87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4790 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4790  membrane protein  100 
 
 		 285 aa  550  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.278325  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2935  hypothetical protein  49.82 
 
 		 286 aa  238  5.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2087  LysR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 283 aa  235  8e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  hitchhiker  0.0000000953173 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3109  hypothetical protein  46.64 
 
 		 289 aa  234  8e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0895719 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4266  hypothetical protein  46.07 
 
 		 295 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0781  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.74 
 
 		 295 aa  231  9e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01739  hypothetical protein  46.13 
 
 		 303 aa  231  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2000  hypothetical protein  46.45 
 
 		 283 aa  229  3e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389336  decreased coverage  0.00000000377823 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1975  hypothetical protein  47.57 
 
 		 283 aa  229  5e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0979714  hitchhiker  0.00214562 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0746  DMT family permease  45.77 
 
 		 297 aa  228  8e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3816  hypothetical protein  45.96 
 
 		 307 aa  215  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5364  hypothetical protein  45.74 
 
 		 285 aa  210  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.929346 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1774  hypothetical protein  39.58 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4102  hypothetical protein  40.65 
 
 		 302 aa  200  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.576037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1346  hypothetical protein  40.13 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0646  hypothetical protein  39.18 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00955347  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1446  hypothetical protein  36.04 
 
 		 314 aa  192  6e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1656  hypothetical protein  43.26 
 
 		 297 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0479067  normal  0.122332 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3521  hypothetical protein  45.05 
 
 		 290 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1068  hypothetical protein  40.83 
 
 		 311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1416  hypothetical protein  38.49 
 
 		 304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.239593 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38950  hypothetical protein  47.87 
 
 		 287 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1433  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.96 
 
 		 296 aa  181  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2406  hypothetical protein  45.42 
 
 		 290 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001148  permease  39.15 
 
 		 289 aa  178  7e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270511  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1891  hypothetical protein  36.96 
 
 		 300 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2254  hypothetical protein  45.79 
 
 		 290 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.290541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1850  sensor protein GLPS  39.01 
 
 		 302 aa  175  8e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.829384 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3318  hypothetical protein  50.18 
 
 		 286 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06636  hypothetical protein  37.37 
 
 		 289 aa  166  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46360  hypothetical protein  49.43 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.206778  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2916  hypothetical protein  39.07 
 
 		 282 aa  162  8.000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.264108  normal  0.862431 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02132  permease of the drug/metabolite transporter superfamily protein  45.83 
 
 		 194 aa  162  8.000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.259073  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1051  DMT superfamily efflux pump  39.32 
 
 		 254 aa  160  3e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.226473  normal  0.464817 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1087  hypothetical protein  49.43 
 
 		 281 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.647653 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0600  hypothetical protein  37.5 
 
 		 297 aa  152  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.172684 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3356  hypothetical protein  36.26 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6439  hypothetical protein  37.17 
 
 		 275 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.719443 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6146  hypothetical protein  36.96 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1613  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.28 
 
 		 307 aa  138  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.76207  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0856  hypothetical protein  40.15 
 
 		 288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0559005  normal  0.228089 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1689  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.48 
 
 		 301 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2262  hypothetical protein  42.54 
 
 		 319 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.099345  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.53 
 
 		 305 aa  53.5  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0441  hypothetical protein  24.73 
 
 		 301 aa  52.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  28.32 
 
 		 308 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.28 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  27.61 
 
 		 298 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 314 aa  50.8  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  28.74 
 
 		 307 aa  50.4  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.84 
 
 		 294 aa  49.3  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1383  hypothetical protein  28.38 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  27.6 
 
 		 304 aa  48.5  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  23.67 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2233  hypothetical protein  35.51 
 
 		 324 aa  48.5  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456309  hitchhiker  0.000692122 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1631  O-acetylserine/cysteine export protein  24.55 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.72 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  27.88 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  23.02 
 
 		 296 aa  47  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3775  hypothetical protein  35.19 
 
 		 311 aa  46.6  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4075  hypothetical protein  26.49 
 
 		 294 aa  45.8  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0502  hypothetical protein  25.82 
 
 		 301 aa  45.8  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.643088  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2400  hypothetical protein  27.78 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.59525 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.62 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  23.61 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1741  O-acetylserine/cysteine export protein  23.66 
 
 		 299 aa  45.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  23.66 
 
 		 299 aa  45.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00179242  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  23.61 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2113  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.66 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000340267  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2125  O-acetylserine/cysteine export protein  23.66 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.290399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6431  hypothetical protein  27.22 
 
 		 315 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.275967  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3820  hypothetical protein  27.78 
 
 		 308 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0410  hypothetical protein  25.43 
 
 		 313 aa  43.9  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0097  hypothetical protein  24.02 
 
 		 304 aa  43.5  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.112407  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  24.64 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  22.98 
 
 		 274 aa  43.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  26.16 
 
 		 303 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01492  cysteine and O-acetyl-L-serine efflux system  24.09 
 
 		 299 aa  42.7  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0660711  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01503  hypothetical protein  24.09 
 
 		 299 aa  42.7  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0763437  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  26.16 
 
 		 303 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.75 
 
 		 287 aa  42.7  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  24.42 
 
 		 310 aa  42.7  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1571  hypothetical protein  21.99 
 
 		 303 aa  42.7  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.358849 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2147  O-acetylserine/cysteine export protein  23.66 
 
 		 299 aa  42.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.758199  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  24.15 
 
 		 294 aa  42.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  24.15 
 
 		 294 aa  42.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  33.33 
 
 		 295 aa  42  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>