113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1326 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1326  putative permease protein  100 
 
 		 278 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  92.45 
 
 		 278 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0865  hypothetical protein  73.51 
 
 		 295 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0566496  normal  0.513013 
 
 
-
 
NC_004310  BR0706  hypothetical protein  50 
 
 		 281 aa  249  5e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2580  hypothetical protein  48.92 
 
 		 281 aa  248  7e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0697  hypothetical protein  49.28 
 
 		 281 aa  243  3.9999999999999997e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4186  integral membrane protein  49.28 
 
 		 277 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4078  integral membrane protein  49.28 
 
 		 286 aa  238  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4128  integral membrane protein  49.28 
 
 		 286 aa  238  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4023  integral membrane protein  49.28 
 
 		 286 aa  238  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4007  integral membrane protein  49.28 
 
 		 286 aa  238  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0532  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.36 
 
 		 273 aa  218  6e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0613856  normal  0.397799 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1099  hypothetical protein  46.4 
 
 		 281 aa  218  7e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.112723 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4689  hypothetical protein  45.49 
 
 		 285 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.77 
 
 		 281 aa  183  3e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.632965 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3337  hypothetical protein  44.66 
 
 		 281 aa  175  9e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2290  hypothetical protein  35.23 
 
 		 275 aa  172  5e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.825928 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3577  hypothetical protein  39.86 
 
 		 284 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3717  hypothetical protein  37.41 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657811  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.13 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0296573  normal  0.100068 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4271  hypothetical protein  36.56 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.564552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2841  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.92 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0498  hypothetical protein  38.16 
 
 		 303 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146008  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0566  DMT family permease  36.92 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.7079  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3756  hypothetical protein  35.48 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.83129  normal  0.119763 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4620  hypothetical protein  36.4 
 
 		 278 aa  159  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.331328 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2218  hypothetical protein  36.56 
 
 		 278 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0823132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3089  hypothetical protein  42.26 
 
 		 280 aa  158  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4020  hypothetical protein  35.13 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.799358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4347  hypothetical protein  35.13 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1930  putative integral membrane protein DUF6  37.1 
 
 		 279 aa  156  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211906  hitchhiker  0.0000000927699 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6007  hypothetical protein  35.13 
 
 		 287 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3366  hypothetical protein  37.86 
 
 		 278 aa  155  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1673  hypothetical protein  36.56 
 
 		 303 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0779725  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2940  hypothetical protein  37.97 
 
 		 280 aa  152  7e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0704111  hitchhiker  0.00163659 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.13 
 
 		 277 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3416  hypothetical protein  32.73 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0642  hypothetical protein  37.45 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5892  hypothetical protein  35.02 
 
 		 280 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07010  hypothetical protein  37.82 
 
 		 276 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0286  hypothetical protein  37 
 
 		 293 aa  142  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4193  putative 10 TMS drug/metabolite exporter, DME family, DMT superfamily  37.26 
 
 		 280 aa  142  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0556115 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5358  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.55 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.961807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4709  hypothetical protein  37 
 
 		 278 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3082  hypothetical protein  42.92 
 
 		 277 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0011  hypothetical protein  35.14 
 
 		 280 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5275  hypothetical protein  34.91 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0836  hypothetical protein  34.06 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4521  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.81 
 
 		 278 aa  136  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.15 
 
 		 286 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3474  DMT family permease  33.96 
 
 		 280 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3941  hypothetical protein  35.16 
 
 		 280 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.177323  normal  0.483872 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2138  hypothetical protein  32.21 
 
 		 280 aa  132  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.186321  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5022  hypothetical protein  35.25 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4973  hypothetical protein  34.89 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0071  integral membrane protein  35.21 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.13911  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3007  hypothetical protein  37.5 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.558663  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5359  hypothetical protein  37.5 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1570  hypothetical protein  35.21 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232738  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1482  hypothetical protein  35.21 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.133803  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4846  hypothetical protein  34.89 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0252834  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4911  hypothetical protein  37.14 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4230  hypothetical protein  35.17 
 
 		 251 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.220159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0492  hypothetical protein  35.51 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5239  hypothetical protein  37.36 
 
 		 278 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29520  membrane protein  38.58 
 
 		 282 aa  122  7e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0404  hypothetical protein  36.23 
 
 		 327 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1474  hypothetical protein  36.23 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0501  hypothetical protein  36.23 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.777031  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2134  hypothetical protein  36.23 
 
 		 354 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0818  hypothetical protein  36.23 
 
 		 354 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2117  hypothetical protein  36 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107207  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2854  hypothetical protein  34.08 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0997  hypothetical protein  32.58 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1927  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.73 
 
 		 277 aa  99.4  5e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.642083  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1831  hypothetical protein  35.26 
 
 		 356 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3629  hypothetical protein  30.72 
 
 		 293 aa  89  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.539858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5448  hypothetical protein  29.83 
 
 		 327 aa  83.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2724  hypothetical protein  28.31 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.35059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.49 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0810  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.19 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1761  hypothetical protein  27.74 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0150156  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0881  hypothetical protein  29.43 
 
 		 303 aa  79  0.00000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.443506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1215  hypothetical protein  26.37 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1941  hypothetical protein  28.72 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.192478  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1077  hypothetical protein  31.62 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.407086 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.42 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3482  hypothetical protein  28.82 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.183799 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0541  hypothetical protein  28.67 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1649  DMT family permease  28.21 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.799428  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1129  hypothetical protein  30.65 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.475409 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1866  hypothetical protein  28 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3034  hypothetical protein  29.25 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2052  hypothetical protein  24.41 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00300116  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1842  drug/metabolite exporter (DME) family protein  26.04 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.129137  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0491  hypothetical protein  26.04 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.177704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1643  hypothetical protein  29.05 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30570  membrane protein  28.62 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2949  hypothetical protein  22.92 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2742  hypothetical protein  28.19 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>