96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2935 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2935  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  533  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5364  hypothetical protein  64.87 
 
 		 285 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.929346 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2087  LysR family transcriptional regulator  56.99 
 
 		 283 aa  285  9e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  hitchhiker  0.0000000953173 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3109  hypothetical protein  58.27 
 
 		 289 aa  280  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0895719 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0781  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.42 
 
 		 295 aa  278  6e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2000  hypothetical protein  56.49 
 
 		 283 aa  275  7e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389336  decreased coverage  0.00000000377823 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1975  hypothetical protein  56.3 
 
 		 283 aa  271  7e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0979714  hitchhiker  0.00214562 
 
 
-
 
NC_003296  RS01739  hypothetical protein  57.99 
 
 		 303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4266  hypothetical protein  50.88 
 
 		 295 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3816  hypothetical protein  60.5 
 
 		 307 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0746  DMT family permease  55.63 
 
 		 297 aa  261  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4790  membrane protein  49.82 
 
 		 285 aa  253  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.278325  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1774  hypothetical protein  48.08 
 
 		 297 aa  232  7.000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1416  hypothetical protein  43.71 
 
 		 304 aa  229  4e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.239593 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4102  hypothetical protein  45.88 
 
 		 302 aa  223  4e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.576037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0646  hypothetical protein  45.3 
 
 		 288 aa  215  7e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00955347  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1850  sensor protein GLPS  48.58 
 
 		 302 aa  215  8e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.829384 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3521  hypothetical protein  49.81 
 
 		 290 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38950  hypothetical protein  59.35 
 
 		 287 aa  208  9e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1433  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.45 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1446  hypothetical protein  40.39 
 
 		 314 aa  206  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1068  hypothetical protein  41.53 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2406  hypothetical protein  50.93 
 
 		 290 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1087  hypothetical protein  63.48 
 
 		 281 aa  202  7e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.647653 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1656  hypothetical protein  52 
 
 		 297 aa  202  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0479067  normal  0.122332 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3318  hypothetical protein  57.99 
 
 		 286 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1346  hypothetical protein  45.05 
 
 		 314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2254  hypothetical protein  50.93 
 
 		 290 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.290541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1891  hypothetical protein  45.28 
 
 		 300 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1051  DMT superfamily efflux pump  45.92 
 
 		 254 aa  192  6e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.226473  normal  0.464817 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001148  permease  43.36 
 
 		 289 aa  192  6e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270511  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46360  hypothetical protein  59.16 
 
 		 285 aa  182  8.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.206778  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0856  hypothetical protein  54.02 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0559005  normal  0.228089 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02132  permease of the drug/metabolite transporter superfamily protein  54.17 
 
 		 194 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.259073  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06636  hypothetical protein  44.21 
 
 		 289 aa  179  5.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0600  hypothetical protein  44.67 
 
 		 297 aa  176  6e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.172684 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2916  hypothetical protein  48 
 
 		 282 aa  160  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.264108  normal  0.862431 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6146  hypothetical protein  43.64 
 
 		 302 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6439  hypothetical protein  41.54 
 
 		 275 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.719443 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1613  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50 
 
 		 307 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.76207  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1689  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.22 
 
 		 301 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112167  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3356  hypothetical protein  41.37 
 
 		 287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2262  hypothetical protein  51.15 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.099345  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  35.85 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  31.56 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  31.98 
 
 		 307 aa  57  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  33.33 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  27.14 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  27.14 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  27.14 
 
 		 292 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  30.22 
 
 		 315 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  26.67 
 
 		 321 aa  52.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  26.19 
 
 		 343 aa  52.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.85 
 
 		 293 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  25.62 
 
 		 304 aa  49.7  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  27.84 
 
 		 305 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.14 
 
 		 305 aa  49.3  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.22 
 
 		 301 aa  49.3  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  26.24 
 
 		 289 aa  49.3  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  28.76 
 
 		 310 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  28.76 
 
 		 310 aa  48.9  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.35 
 
 		 314 aa  48.9  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  27.23 
 
 		 294 aa  48.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  23.94 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2552  hypothetical protein  32.23 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  27.24 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.52 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  29.65 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  27.24 
 
 		 279 aa  47  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  29.65 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0441  hypothetical protein  28.14 
 
 		 301 aa  47  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  23.49 
 
 		 274 aa  46.2  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  25.44 
 
 		 304 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3425  hypothetical protein  28.24 
 
 		 297 aa  46.2  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  29.76 
 
 		 331 aa  45.8  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0138  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.77 
 
 		 299 aa  45.8  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0395  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.6 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.17 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  29.22 
 
 		 299 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  26.92 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  26.92 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0410  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.25 
 
 		 301 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.09 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  29.39 
 
 		 311 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  26.13 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3820  hypothetical protein  28.92 
 
 		 308 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2873  hypothetical protein  27.22 
 
 		 298 aa  43.9  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604973  normal  0.0800404 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  27.13 
 
 		 308 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  28.28 
 
 		 329 aa  43.9  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3775  hypothetical protein  31.53 
 
 		 311 aa  43.5  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0781  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.75 
 
 		 302 aa  42.7  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.943556  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2135  hypothetical protein  27.86 
 
 		 314 aa  42.7  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0459408  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  30.12 
 
 		 311 aa  42.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  25.27 
 
 		 302 aa  42.4  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2545  hypothetical protein  24.64 
 
 		 296 aa  42.4  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2401  hypothetical protein  24.64 
 
 		 296 aa  42.4  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>