63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1656 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1656  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  555  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0479067  normal  0.122332 
 
 
-
 
NC_003296  RS01739  hypothetical protein  70.82 
 
 
303 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0781  protein of unknown function DUF6 transmembrane  66.31 
 
 
295 aa  317  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2087  LysR family transcriptional regulator  48.38 
 
 
283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  hitchhiker  0.0000000953173 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4266  hypothetical protein  46.15 
 
 
295 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1975  hypothetical protein  49.43 
 
 
283 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0979714  hitchhiker  0.00214562 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2935  hypothetical protein  52.73 
 
 
286 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2000  hypothetical protein  49.43 
 
 
283 aa  227  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389336  decreased coverage  0.00000000377823 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1891  hypothetical protein  46.04 
 
 
300 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3816  hypothetical protein  56.38 
 
 
307 aa  225  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3109  hypothetical protein  49.1 
 
 
289 aa  223  4e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0895719 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5364  hypothetical protein  51.81 
 
 
285 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.929346 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4790  membrane protein  45.39 
 
 
285 aa  216  4e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.278325  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4102  hypothetical protein  44.32 
 
 
302 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.576037  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0746  DMT family permease  47.55 
 
 
297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1774  hypothetical protein  41.22 
 
 
297 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1068  hypothetical protein  42.86 
 
 
311 aa  203  4e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1446  hypothetical protein  39.27 
 
 
314 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001148  permease  40.93 
 
 
289 aa  192  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270511  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1850  sensor protein GLPS  43.88 
 
 
302 aa  192  6e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.829384 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0646  hypothetical protein  42.61 
 
 
288 aa  191  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00955347  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1346  hypothetical protein  39.12 
 
 
314 aa  188  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1416  hypothetical protein  38.21 
 
 
304 aa  186  5e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.239593 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06636  hypothetical protein  42.81 
 
 
289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38950  hypothetical protein  53.96 
 
 
287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3521  hypothetical protein  43.66 
 
 
290 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3356  hypothetical protein  43.21 
 
 
287 aa  168  9e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2916  hypothetical protein  45.56 
 
 
282 aa  167  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.264108  normal  0.862431 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1087  hypothetical protein  53.85 
 
 
281 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.647653 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2406  hypothetical protein  44.78 
 
 
290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268881  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46360  hypothetical protein  53.99 
 
 
285 aa  162  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.206778  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0600  hypothetical protein  44.2 
 
 
297 aa  161  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.172684 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3318  hypothetical protein  51.21 
 
 
286 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2254  hypothetical protein  44.4 
 
 
290 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.290541  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6146  hypothetical protein  40.86 
 
 
302 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1051  DMT superfamily efflux pump  40 
 
 
254 aa  153  4e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.226473  normal  0.464817 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0856  hypothetical protein  49.62 
 
 
288 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0559005  normal  0.228089 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1433  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.56 
 
 
296 aa  151  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6439  hypothetical protein  40.15 
 
 
275 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.719443 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1689  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.82 
 
 
301 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1613  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.4 
 
 
307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.76207  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02132  permease of the drug/metabolite transporter superfamily protein  41.24 
 
 
194 aa  132  9e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.259073  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2262  hypothetical protein  49.45 
 
 
319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.099345  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0519  hypothetical protein  28.33 
 
 
301 aa  51.2  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0144274 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6034  hypothetical protein  28.05 
 
 
311 aa  49.7  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  28.51 
 
 
315 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5229  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.34 
 
 
308 aa  49.7  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0395  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.16 
 
 
301 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.85 
 
 
301 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.35 
 
 
300 aa  47  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0592  hypothetical protein  30.45 
 
 
311 aa  47  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0410  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.63 
 
 
301 aa  46.6  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200837  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  25.59 
 
 
304 aa  46.2  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  29.53 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5985  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.48 
 
 
301 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0418  hypothetical protein  27.22 
 
 
306 aa  44.3  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.25 
 
 
305 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  29.63 
 
 
279 aa  43.9  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0279  hypothetical protein  29.51 
 
 
321 aa  43.5  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  26.83 
 
 
307 aa  43.5  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00560  permease  27.07 
 
 
302 aa  43.5  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2852  hypothetical protein  26.19 
 
 
304 aa  43.1  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001929  permease  26.32 
 
 
302 aa  42.4  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>