88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06636 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06636  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  558  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001148  permease  72.32 
 
 		 289 aa  419  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270511  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01739  hypothetical protein  48.06 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4266  hypothetical protein  46.1 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0781  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.94 
 
 		 295 aa  208  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0746  DMT family permease  43.25 
 
 		 297 aa  206  5e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1346  hypothetical protein  44.59 
 
 		 314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3109  hypothetical protein  43.66 
 
 		 289 aa  193  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0895719 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2087  LysR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 283 aa  188  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  hitchhiker  0.0000000953173 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1416  hypothetical protein  40.92 
 
 		 304 aa  182  6e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.239593 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1850  sensor protein GLPS  43.16 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.829384 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4102  hypothetical protein  40.22 
 
 		 302 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.576037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1774  hypothetical protein  40.68 
 
 		 297 aa  178  8e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2935  hypothetical protein  44.56 
 
 		 286 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1975  hypothetical protein  41.58 
 
 		 283 aa  176  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0979714  hitchhiker  0.00214562 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1446  hypothetical protein  37.17 
 
 		 314 aa  176  5e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2000  hypothetical protein  41.58 
 
 		 283 aa  176  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389336  decreased coverage  0.00000000377823 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1656  hypothetical protein  42.81 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0479067  normal  0.122332 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0646  hypothetical protein  38.28 
 
 		 288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00955347  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4790  membrane protein  37.37 
 
 		 285 aa  172  5.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.278325  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3816  hypothetical protein  44.6 
 
 		 307 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5364  hypothetical protein  43.42 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.929346 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3521  hypothetical protein  42.8 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1068  hypothetical protein  33.33 
 
 		 311 aa  156  3e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0600  hypothetical protein  38.85 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.172684 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38950  hypothetical protein  44.56 
 
 		 287 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2406  hypothetical protein  42.81 
 
 		 290 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1891  hypothetical protein  34.85 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6146  hypothetical protein  36.2 
 
 		 302 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3318  hypothetical protein  43.45 
 
 		 286 aa  142  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2254  hypothetical protein  42.8 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.290541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6439  hypothetical protein  35.97 
 
 		 275 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.719443 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1433  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.85 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3356  hypothetical protein  38.13 
 
 		 287 aa  140  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1051  DMT superfamily efflux pump  39.15 
 
 		 254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.226473  normal  0.464817 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02132  permease of the drug/metabolite transporter superfamily protein  40.31 
 
 		 194 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.259073  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1087  hypothetical protein  42.07 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.647653 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2916  hypothetical protein  38.75 
 
 		 282 aa  122  8e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.264108  normal  0.862431 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46360  hypothetical protein  43.32 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.206778  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1613  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.22 
 
 		 307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.76207  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0856  hypothetical protein  40.15 
 
 		 288 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0559005  normal  0.228089 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1689  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.22 
 
 		 301 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2262  hypothetical protein  40.61 
 
 		 319 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.099345  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  25.47 
 
 		 301 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.568191 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  25.47 
 
 		 301 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  25.47 
 
 		 301 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  25.56 
 
 		 301 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  25.47 
 
 		 301 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  25.47 
 
 		 301 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.47 
 
 		 301 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  25.47 
 
 		 301 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.532448 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.36 
 
 		 299 aa  52.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.67 
 
 		 314 aa  53.1  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  26.72 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  24.69 
 
 		 294 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  26.32 
 
 		 335 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  24.69 
 
 		 294 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  25.43 
 
 		 343 aa  50.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  24.69 
 
 		 294 aa  49.7  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  24.69 
 
 		 294 aa  49.7  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  24.69 
 
 		 294 aa  49.7  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0112  putative transporter  24.69 
 
 		 294 aa  49.7  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0697635  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  34.65 
 
 		 279 aa  49.7  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4430  putative transporter  25.09 
 
 		 304 aa  49.3  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  26.89 
 
 		 294 aa  49.3  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3425  hypothetical protein  26.38 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2873  hypothetical protein  25.13 
 
 		 298 aa  47  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604973  normal  0.0800404 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  26.22 
 
 		 289 aa  47  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  25.86 
 
 		 293 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  25.86 
 
 		 292 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  25.86 
 
 		 293 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2596  hypothetical protein  26.45 
 
 		 295 aa  46.6  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519891 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.77 
 
 		 296 aa  46.2  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  24.76 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  22.48 
 
 		 319 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  23.7 
 
 		 303 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  28.33 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  24.81 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0346  hypothetical protein  24.54 
 
 		 302 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  22.27 
 
 		 305 aa  42.7  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  23.12 
 
 		 303 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.89 
 
 		 299 aa  42.7  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00112924  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1098  hypothetical protein  27.78 
 
 		 305 aa  42.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100036  normal  0.664944 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  26.32 
 
 		 331 aa  42.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  24.76 
 
 		 304 aa  42.4  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  24.59 
 
 		 308 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.43 
 
 		 310 aa  42.4  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0367  hypothetical protein  32.14 
 
 		 310 aa  42.4  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.198495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>