121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_30570 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_30570  membrane protein  100 
 
 		 287 aa  545  1e-154  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5906  hypothetical protein  47.29 
 
 		 287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.93 
 
 		 286 aa  209  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1129  hypothetical protein  43.2 
 
 		 288 aa  192  8e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.475409 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3482  hypothetical protein  41.18 
 
 		 290 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.183799 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3034  hypothetical protein  41.61 
 
 		 299 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1761  hypothetical protein  41.18 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0150156  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1649  DMT family permease  42.39 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.799428  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.19 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0810  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.76 
 
 		 293 aa  157  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1866  hypothetical protein  41.3 
 
 		 290 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5448  hypothetical protein  38.23 
 
 		 327 aa  156  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0881  hypothetical protein  39.32 
 
 		 303 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.443506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3629  hypothetical protein  37.54 
 
 		 293 aa  129  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.539858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1077  hypothetical protein  42.25 
 
 		 297 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.407086 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1930  putative integral membrane protein DUF6  33.22 
 
 		 279 aa  92.8  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211906  hitchhiker  0.0000000927699 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4689  hypothetical protein  33.91 
 
 		 285 aa  92.4  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1099  hypothetical protein  32.87 
 
 		 281 aa  92  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.112723 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.87 
 
 		 281 aa  92  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.632965 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4020  hypothetical protein  33.57 
 
 		 285 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.799358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4347  hypothetical protein  33.57 
 
 		 285 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000762  permease  28.33 
 
 		 302 aa  86.7  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4186  integral membrane protein  29.21 
 
 		 277 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4078  integral membrane protein  29.21 
 
 		 286 aa  85.9  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4128  integral membrane protein  29.21 
 
 		 286 aa  85.9  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4023  integral membrane protein  29.21 
 
 		 286 aa  85.9  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3717  hypothetical protein  29.79 
 
 		 283 aa  85.5  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657811  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4007  integral membrane protein  29.21 
 
 		 286 aa  85.5  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1673  hypothetical protein  34.82 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0779725  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1842  drug/metabolite exporter (DME) family protein  29.57 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.129137  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0491  hypothetical protein  29.57 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.177704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04883  hypothetical protein  27.33 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2841  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.68 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6007  hypothetical protein  34.55 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4271  hypothetical protein  33.57 
 
 		 285 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.564552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.12 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0296573  normal  0.100068 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0631  hypothetical protein  32.14 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.945692 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2290  hypothetical protein  30.14 
 
 		 275 aa  82  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.825928 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0541  hypothetical protein  27.85 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3366  hypothetical protein  31.27 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1927  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.38 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.642083  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2742  hypothetical protein  25.57 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0706  hypothetical protein  29.62 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4230  hypothetical protein  34.84 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.220159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3756  hypothetical protein  31.45 
 
 		 285 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.83129  normal  0.119763 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0697  hypothetical protein  29.27 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.17 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2117  hypothetical protein  30.67 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107207  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5358  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.4 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.961807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.24 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2940  hypothetical protein  32.01 
 
 		 280 aa  75.1  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0704111  hitchhiker  0.00163659 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4911  hypothetical protein  29.9 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3007  hypothetical protein  29.55 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.558663  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5359  hypothetical protein  29.55 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3577  hypothetical protein  31.45 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3337  hypothetical protein  31.48 
 
 		 281 aa  73.6  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5239  hypothetical protein  29.59 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4046  hypothetical protein  27.72 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0226  hypothetical protein  27.72 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2580  hypothetical protein  29.07 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0865  hypothetical protein  29.75 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0566496  normal  0.513013 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0404  hypothetical protein  31.62 
 
 		 327 aa  72  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1474  hypothetical protein  32.05 
 
 		 277 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0836  hypothetical protein  31.86 
 
 		 278 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4709  hypothetical protein  29.05 
 
 		 278 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2134  hypothetical protein  31.62 
 
 		 354 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0501  hypothetical protein  32.05 
 
 		 277 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.777031  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0818  hypothetical protein  31.62 
 
 		 354 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0286  hypothetical protein  29.01 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2138  hypothetical protein  27.24 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.186321  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3416  hypothetical protein  27.52 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0642  hypothetical protein  30.1 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3474  DMT family permease  32.31 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1326  putative permease protein  29.29 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.74 
 
 		 286 aa  68.9  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0498  hypothetical protein  29.72 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146008  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5275  hypothetical protein  27.72 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07010  hypothetical protein  28.92 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4620  hypothetical protein  30.17 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.331328 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2724  hypothetical protein  27.5 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.35059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4521  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.36 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0997  hypothetical protein  30.19 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2052  hypothetical protein  27.95 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00300116  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4973  hypothetical protein  27.05 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0566  DMT family permease  28.37 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.7079  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2218  hypothetical protein  28.37 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0823132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4846  hypothetical protein  27.05 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0252834  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0532  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.34 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0613856  normal  0.397799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5022  hypothetical protein  26.58 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0806  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.6 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000304842  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0071  integral membrane protein  30.26 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.13911  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1570  hypothetical protein  30.26 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232738  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1482  hypothetical protein  30.26 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.133803  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1215  hypothetical protein  26.47 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0853  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.33 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29520  membrane protein  34.06 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4193  putative 10 TMS drug/metabolite exporter, DME family, DMT superfamily  30.99 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0556115 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3089  hypothetical protein  33.04 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3941  hypothetical protein  28.44 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.177323  normal  0.483872 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0011  hypothetical protein  28.9 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>