57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1433 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1433  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 296 aa  565  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2935  hypothetical protein  51.81 
 
 		 286 aa  226  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0746  DMT family permease  50.52 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2087  LysR family transcriptional regulator  45.85 
 
 		 283 aa  216  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  hitchhiker  0.0000000953173 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4266  hypothetical protein  41.99 
 
 		 295 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4790  membrane protein  41.96 
 
 		 285 aa  209  5e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.278325  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2000  hypothetical protein  45.85 
 
 		 283 aa  208  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389336  decreased coverage  0.00000000377823 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1975  hypothetical protein  46.39 
 
 		 283 aa  205  7e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0979714  hitchhiker  0.00214562 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3109  hypothetical protein  47.46 
 
 		 289 aa  205  8e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0895719 
 
 
-
 
NC_003296  RS01739  hypothetical protein  47.92 
 
 		 303 aa  201  9e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3816  hypothetical protein  49.47 
 
 		 307 aa  198  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0781  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.85 
 
 		 295 aa  193  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0646  hypothetical protein  40.48 
 
 		 288 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00955347  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5364  hypothetical protein  47.64 
 
 		 285 aa  186  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.929346 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1068  hypothetical protein  38.75 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4102  hypothetical protein  37.72 
 
 		 302 aa  169  7e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.576037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1346  hypothetical protein  39.86 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1774  hypothetical protein  38.79 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1416  hypothetical protein  36.52 
 
 		 304 aa  166  5e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.239593 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1656  hypothetical protein  44.72 
 
 		 297 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0479067  normal  0.122332 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1446  hypothetical protein  34.84 
 
 		 314 aa  165  6.9999999999999995e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0600  hypothetical protein  43.57 
 
 		 297 aa  162  8.000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.172684 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1850  sensor protein GLPS  40.36 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.829384 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06636  hypothetical protein  38.49 
 
 		 289 aa  157  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3521  hypothetical protein  44.32 
 
 		 290 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001148  permease  37.41 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270511  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2406  hypothetical protein  44.69 
 
 		 290 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1891  hypothetical protein  37.23 
 
 		 300 aa  152  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2254  hypothetical protein  45.05 
 
 		 290 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.290541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38950  hypothetical protein  48.07 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0856  hypothetical protein  46.3 
 
 		 288 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0559005  normal  0.228089 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3318  hypothetical protein  48 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6146  hypothetical protein  36.82 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46360  hypothetical protein  47.43 
 
 		 285 aa  132  7.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.206778  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3356  hypothetical protein  37.77 
 
 		 287 aa  132  9e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1613  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.96 
 
 		 307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.76207  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1689  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.21 
 
 		 301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112167  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6439  hypothetical protein  37.2 
 
 		 275 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.719443 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1051  DMT superfamily efflux pump  36.53 
 
 		 254 aa  129  8.000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.226473  normal  0.464817 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02132  permease of the drug/metabolite transporter superfamily protein  42.27 
 
 		 194 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.259073  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2262  hypothetical protein  42.76 
 
 		 319 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.099345  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1087  hypothetical protein  48.15 
 
 		 281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.647653 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2916  hypothetical protein  40.62 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.264108  normal  0.862431 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  25.79 
 
 		 289 aa  52.8  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  29.08 
 
 		 303 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.44 
 
 		 325 aa  49.7  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  24.82 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.31 
 
 		 292 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  27.17 
 
 		 294 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  28.8 
 
 		 301 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  27.35 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  26.29 
 
 		 293 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.4 
 
 		 304 aa  43.9  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  26.29 
 
 		 292 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4075  hypothetical protein  31.03 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  26.29 
 
 		 293 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.66 
 
 		 314 aa  43.1  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>