 
 
 
284 aa  155  9e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4078  integral membrane protein  35.11 
 
 
286 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4128  integral membrane protein  35.11 
 
 
286 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4023  integral membrane protein  35.11 
 
 
286 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0706  hypothetical protein  35.66 
 
 
281 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5239  hypothetical protein  43.38 
 
 
278 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.74 
 
 
278 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570084  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0697  hypothetical protein  34.97 
 
 
281 aa  148  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3007  hypothetical protein  42.65 
 
 
278 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.558663  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5359  hypothetical protein  42.65 
 
 
278 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.19 
 
 
286 aa  145  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4911  hypothetical protein  42.28 
 
 
278 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.65 
 
 
281 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.632965 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2138  hypothetical protein  35.23 
 
 
280 aa  143  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.186321  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3089  hypothetical protein  40.52 
 
 
280 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1326  putative permease protein  35.02 
 
 
278 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182128  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0865  hypothetical protein  35.45 
 
 
295 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0566496  normal  0.513013 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0532  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.47 
 
 
273 aa  135  8e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0613856  normal  0.397799 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1474  hypothetical protein  40.53 
 
 
277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0501  hypothetical protein  40.53 
 
 
277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.777031  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4973  hypothetical protein  35.23 
 
 
277 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3717  hypothetical protein  34.07 
 
 
283 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657811  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0404  hypothetical protein  40.53 
 
 
327 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4846  hypothetical protein  35.23 
 
 
277 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0252834  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2134  hypothetical protein  40.53 
 
 
354 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0818  hypothetical protein  40.53 
 
 
354 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2117  hypothetical protein  41.54 
 
 
292 aa  132  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107207  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5358  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.53 
 
 
279 aa  132  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.961807  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5022  hypothetical protein  34.88 
 
 
277 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0492  hypothetical protein  35.36 
 
 
277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1930  putative integral membrane protein DUF6  32.85 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211906  hitchhiker  0.0000000927699 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3337  hypothetical protein  35.46 
 
 
281 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0566  DMT family permease  34.19 
 
 
278 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.7079  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2218  hypothetical protein  33.82 
 
 
278 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0823132  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0642  hypothetical protein  32.97 
 
 
276 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5275  hypothetical protein  35.38 
 
 
277 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07010  hypothetical protein  32.5 
 
 
276 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0498  hypothetical protein  33.58 
 
 
303 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146008  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2940  hypothetical protein  34.36 
 
 
280 aa  118  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0704111  hitchhiker  0.00163659 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1215  hypothetical protein  31.39 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1927  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.25 
 
 
277 aa  113  3e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.642083  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5448  hypothetical protein  32.77 
 
 
327 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2724  hypothetical protein  32.13 
 
 
300 aa  105  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.35059  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1831  hypothetical protein  41.99 
 
 
356 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0997  hypothetical protein  36.7 
 
 
286 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1842  drug/metabolite exporter (DME) family protein  30.14 
 
 
301 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.129137  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0491  hypothetical protein  30.14 
 
 
301 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.177704  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1941  hypothetical protein  29.54 
 
 
302 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.192478  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.46 
 
 
293 aa  99.4  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3941  hypothetical protein  31.84 
 
 
280 aa  96.3  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.177323  normal  0.483872 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3629  hypothetical protein  33.33 
 
 
293 aa  94.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.539858  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0810  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.26 
 
 
293 aa  94.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3082  hypothetical protein  32.79 
 
 
277 aa  93.2  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0631  hypothetical protein  28.36 
 
 
301 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.945692 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29520  membrane protein  33.08 
 
 
282 aa  90.9  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3482  hypothetical protein  33.47 
 
 
290 aa  86.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.183799 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0881  hypothetical protein  29.63 
 
 
303 aa  86.3  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.443506  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1649  DMT family permease  33.05 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.799428  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1866  hypothetical protein  31.88 
 
 
290 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3034  hypothetical protein  33.48 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1761  hypothetical protein  30.7 
 
 
290 aa  82.4  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0150156  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0541  hypothetical protein  26.69 
 
 
301 aa  73.6  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2949  hypothetical protein  24.91 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1077  hypothetical protein  31.23 
 
 
297 aa  72.4  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.407086 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1129  hypothetical protein  28.81 
 
 
288 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.475409 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04883  hypothetical protein  26.49 
 
 
301 aa  69.7  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5906  hypothetical protein  28.62 
 
 
287 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2854  hypothetical protein  30.29 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2742  hypothetical protein  26.43 
 
 
308 aa  65.9  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000762  permease  26.37 
 
 
302 aa  61.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>