54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1416 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1416  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  605  9.999999999999999e-173  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.239593 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1051  DMT superfamily efflux pump  87.4 
 
 		 254 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.226473  normal  0.464817 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1774  hypothetical protein  47.23 
 
 		 297 aa  238  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4102  hypothetical protein  45.49 
 
 		 302 aa  231  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.576037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2000  hypothetical protein  42.07 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389336  decreased coverage  0.00000000377823 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2087  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 283 aa  226  4e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  hitchhiker  0.0000000953173 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1975  hypothetical protein  42.96 
 
 		 283 aa  224  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0979714  hitchhiker  0.00214562 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2935  hypothetical protein  43.71 
 
 		 286 aa  222  7e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0781  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.05 
 
 		 295 aa  219  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1346  hypothetical protein  43.37 
 
 		 314 aa  217  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4266  hypothetical protein  42.52 
 
 		 295 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1446  hypothetical protein  39.94 
 
 		 314 aa  216  2.9999999999999998e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3109  hypothetical protein  41.39 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0895719 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0646  hypothetical protein  42.76 
 
 		 288 aa  206  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00955347  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01739  hypothetical protein  39.87 
 
 		 303 aa  202  7e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1068  hypothetical protein  36.84 
 
 		 311 aa  199  6e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0746  DMT family permease  39.66 
 
 		 297 aa  192  6e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001148  permease  40.4 
 
 		 289 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270511  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4790  membrane protein  38.49 
 
 		 285 aa  190  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.278325  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5364  hypothetical protein  39 
 
 		 285 aa  186  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.929346 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3816  hypothetical protein  37.33 
 
 		 307 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1850  sensor protein GLPS  40.4 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.829384 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3521  hypothetical protein  38.64 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06636  hypothetical protein  39.93 
 
 		 289 aa  177  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0600  hypothetical protein  36.07 
 
 		 297 aa  169  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.172684 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1656  hypothetical protein  36.88 
 
 		 297 aa  169  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0479067  normal  0.122332 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2406  hypothetical protein  38.98 
 
 		 290 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02132  permease of the drug/metabolite transporter superfamily protein  45.27 
 
 		 194 aa  160  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.259073  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2254  hypothetical protein  38.31 
 
 		 290 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.290541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1891  hypothetical protein  34.62 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3356  hypothetical protein  34.23 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2916  hypothetical protein  37.2 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.264108  normal  0.862431 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38950  hypothetical protein  37.42 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0856  hypothetical protein  34.97 
 
 		 288 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0559005  normal  0.228089 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1433  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 296 aa  139  7e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1087  hypothetical protein  39.02 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.647653 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3318  hypothetical protein  36.67 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6146  hypothetical protein  36.16 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1613  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.92 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.76207  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6439  hypothetical protein  35.82 
 
 		 275 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.719443 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1689  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.09 
 
 		 301 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2262  hypothetical protein  37.19 
 
 		 319 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.099345  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46360  hypothetical protein  37.72 
 
 		 285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.206778  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.2 
 
 		 305 aa  67  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0418  hypothetical protein  26.67 
 
 		 306 aa  49.3  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  27.27 
 
 		 307 aa  47  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  25.45 
 
 		 308 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0667  RarD protein, DMT superfamily transporter  25.84 
 
 		 302 aa  44.3  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000233047  hitchhiker  0.00000296435 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  25.45 
 
 		 308 aa  43.9  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  31.82 
 
 		 292 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  25.22 
 
 		 325 aa  42.7  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  24.29 
 
 		 305 aa  42.7  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36480  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  25.12 
 
 		 316 aa  42.7  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171631  normal  0.909358 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  24.34 
 
 		 303 aa  42.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>