103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1941 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1941  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  590  1e-167  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.192478  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2724  hypothetical protein  74 
 
 		 300 aa  416  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.35059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1215  hypothetical protein  72.09 
 
 		 300 aa  390  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1842  drug/metabolite exporter (DME) family protein  53.33 
 
 		 301 aa  299  5e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.129137  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0491  hypothetical protein  53.33 
 
 		 301 aa  299  5e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.177704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0631  hypothetical protein  54.49 
 
 		 301 aa  275  7e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.945692 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.11 
 
 		 277 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0296573  normal  0.100068 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4020  hypothetical protein  33.1 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.799358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4347  hypothetical protein  33.1 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.46 
 
 		 277 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3756  hypothetical protein  32.65 
 
 		 285 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.83129  normal  0.119763 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4271  hypothetical protein  33.69 
 
 		 285 aa  122  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.564552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3416  hypothetical protein  35.61 
 
 		 276 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6007  hypothetical protein  33.57 
 
 		 287 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2580  hypothetical protein  31.47 
 
 		 281 aa  117  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4078  integral membrane protein  30.94 
 
 		 286 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4128  integral membrane protein  30.94 
 
 		 286 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4007  integral membrane protein  30.94 
 
 		 286 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4023  integral membrane protein  30.94 
 
 		 286 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1673  hypothetical protein  33.1 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0779725  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0011  hypothetical protein  30.5 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4186  integral membrane protein  30.58 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0706  hypothetical protein  30.45 
 
 		 281 aa  113  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2841  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.5 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4689  hypothetical protein  30.55 
 
 		 285 aa  109  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4230  hypothetical protein  32.4 
 
 		 251 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.220159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3717  hypothetical protein  29.82 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657811  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0697  hypothetical protein  29.76 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2940  hypothetical protein  34.35 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0704111  hitchhiker  0.00163659 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5892  hypothetical protein  30.11 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2290  hypothetical protein  30.6 
 
 		 275 aa  105  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.825928 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0836  hypothetical protein  30.16 
 
 		 278 aa  105  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4521  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.37 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5358  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 279 aa  102  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.961807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3337  hypothetical protein  34.55 
 
 		 281 aa  102  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0286  hypothetical protein  29.27 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3474  DMT family permease  30.51 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2138  hypothetical protein  29.31 
 
 		 280 aa  99.8  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.186321  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2134  hypothetical protein  32.06 
 
 		 354 aa  99.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0818  hypothetical protein  32.06 
 
 		 354 aa  99.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0404  hypothetical protein  32.06 
 
 		 327 aa  99.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1474  hypothetical protein  32.06 
 
 		 277 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0501  hypothetical protein  32.06 
 
 		 277 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.777031  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3366  hypothetical protein  27.82 
 
 		 278 aa  97.4  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4620  hypothetical protein  26.74 
 
 		 278 aa  96.3  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.331328 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3007  hypothetical protein  31.22 
 
 		 278 aa  95.9  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.558663  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5359  hypothetical protein  31.22 
 
 		 278 aa  95.9  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2117  hypothetical protein  32.23 
 
 		 292 aa  95.5  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107207  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1927  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.32 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.642083  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3577  hypothetical protein  29.33 
 
 		 284 aa  94.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4911  hypothetical protein  30.91 
 
 		 278 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4193  putative 10 TMS drug/metabolite exporter, DME family, DMT superfamily  29.81 
 
 		 280 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0556115 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4709  hypothetical protein  28.47 
 
 		 278 aa  92.8  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.17 
 
 		 281 aa  92.8  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.632965 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.97 
 
 		 286 aa  92.8  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1930  putative integral membrane protein DUF6  33.45 
 
 		 279 aa  92  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211906  hitchhiker  0.0000000927699 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5239  hypothetical protein  30.77 
 
 		 278 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0071  integral membrane protein  33.59 
 
 		 278 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.13911  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1099  hypothetical protein  27.68 
 
 		 281 aa  90.9  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.112723 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1570  hypothetical protein  33.59 
 
 		 278 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232738  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1482  hypothetical protein  33.59 
 
 		 278 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.133803  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0498  hypothetical protein  31.16 
 
 		 303 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146008  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3941  hypothetical protein  31.54 
 
 		 280 aa  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.177323  normal  0.483872 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0566  DMT family permease  30.8 
 
 		 278 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.7079  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2218  hypothetical protein  30.45 
 
 		 278 aa  89  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0823132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.08 
 
 		 278 aa  86.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0642  hypothetical protein  28.77 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07010  hypothetical protein  28.42 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3089  hypothetical protein  31.6 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0997  hypothetical protein  29.77 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5022  hypothetical protein  27.7 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0532  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.94 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0613856  normal  0.397799 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2854  hypothetical protein  32.73 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4973  hypothetical protein  27.36 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4846  hypothetical protein  27.36 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0252834  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5448  hypothetical protein  31.02 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0865  hypothetical protein  29.37 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0566496  normal  0.513013 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5275  hypothetical protein  26.41 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1761  hypothetical protein  29.15 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0150156  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0492  hypothetical protein  28.47 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.82 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1649  DMT family permease  28.89 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.799428  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1326  putative permease protein  28.37 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5906  hypothetical protein  29.84 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3034  hypothetical protein  31.78 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3482  hypothetical protein  28.57 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.183799 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1866  hypothetical protein  28.25 
 
 		 290 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0810  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.7 
 
 		 293 aa  67  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2949  hypothetical protein  26.09 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3629  hypothetical protein  29.52 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.539858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0881  hypothetical protein  29.58 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.443506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1831  hypothetical protein  31.48 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.32 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1129  hypothetical protein  26.37 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.475409 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29520  membrane protein  27.5 
 
 		 282 aa  55.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2052  hypothetical protein  25.34 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00300116  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3082  hypothetical protein  26 
 
 		 277 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1643  hypothetical protein  25 
 
 		 290 aa  52.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0806  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.33 
 
 		 290 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000304842  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30570  membrane protein  26.01 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>