97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3356 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3356  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  545  1e-154  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2916  hypothetical protein  50.54 
 
 
282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.264108  normal  0.862431 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0600  hypothetical protein  46.38 
 
 
297 aa  198  7.999999999999999e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.172684 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0781  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.75 
 
 
295 aa  179  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2087  LysR family transcriptional regulator  42.55 
 
 
283 aa  179  7e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  hitchhiker  0.0000000953173 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2000  hypothetical protein  44.32 
 
 
283 aa  178  8e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389336  decreased coverage  0.00000000377823 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1975  hypothetical protein  44.32 
 
 
283 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0979714  hitchhiker  0.00214562 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4102  hypothetical protein  38.46 
 
 
302 aa  167  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.576037  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01739  hypothetical protein  41.24 
 
 
303 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1656  hypothetical protein  42.66 
 
 
297 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0479067  normal  0.122332 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4266  hypothetical protein  38.25 
 
 
295 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0746  DMT family permease  41.94 
 
 
297 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1774  hypothetical protein  37.23 
 
 
297 aa  161  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1346  hypothetical protein  40.14 
 
 
314 aa  161  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3109  hypothetical protein  40.29 
 
 
289 aa  161  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0895719 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1850  sensor protein GLPS  42.65 
 
 
302 aa  160  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.829384 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4790  membrane protein  36.26 
 
 
285 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.278325  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1416  hypothetical protein  34.23 
 
 
304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.239593 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2935  hypothetical protein  41.37 
 
 
286 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3816  hypothetical protein  43.37 
 
 
307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0646  hypothetical protein  37.01 
 
 
288 aa  146  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00955347  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06636  hypothetical protein  38.13 
 
 
289 aa  145  9e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1068  hypothetical protein  36.08 
 
 
311 aa  144  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5364  hypothetical protein  40 
 
 
285 aa  143  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.929346 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1446  hypothetical protein  29.97 
 
 
314 aa  138  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001148  permease  35.25 
 
 
289 aa  136  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270511  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38950  hypothetical protein  43.84 
 
 
287 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1891  hypothetical protein  35.94 
 
 
300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3521  hypothetical protein  39.78 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1051  DMT superfamily efflux pump  36.45 
 
 
254 aa  127  3e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.226473  normal  0.464817 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0856  hypothetical protein  41.04 
 
 
288 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0559005  normal  0.228089 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1433  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.77 
 
 
296 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02132  permease of the drug/metabolite transporter superfamily protein  38.1 
 
 
194 aa  117  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.259073  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3318  hypothetical protein  40 
 
 
286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46360  hypothetical protein  42.59 
 
 
285 aa  115  7.999999999999999e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.206778  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2254  hypothetical protein  39.55 
 
 
290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.290541  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2406  hypothetical protein  39.7 
 
 
290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268881  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1613  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.15 
 
 
307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.76207  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1689  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.58 
 
 
301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112167  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6439  hypothetical protein  36.03 
 
 
275 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.719443 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6146  hypothetical protein  35.32 
 
 
302 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2262  hypothetical protein  39.39 
 
 
319 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.099345  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1087  hypothetical protein  41.42 
 
 
281 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.647653 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  28.29 
 
 
335 aa  56.2  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  31.05 
 
 
293 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.34 
 
 
314 aa  54.7  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  31.05 
 
 
293 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  31.05 
 
 
292 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  29.13 
 
 
294 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  29.13 
 
 
294 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0112  putative transporter  29.13 
 
 
294 aa  52.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0697635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  29.13 
 
 
294 aa  52.4  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  29.13 
 
 
294 aa  52.4  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  29.13 
 
 
294 aa  52.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  29.41 
 
 
294 aa  52.4  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  30.14 
 
 
321 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  28.86 
 
 
298 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  30.59 
 
 
343 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  27.09 
 
 
310 aa  49.7  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.67 
 
 
306 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3864  hypothetical protein  23.84 
 
 
297 aa  49.3  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209657  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.4 
 
 
306 aa  48.5  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  31.4 
 
 
306 aa  48.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  27.36 
 
 
293 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 
305 aa  47  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  29.19 
 
 
311 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2707  hypothetical protein  28.41 
 
 
311 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.66 
 
 
324 aa  47  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2095  hypothetical protein  28.41 
 
 
311 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.734352  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.64 
 
 
296 aa  46.6  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.16 
 
 
326 aa  46.6  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  26.91 
 
 
330 aa  46.6  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6034  hypothetical protein  29.38 
 
 
311 aa  45.8  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2967  hypothetical protein  40.62 
 
 
293 aa  45.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105288  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.47 
 
 
293 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3456  hypothetical protein  32.81 
 
 
346 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2734  hypothetical protein  28.41 
 
 
311 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.14 
 
 
325 aa  44.3  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2908  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.32 
 
 
300 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.450588  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2612  hypothetical protein  37.5 
 
 
322 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0764  DMT family permease  35.82 
 
 
119 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.18822 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02797  hypothetical protein  25.4 
 
 
315 aa  43.9  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.605573  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  23.81 
 
 
312 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2483  hypothetical protein  37.5 
 
 
293 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0867101 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  27.53 
 
 
310 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  27.53 
 
 
310 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36480  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  27.31 
 
 
316 aa  43.5  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171631  normal  0.909358 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4262  hypothetical protein  24.74 
 
 
298 aa  43.5  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1085  DMT superfamliy efflux pump  25.1 
 
 
312 aa  43.5  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.164203 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2759  hypothetical protein  29.38 
 
 
303 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.52 
 
 
300 aa  43.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  24.88 
 
 
304 aa  43.1  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0592  hypothetical protein  29.38 
 
 
311 aa  43.1  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2552  hypothetical protein  27.46 
 
 
293 aa  42.7  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  23.81 
 
 
310 aa  42.7  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  24.71 
 
 
302 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  23.94 
 
 
306 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>