79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0781 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0781  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 295 aa  550  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01739  hypothetical protein  70.36 
 
 		 303 aa  360  2e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1656  hypothetical protein  65.23 
 
 		 297 aa  277  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0479067  normal  0.122332 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4266  hypothetical protein  51.19 
 
 		 295 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2935  hypothetical protein  59.42 
 
 		 286 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3109  hypothetical protein  56.43 
 
 		 289 aa  264  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0895719 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2087  LysR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 283 aa  250  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  hitchhiker  0.0000000953173 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5364  hypothetical protein  54.74 
 
 		 285 aa  246  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.929346 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1975  hypothetical protein  51.3 
 
 		 283 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0979714  hitchhiker  0.00214562 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2000  hypothetical protein  51.3 
 
 		 283 aa  244  9e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389336  decreased coverage  0.00000000377823 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4102  hypothetical protein  47.12 
 
 		 302 aa  240  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.576037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0646  hypothetical protein  46.85 
 
 		 288 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00955347  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3816  hypothetical protein  56.66 
 
 		 307 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0746  DMT family permease  52.54 
 
 		 297 aa  238  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4790  membrane protein  45.74 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.278325  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1891  hypothetical protein  49.29 
 
 		 300 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1774  hypothetical protein  43.88 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1446  hypothetical protein  40.58 
 
 		 314 aa  219  3.9999999999999997e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1416  hypothetical protein  43.05 
 
 		 304 aa  219  6e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.239593 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1068  hypothetical protein  42.71 
 
 		 311 aa  216  5e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1850  sensor protein GLPS  48.06 
 
 		 302 aa  216  5e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.829384 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1346  hypothetical protein  43.29 
 
 		 314 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38950  hypothetical protein  56.43 
 
 		 287 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06636  hypothetical protein  45.94 
 
 		 289 aa  204  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001148  permease  43.31 
 
 		 289 aa  203  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270511  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3521  hypothetical protein  49.25 
 
 		 290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3318  hypothetical protein  55.36 
 
 		 286 aa  185  9e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46360  hypothetical protein  57.41 
 
 		 285 aa  183  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.206778  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1051  DMT superfamily efflux pump  45.58 
 
 		 254 aa  182  6e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.226473  normal  0.464817 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2406  hypothetical protein  49.25 
 
 		 290 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2254  hypothetical protein  48.51 
 
 		 290 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.290541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2916  hypothetical protein  48.57 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.264108  normal  0.862431 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6146  hypothetical protein  45.97 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3356  hypothetical protein  43.75 
 
 		 287 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1087  hypothetical protein  58.4 
 
 		 281 aa  168  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.647653 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6439  hypothetical protein  44.86 
 
 		 275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.719443 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1433  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.49 
 
 		 296 aa  163  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02132  permease of the drug/metabolite transporter superfamily protein  48.45 
 
 		 194 aa  163  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.259073  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0600  hypothetical protein  42.66 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.172684 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0856  hypothetical protein  48.66 
 
 		 288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0559005  normal  0.228089 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1613  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.91 
 
 		 307 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.76207  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1689  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.28 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2262  hypothetical protein  50.38 
 
 		 319 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.099345  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.49 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0579  integral membrane protein  32.05 
 
 		 426 aa  53.5  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.431063  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  26.33 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.01 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.69 
 
 		 296 aa  50.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  28.25 
 
 		 321 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  27.55 
 
 		 343 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0441  hypothetical protein  28.77 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0502  hypothetical protein  28.74 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.643088  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  27.82 
 
 		 293 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  28.73 
 
 		 292 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  28.73 
 
 		 293 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0710  hypothetical protein  31.62 
 
 		 312 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0696  hypothetical protein  31.7 
 
 		 376 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.6 
 
 		 305 aa  45.8  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12541  integral membrane protein, DUF6  34.85 
 
 		 293 aa  45.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.442569 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2400  hypothetical protein  31.69 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.59525 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0875  integral membrane protein  31.62 
 
 		 312 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  25.23 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2733  multidrug ABC transporter permease  31.7 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2435  hypothetical protein  29.8 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2345  hypothetical protein  31.7 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1109  hypothetical protein  38.24 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  27.41 
 
 		 326 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  26.22 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.06 
 
 		 307 aa  44.3  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.25 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46700  hypothetical protein  33.9 
 
 		 297 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.022597  decreased coverage  0.000000235263 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.74 
 
 		 314 aa  43.5  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  35.9 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  31.2 
 
 		 294 aa  43.1  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  23.67 
 
 		 304 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4022  hypothetical protein  33.71 
 
 		 297 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  27.45 
 
 		 305 aa  42.7  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 		 299 aa  42.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  29.66 
 
 		 301 aa  42.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>