121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3756 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3756  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.83129  normal  0.119763 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4020  hypothetical protein  91.93 
 
 		 285 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.799358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4347  hypothetical protein  91.93 
 
 		 285 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6007  hypothetical protein  91.23 
 
 		 287 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1673  hypothetical protein  90.18 
 
 		 303 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0779725  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4271  hypothetical protein  87.02 
 
 		 285 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.564552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4230  hypothetical protein  96.81 
 
 		 251 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.220159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.43 
 
 		 277 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0296573  normal  0.100068 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.69 
 
 		 277 aa  227  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2841  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.12 
 
 		 306 aa  223  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2290  hypothetical protein  47.31 
 
 		 275 aa  211  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.825928 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3416  hypothetical protein  43.33 
 
 		 276 aa  206  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0011  hypothetical protein  44.24 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5892  hypothetical protein  45.09 
 
 		 280 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2580  hypothetical protein  42.7 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3474  DMT family permease  44.04 
 
 		 280 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4193  putative 10 TMS drug/metabolite exporter, DME family, DMT superfamily  47.04 
 
 		 280 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0556115 
 
 
-
 
NC_004310  BR0706  hypothetical protein  40.66 
 
 		 281 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2940  hypothetical protein  45.32 
 
 		 280 aa  172  6.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0704111  hitchhiker  0.00163659 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.65 
 
 		 281 aa  171  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.632965 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0697  hypothetical protein  39.93 
 
 		 281 aa  168  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4689  hypothetical protein  41.96 
 
 		 285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1930  putative integral membrane protein DUF6  38.38 
 
 		 279 aa  161  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211906  hitchhiker  0.0000000927699 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4023  integral membrane protein  38.73 
 
 		 286 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4078  integral membrane protein  38.73 
 
 		 286 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4128  integral membrane protein  38.73 
 
 		 286 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4186  integral membrane protein  38.73 
 
 		 277 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4007  integral membrane protein  38.73 
 
 		 286 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0498  hypothetical protein  39.58 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146008  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1099  hypothetical protein  38.69 
 
 		 281 aa  155  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.112723 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.94 
 
 		 278 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0071  integral membrane protein  40.75 
 
 		 278 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.13911  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1326  putative permease protein  35.48 
 
 		 278 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1570  hypothetical protein  40.75 
 
 		 278 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232738  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1482  hypothetical protein  40.75 
 
 		 278 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.133803  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0865  hypothetical protein  37.83 
 
 		 295 aa  153  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0566496  normal  0.513013 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3577  hypothetical protein  38.18 
 
 		 284 aa  152  7e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0566  DMT family permease  37.81 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.7079  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4620  hypothetical protein  38.33 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.331328 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2218  hypothetical protein  37.88 
 
 		 278 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0823132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.15 
 
 		 286 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3366  hypothetical protein  39.07 
 
 		 278 aa  149  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3089  hypothetical protein  40.64 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0286  hypothetical protein  37.59 
 
 		 293 aa  145  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3717  hypothetical protein  36.17 
 
 		 283 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657811  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3337  hypothetical protein  39.78 
 
 		 281 aa  144  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4521  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.17 
 
 		 278 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0836  hypothetical protein  37.17 
 
 		 278 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2138  hypothetical protein  35.38 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.186321  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4911  hypothetical protein  37.68 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4709  hypothetical protein  35.87 
 
 		 278 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3007  hypothetical protein  37.32 
 
 		 278 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.558663  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5359  hypothetical protein  37.32 
 
 		 278 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5358  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.08 
 
 		 279 aa  135  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.961807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0532  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.02 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0613856  normal  0.397799 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5239  hypothetical protein  36.59 
 
 		 278 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1927  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.69 
 
 		 277 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.642083  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0997  hypothetical protein  38.46 
 
 		 286 aa  129  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07010  hypothetical protein  35.14 
 
 		 276 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0642  hypothetical protein  34.53 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0810  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.62 
 
 		 293 aa  119  7e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1474  hypothetical protein  36.74 
 
 		 277 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0501  hypothetical protein  36.74 
 
 		 277 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.777031  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0404  hypothetical protein  36.74 
 
 		 327 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2134  hypothetical protein  36.74 
 
 		 354 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0818  hypothetical protein  36.74 
 
 		 354 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0881  hypothetical protein  36.43 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.443506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3082  hypothetical protein  36.59 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4973  hypothetical protein  34.78 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5275  hypothetical protein  32.97 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3034  hypothetical protein  36.36 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1941  hypothetical protein  32.65 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.192478  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5022  hypothetical protein  34.78 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4846  hypothetical protein  34.78 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0252834  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3941  hypothetical protein  30.34 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.177323  normal  0.483872 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2117  hypothetical protein  35.56 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107207  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5448  hypothetical protein  34.98 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1761  hypothetical protein  34.34 
 
 		 290 aa  106  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0150156  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2724  hypothetical protein  31.88 
 
 		 300 aa  104  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.35059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2854  hypothetical protein  35.14 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0492  hypothetical protein  33.7 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1215  hypothetical protein  29.89 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3482  hypothetical protein  34.13 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.183799 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3629  hypothetical protein  32.53 
 
 		 293 aa  99.4  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.539858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.73 
 
 		 293 aa  97.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29520  membrane protein  33.33 
 
 		 282 aa  94.4  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1842  drug/metabolite exporter (DME) family protein  30.93 
 
 		 301 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.129137  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0491  hypothetical protein  30.93 
 
 		 301 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.177704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1831  hypothetical protein  37.5 
 
 		 356 aa  92.4  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1649  DMT family permease  33.93 
 
 		 290 aa  92.4  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.799428  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1866  hypothetical protein  33.57 
 
 		 290 aa  89.7  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.1 
 
 		 286 aa  89  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2742  hypothetical protein  25.48 
 
 		 308 aa  88.6  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0631  hypothetical protein  32.2 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.945692 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5906  hypothetical protein  31.14 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2949  hypothetical protein  29.76 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1129  hypothetical protein  29.09 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.475409 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0541  hypothetical protein  30.94 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1077  hypothetical protein  36.23 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.407086 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1643  hypothetical protein  29.55 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>