111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_38950 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_38950  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3318  hypothetical protein  92.98 
 
 		 286 aa  353  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4266  hypothetical protein  53.9 
 
 		 295 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0781  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.43 
 
 		 295 aa  280  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01739  hypothetical protein  56.32 
 
 		 303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2087  LysR family transcriptional regulator  55.4 
 
 		 283 aa  263  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  hitchhiker  0.0000000953173 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2935  hypothetical protein  59.86 
 
 		 286 aa  258  9e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2000  hypothetical protein  56.65 
 
 		 283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389336  decreased coverage  0.00000000377823 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1975  hypothetical protein  56.27 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0979714  hitchhiker  0.00214562 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3109  hypothetical protein  51.96 
 
 		 289 aa  250  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0895719 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4790  membrane protein  48.94 
 
 		 285 aa  246  4e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.278325  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3816  hypothetical protein  58.36 
 
 		 307 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5364  hypothetical protein  54.68 
 
 		 285 aa  235  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.929346 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0746  DMT family permease  52.28 
 
 		 297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4102  hypothetical protein  47.43 
 
 		 302 aa  230  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.576037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1850  sensor protein GLPS  49.82 
 
 		 302 aa  224  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.829384 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3521  hypothetical protein  55.12 
 
 		 290 aa  218  7e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0646  hypothetical protein  44.68 
 
 		 288 aa  218  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00955347  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1446  hypothetical protein  39.93 
 
 		 314 aa  216  4e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1656  hypothetical protein  51.05 
 
 		 297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0479067  normal  0.122332 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1774  hypothetical protein  43.88 
 
 		 297 aa  209  5e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2406  hypothetical protein  57.04 
 
 		 290 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46360  hypothetical protein  66.54 
 
 		 285 aa  203  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.206778  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1087  hypothetical protein  68.08 
 
 		 281 aa  202  6e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.647653 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1416  hypothetical protein  39.66 
 
 		 304 aa  201  9e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.239593 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2254  hypothetical protein  56.23 
 
 		 290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.290541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1346  hypothetical protein  43.2 
 
 		 314 aa  199  6e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06636  hypothetical protein  44.56 
 
 		 289 aa  191  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1891  hypothetical protein  44.15 
 
 		 300 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1068  hypothetical protein  40.4 
 
 		 311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001148  permease  43.51 
 
 		 289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270511  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0600  hypothetical protein  46.15 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.172684 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6146  hypothetical protein  43.88 
 
 		 302 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1433  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.07 
 
 		 296 aa  175  8e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6439  hypothetical protein  45.49 
 
 		 275 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.719443 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3356  hypothetical protein  43.84 
 
 		 287 aa  165  8e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02132  permease of the drug/metabolite transporter superfamily protein  47.92 
 
 		 194 aa  159  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.259073  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1051  DMT superfamily efflux pump  42.16 
 
 		 254 aa  155  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.226473  normal  0.464817 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2916  hypothetical protein  47.83 
 
 		 282 aa  152  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.264108  normal  0.862431 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1613  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.81 
 
 		 307 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.76207  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1689  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.91 
 
 		 301 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112167  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0856  hypothetical protein  49.81 
 
 		 288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0559005  normal  0.228089 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2262  hypothetical protein  48.9 
 
 		 319 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.099345  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  30.8 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  31.25 
 
 		 293 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  31.25 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  31.25 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  30.72 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4430  putative transporter  31.25 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  30.29 
 
 		 343 aa  53.5  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.44 
 
 		 305 aa  53.1  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  31.36 
 
 		 311 aa  52.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  29.58 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.58 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2630  hypothetical protein  33.59 
 
 		 309 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.815333 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  29.58 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  29.58 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  29.58 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  29.58 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.568191 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  29.58 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.97 
 
 		 306 aa  50.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4057  hypothetical protein  29.61 
 
 		 299 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.365603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  31.39 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  29.17 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.532448 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  30.9 
 
 		 310 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.04 
 
 		 293 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.61 
 
 		 299 aa  50.4  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.418802  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.94 
 
 		 305 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  32.04 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  30.77 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  26.12 
 
 		 299 aa  47  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  22.97 
 
 		 304 aa  47.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.07 
 
 		 296 aa  46.6  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0771  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.44 
 
 		 286 aa  46.6  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  29 
 
 		 293 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  27.9 
 
 		 331 aa  46.2  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2356  hypothetical protein  30.87 
 
 		 305 aa  45.8  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469762  normal  0.368317 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  29.26 
 
 		 289 aa  45.8  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  31.69 
 
 		 326 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  30.48 
 
 		 308 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  31.69 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  28.98 
 
 		 307 aa  45.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2612  hypothetical protein  30.17 
 
 		 322 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2512  integral membrane domain-containing protein  33.11 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.106417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1125  hypothetical protein  28.42 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2469  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.78 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2910  hypothetical protein  31.28 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  31.36 
 
 		 310 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  32.39 
 
 		 303 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  31.36 
 
 		 310 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  29.95 
 
 		 308 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2483  hypothetical protein  30.17 
 
 		 293 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0867101 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  31.22 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  31.22 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  25 
 
 		 307 aa  43.5  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0670  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.21 
 
 		 274 aa  43.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.407071  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  31.22 
 
 		 294 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  31.22 
 
 		 294 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  31.22 
 
 		 294 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>