115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4193 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4193  putative 10 TMS drug/metabolite exporter, DME family, DMT superfamily  100 
 
 
280 aa  530  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0556115 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0011  hypothetical protein  86.07 
 
 
280 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3474  DMT family permease  86.43 
 
 
280 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5892  hypothetical protein  80.36 
 
 
280 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2290  hypothetical protein  50.72 
 
 
275 aa  238  5e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.825928 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.92 
 
 
277 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0296573  normal  0.100068 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2841  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.22 
 
 
306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.19 
 
 
277 aa  225  7e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3416  hypothetical protein  43.17 
 
 
276 aa  203  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4271  hypothetical protein  48.06 
 
 
285 aa  202  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.564552  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6007  hypothetical protein  47.16 
 
 
287 aa  201  9e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3756  hypothetical protein  46.85 
 
 
285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.83129  normal  0.119763 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1673  hypothetical protein  47.45 
 
 
303 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0779725  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4020  hypothetical protein  46.45 
 
 
285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.799358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4347  hypothetical protein  46.45 
 
 
285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4521  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.36 
 
 
278 aa  191  8e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3366  hypothetical protein  46.93 
 
 
278 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0286  hypothetical protein  46.69 
 
 
293 aa  186  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0836  hypothetical protein  43.61 
 
 
278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4620  hypothetical protein  42.24 
 
 
278 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.331328 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4709  hypothetical protein  46.69 
 
 
278 aa  182  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328299  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4230  hypothetical protein  46.59 
 
 
251 aa  175  8e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.220159  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3577  hypothetical protein  43.48 
 
 
284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1099  hypothetical protein  42.18 
 
 
281 aa  172  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.112723 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.75 
 
 
281 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.632965 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3007  hypothetical protein  46.21 
 
 
278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.558663  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5359  hypothetical protein  46.21 
 
 
278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5239  hypothetical protein  47.06 
 
 
278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4911  hypothetical protein  45.85 
 
 
278 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2580  hypothetical protein  37.41 
 
 
281 aa  165  8e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0706  hypothetical protein  37.06 
 
 
281 aa  162  6e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0071  integral membrane protein  44.83 
 
 
278 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.13911  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1570  hypothetical protein  44.83 
 
 
278 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232738  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1482  hypothetical protein  44.83 
 
 
278 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.133803  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3089  hypothetical protein  46.24 
 
 
280 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4689  hypothetical protein  39.86 
 
 
285 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673663  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4007  integral membrane protein  37.99 
 
 
286 aa  158  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4078  integral membrane protein  37.63 
 
 
286 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4128  integral membrane protein  37.63 
 
 
286 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4023  integral membrane protein  37.63 
 
 
286 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4186  integral membrane protein  37.63 
 
 
277 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.27 
 
 
278 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570084  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0697  hypothetical protein  36.36 
 
 
281 aa  156  4e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1474  hypothetical protein  45.45 
 
 
277 aa  155  8e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0501  hypothetical protein  45.45 
 
 
277 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.777031  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0404  hypothetical protein  45.45 
 
 
327 aa  155  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2134  hypothetical protein  45.45 
 
 
354 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0818  hypothetical protein  45.45 
 
 
354 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2138  hypothetical protein  38.81 
 
 
280 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.186321  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3717  hypothetical protein  38.1 
 
 
283 aa  152  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657811  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2117  hypothetical protein  46.32 
 
 
292 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107207  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.46 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0532  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.97 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0613856  normal  0.397799 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2940  hypothetical protein  39.62 
 
 
280 aa  145  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0704111  hitchhiker  0.00163659 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0566  DMT family permease  38.89 
 
 
278 aa  145  6e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.7079  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2218  hypothetical protein  38.52 
 
 
278 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0823132  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1326  putative permease protein  37.91 
 
 
278 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182128  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0865  hypothetical protein  37.96 
 
 
295 aa  143  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0566496  normal  0.513013 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1930  putative integral membrane protein DUF6  36.1 
 
 
279 aa  143  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211906  hitchhiker  0.0000000927699 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4973  hypothetical protein  39.15 
 
 
277 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5358  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.52 
 
 
279 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.961807  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4846  hypothetical protein  39.15 
 
 
277 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0252834  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5022  hypothetical protein  39.15 
 
 
277 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0498  hypothetical protein  37.41 
 
 
303 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146008  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0642  hypothetical protein  37.55 
 
 
276 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3337  hypothetical protein  37.5 
 
 
281 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07010  hypothetical protein  36.79 
 
 
276 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0492  hypothetical protein  39.86 
 
 
277 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5275  hypothetical protein  36.26 
 
 
277 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1831  hypothetical protein  44.75 
 
 
356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5448  hypothetical protein  34.33 
 
 
327 aa  113  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1215  hypothetical protein  32.35 
 
 
300 aa  112  8.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3941  hypothetical protein  35.77 
 
 
280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.177323  normal  0.483872 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2724  hypothetical protein  32.36 
 
 
300 aa  109  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.35059  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0997  hypothetical protein  37.55 
 
 
286 aa  109  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1927  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.08 
 
 
277 aa  106  4e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.642083  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1842  drug/metabolite exporter (DME) family protein  32.27 
 
 
301 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.129137  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0491  hypothetical protein  32.27 
 
 
301 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.177704  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29520  membrane protein  36.94 
 
 
282 aa  103  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3082  hypothetical protein  37.94 
 
 
277 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3629  hypothetical protein  34.55 
 
 
293 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.539858  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1941  hypothetical protein  29.89 
 
 
302 aa  98.6  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.192478  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.77 
 
 
293 aa  98.2  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0810  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 
293 aa  96.3  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0631  hypothetical protein  30.34 
 
 
301 aa  92.8  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.945692 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0881  hypothetical protein  33.09 
 
 
303 aa  89.7  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.443506  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1761  hypothetical protein  30.66 
 
 
290 aa  89.4  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0150156  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3482  hypothetical protein  30.66 
 
 
290 aa  89.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.183799 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1866  hypothetical protein  34.22 
 
 
290 aa  87  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1649  DMT family permease  32.59 
 
 
290 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.799428  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3034  hypothetical protein  34.48 
 
 
299 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1077  hypothetical protein  34.66 
 
 
297 aa  75.9  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.407086 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1129  hypothetical protein  29.59 
 
 
288 aa  73.9  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.475409 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0541  hypothetical protein  29.97 
 
 
301 aa  73.2  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5906  hypothetical protein  29.89 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04883  hypothetical protein  28.05 
 
 
301 aa  69.7  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2854  hypothetical protein  31.91 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2949  hypothetical protein  25.85 
 
 
290 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000762  permease  27.06 
 
 
302 aa  66.6  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2742  hypothetical protein  25.67 
 
 
308 aa  65.5  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>