117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3816 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3816  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5364  hypothetical protein  65.03 
 
 		 285 aa  291  9e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.929346 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2935  hypothetical protein  60.5 
 
 		 286 aa  281  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2087  LysR family transcriptional regulator  56.27 
 
 		 283 aa  280  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  hitchhiker  0.0000000953173 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0781  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.66 
 
 		 295 aa  272  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2000  hypothetical protein  56.55 
 
 		 283 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389336  decreased coverage  0.00000000377823 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1975  hypothetical protein  56.55 
 
 		 283 aa  269  5e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0979714  hitchhiker  0.00214562 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3109  hypothetical protein  56.69 
 
 		 289 aa  260  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0895719 
 
 
-
 
NC_003296  RS01739  hypothetical protein  55.56 
 
 		 303 aa  257  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4266  hypothetical protein  51.26 
 
 		 295 aa  255  7e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0746  DMT family permease  54.7 
 
 		 297 aa  250  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4790  membrane protein  45.96 
 
 		 285 aa  241  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.278325  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1656  hypothetical protein  56.74 
 
 		 297 aa  236  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0479067  normal  0.122332 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1774  hypothetical protein  44.29 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4102  hypothetical protein  44.16 
 
 		 302 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.576037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0646  hypothetical protein  45.91 
 
 		 288 aa  207  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00955347  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1433  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.47 
 
 		 296 aa  203  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3521  hypothetical protein  49.26 
 
 		 290 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38950  hypothetical protein  58.01 
 
 		 287 aa  201  9e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1416  hypothetical protein  37.87 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.239593 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1068  hypothetical protein  40.55 
 
 		 311 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2406  hypothetical protein  50.37 
 
 		 290 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1446  hypothetical protein  40.13 
 
 		 314 aa  189  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1891  hypothetical protein  43.4 
 
 		 300 aa  188  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2254  hypothetical protein  50 
 
 		 290 aa  188  8e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.290541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1087  hypothetical protein  58.87 
 
 		 281 aa  188  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.647653 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06636  hypothetical protein  44.6 
 
 		 289 aa  186  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3318  hypothetical protein  57.19 
 
 		 286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46360  hypothetical protein  59.55 
 
 		 285 aa  182  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.206778  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1346  hypothetical protein  40.27 
 
 		 314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001148  permease  42.09 
 
 		 289 aa  178  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270511  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1850  sensor protein GLPS  44.48 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.829384 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1051  DMT superfamily efflux pump  40.26 
 
 		 254 aa  168  1e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.226473  normal  0.464817 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3356  hypothetical protein  43.37 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6439  hypothetical protein  45.66 
 
 		 275 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.719443 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0856  hypothetical protein  53.82 
 
 		 288 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0559005  normal  0.228089 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6146  hypothetical protein  44.81 
 
 		 302 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02132  permease of the drug/metabolite transporter superfamily protein  46.35 
 
 		 194 aa  160  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.259073  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0600  hypothetical protein  45.52 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.172684 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2916  hypothetical protein  45.05 
 
 		 282 aa  153  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.264108  normal  0.862431 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1613  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.63 
 
 		 307 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.76207  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1689  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.64 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2262  hypothetical protein  49.44 
 
 		 319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.099345  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0502  hypothetical protein  31.5 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.643088  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0441  hypothetical protein  29 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  29.55 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0519  hypothetical protein  30.5 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0144274 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  29.65 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.44 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4020  DMT family permease  30.8 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000861601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  29.65 
 
 		 303 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  28.83 
 
 		 308 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  29.2 
 
 		 308 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1383  hypothetical protein  29.69 
 
 		 308 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0395  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.5 
 
 		 301 aa  53.9  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0138  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.39 
 
 		 299 aa  52.8  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2095  hypothetical protein  30.29 
 
 		 311 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.734352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2707  hypothetical protein  30.29 
 
 		 311 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0579  integral membrane protein  26.19 
 
 		 426 aa  52  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.431063  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0410  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29 
 
 		 301 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  28.64 
 
 		 298 aa  52.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  27.49 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  27.49 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3820  hypothetical protein  28.42 
 
 		 308 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  27.49 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2734  hypothetical protein  30.29 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.46 
 
 		 311 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6034  hypothetical protein  29.33 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2759  hypothetical protein  29.81 
 
 		 303 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2733  multidrug ABC transporter permease  30.88 
 
 		 272 aa  49.7  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2345  hypothetical protein  30.88 
 
 		 272 aa  49.7  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0696  hypothetical protein  30.88 
 
 		 376 aa  49.7  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  24.16 
 
 		 303 aa  49.3  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  24.16 
 
 		 303 aa  49.3  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  24.16 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  24.16 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0875  integral membrane protein  30.88 
 
 		 312 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  26.54 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  28.5 
 
 		 329 aa  48.9  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0710  hypothetical protein  30.88 
 
 		 312 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  23.39 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  23.6 
 
 		 303 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  23.6 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  24.16 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  23.6 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0592  hypothetical protein  28.85 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  23.6 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.99 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  31.25 
 
 		 313 aa  47.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  28.82 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3388  hypothetical protein  26.85 
 
 		 321 aa  47  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  28.3 
 
 		 335 aa  47  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  26.55 
 
 		 305 aa  47  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4430  putative transporter  28.48 
 
 		 304 aa  46.2  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  28.31 
 
 		 279 aa  45.8  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  28.48 
 
 		 301 aa  45.8  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.48 
 
 		 301 aa  45.8  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  28.48 
 
 		 301 aa  45.8  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  28.48 
 
 		 301 aa  45.8  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  28.48 
 
 		 301 aa  45.8  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>