More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2925 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1132  hypothetical protein  64.24 
 
 
310 aa  336  2.9999999999999997e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  49.66 
 
 
302 aa  289  4e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.93 
 
 
302 aa  257  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.29 
 
 
298 aa  250  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.91 
 
 
300 aa  242  5e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.36 
 
 
302 aa  225  6e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2249  hypothetical protein  42.91 
 
 
294 aa  225  8e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00767545  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2413  hypothetical protein  42.91 
 
 
294 aa  225  8e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2169  permease; drug/metabolite exporter family protein  42.21 
 
 
294 aa  223  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2208  permease; drug/metabolite exporter family protein  42.21 
 
 
294 aa  222  8e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2431  hypothetical protein  42.21 
 
 
294 aa  222  8e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.295627 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2952  hypothetical protein  41.44 
 
 
295 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0338649  hitchhiker  0.0000000562298 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2379  hypothetical protein  43.69 
 
 
295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.557677  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2227  hypothetical protein  41.84 
 
 
296 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1520  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.14 
 
 
295 aa  212  5.999999999999999e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00453579 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2512  hypothetical protein  42.12 
 
 
295 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0135792  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  41.18 
 
 
305 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1388  hypothetical protein  37.5 
 
 
303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00161471  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1123  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  37.5 
 
 
303 aa  200  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1137  hypothetical protein  37.5 
 
 
303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0899192  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3157  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.74 
 
 
307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1285  hypothetical protein  38.43 
 
 
303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150525  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1130  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  37.5 
 
 
303 aa  199  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0451138  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1311  hypothetical protein  37.5 
 
 
303 aa  199  6e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000102965 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1149  hypothetical protein  37.5 
 
 
303 aa  199  7e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1243  hypothetical protein  37.5 
 
 
303 aa  199  7e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1350  hypothetical protein  38.43 
 
 
309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287867  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0947  hypothetical protein  37.16 
 
 
303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0647219  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4059  hypothetical protein  38.08 
 
 
303 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0153728  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  38.44 
 
 
297 aa  195  9e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0219  hypothetical protein  38.91 
 
 
300 aa  194  1e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.79 
 
 
302 aa  193  4e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0152  hypothetical protein  37.63 
 
 
297 aa  191  2e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1219  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.35 
 
 
288 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0564  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.81 
 
 
305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0587  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.59 
 
 
300 aa  176  4e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.770016  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2761  hypothetical protein  38.96 
 
 
316 aa  175  9e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112871  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.28 
 
 
293 aa  174  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.918526  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2109  hypothetical protein  39.53 
 
 
295 aa  169  6e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14500  membrane protein  37.19 
 
 
286 aa  168  9e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00083685  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0748  hypothetical protein  37.59 
 
 
288 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2028  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.04 
 
 
316 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2519  hypothetical protein  37.01 
 
 
318 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.561835 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1257  hypothetical protein  42.86 
 
 
277 aa  142  7e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3455  hypothetical protein  34.8 
 
 
300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.43 
 
 
307 aa  140  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00280057  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0063  hypothetical protein  38.19 
 
 
285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.11 
 
 
305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557636 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.43 
 
 
300 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.618176 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1991  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.88 
 
 
300 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0896  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.63 
 
 
295 aa  126  6e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.841785  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.96 
 
 
304 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.484087 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.08 
 
 
284 aa  113  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0097  hypothetical protein  33.78 
 
 
286 aa  107  3e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0089  hypothetical protein  36.84 
 
 
285 aa  105  7e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.893408  normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2001  hypothetical protein  35.62 
 
 
283 aa  105  8e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1136  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.66 
 
 
286 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.762369  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  29.55 
 
 
296 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1038  hypothetical protein  33.33 
 
 
273 aa  103  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000348344  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1137  hypothetical protein  35.42 
 
 
285 aa  103  3e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.893174  hitchhiker  0.00000000116999 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.1 
 
 
325 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.72 
 
 
301 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7770  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.32 
 
 
317 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.19 
 
 
290 aa  95.9  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0997  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.27 
 
 
315 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  0.602087 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  29.93 
 
 
299 aa  94  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0968  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.02 
 
 
314 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.63 
 
 
284 aa  90.5  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2973  hypothetical protein  27.67 
 
 
325 aa  87.8  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2413  hypothetical protein  30.55 
 
 
281 aa  87  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.163379 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0721  hypothetical protein  31.49 
 
 
306 aa  86.3  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.117715 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0737  hypothetical protein  29.89 
 
 
281 aa  85.9  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0010  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.03 
 
 
312 aa  85.5  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000132585 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0689  hypothetical protein  29.89 
 
 
281 aa  85.9  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.164127  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.88 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0816  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.35 
 
 
259 aa  82  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1531  hypothetical protein  30.8 
 
 
267 aa  81.6  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0755616 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0009  hypothetical protein  30.04 
 
 
304 aa  79.3  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0281  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.4 
 
 
297 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3122  hypothetical protein  29.08 
 
 
322 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370163  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0861  hypothetical protein  24.19 
 
 
294 aa  75.9  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2339  hypothetical protein  28.08 
 
 
337 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0842181  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1219  hypothetical protein  30.31 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.465362  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  28.67 
 
 
283 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  27.66 
 
 
299 aa  72.4  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0610  hypothetical protein  25.59 
 
 
349 aa  70.1  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00052369  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0667  hypothetical protein  34.18 
 
 
319 aa  69.7  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.522504 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  26.1 
 
 
308 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  29.7 
 
 
291 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  25.64 
 
 
317 aa  67  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.83 
 
 
295 aa  66.2  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  27.05 
 
 
293 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.44 
 
 
299 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15760  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  27.19 
 
 
327 aa  64.7  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.941518  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  26.62 
 
 
292 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.38 
 
 
310 aa  63.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  25.86 
 
 
303 aa  63.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  25.86 
 
 
303 aa  63.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  26.12 
 
 
297 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>