77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02132 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02132  permease of the drug/metabolite transporter superfamily protein  100 
 
 		 194 aa  370  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.259073  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2087  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 283 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  hitchhiker  0.0000000953173 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1975  hypothetical protein  50 
 
 		 283 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0979714  hitchhiker  0.00214562 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2000  hypothetical protein  50 
 
 		 283 aa  170  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389336  decreased coverage  0.00000000377823 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2935  hypothetical protein  54.17 
 
 		 286 aa  168  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3109  hypothetical protein  49.48 
 
 		 289 aa  167  9e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0895719 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5364  hypothetical protein  49.48 
 
 		 285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.929346 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0746  DMT family permease  49 
 
 		 297 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0781  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.45 
 
 		 295 aa  163  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4266  hypothetical protein  46.91 
 
 		 295 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4790  membrane protein  45.83 
 
 		 285 aa  162  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.278325  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1416  hypothetical protein  45.27 
 
 		 304 aa  160  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.239593 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1850  sensor protein GLPS  49.75 
 
 		 302 aa  157  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.829384 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1774  hypothetical protein  45.31 
 
 		 297 aa  156  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1051  DMT superfamily efflux pump  44.78 
 
 		 254 aa  156  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.226473  normal  0.464817 
 
 
-
 
NC_003296  RS01739  hypothetical protein  46.39 
 
 		 303 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2406  hypothetical protein  46.93 
 
 		 290 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268881  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3521  hypothetical protein  46.88 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3816  hypothetical protein  45.83 
 
 		 307 aa  136  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1346  hypothetical protein  41.87 
 
 		 314 aa  135  5e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0646  hypothetical protein  40.1 
 
 		 288 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00955347  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2254  hypothetical protein  46.37 
 
 		 290 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.290541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001148  permease  40.84 
 
 		 289 aa  128  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270511  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1446  hypothetical protein  39.9 
 
 		 314 aa  124  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06636  hypothetical protein  40.31 
 
 		 289 aa  123  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1891  hypothetical protein  40.54 
 
 		 300 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0600  hypothetical protein  42.05 
 
 		 297 aa  123  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.172684 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1656  hypothetical protein  40.21 
 
 		 297 aa  121  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0479067  normal  0.122332 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4102  hypothetical protein  37.36 
 
 		 302 aa  121  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.576037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6439  hypothetical protein  41.75 
 
 		 275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.719443 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38950  hypothetical protein  47.92 
 
 		 287 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1068  hypothetical protein  38.54 
 
 		 311 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3318  hypothetical protein  47.92 
 
 		 286 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6146  hypothetical protein  41.24 
 
 		 302 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1087  hypothetical protein  51.56 
 
 		 281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.647653 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0856  hypothetical protein  42.78 
 
 		 288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0559005  normal  0.228089 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3356  hypothetical protein  38.1 
 
 		 287 aa  107  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1433  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.27 
 
 		 296 aa  104  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2916  hypothetical protein  41.03 
 
 		 282 aa  98.6  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.264108  normal  0.862431 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1613  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.06 
 
 		 307 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.76207  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2262  hypothetical protein  38.66 
 
 		 319 aa  89  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.099345  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1689  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.1 
 
 		 301 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112167  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46360  hypothetical protein  47.92 
 
 		 285 aa  84.7  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.206778  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0661  hypothetical protein  28.98 
 
 		 365 aa  49.3  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.9 
 
 		 324 aa  49.3  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  27.75 
 
 		 307 aa  48.1  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  26.22 
 
 		 274 aa  47.4  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  24.86 
 
 		 305 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4020  DMT family permease  25.7 
 
 		 330 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000861601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  26.94 
 
 		 279 aa  46.2  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  26.16 
 
 		 310 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 305 aa  46.2  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  28.95 
 
 		 303 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  30.08 
 
 		 289 aa  44.7  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0771  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.49 
 
 		 286 aa  44.7  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 305 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  23.49 
 
 		 292 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.68 
 
 		 299 aa  43.5  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  21.39 
 
 		 305 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2704  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.01 
 
 		 297 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  25 
 
 		 301 aa  42.4  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  25 
 
 		 301 aa  42.4  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.568191 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 301 aa  42.4  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  25 
 
 		 301 aa  42.4  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  28.57 
 
 		 303 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  25 
 
 		 301 aa  42.4  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.532448 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  25 
 
 		 301 aa  42.4  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  25 
 
 		 301 aa  42.4  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4430  putative transporter  25 
 
 		 304 aa  42.4  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  25 
 
 		 301 aa  42.4  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  30.72 
 
 		 331 aa  42  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.75 
 
 		 314 aa  41.6  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1383  hypothetical protein  26.23 
 
 		 308 aa  41.6  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  25.82 
 
 		 303 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0502  hypothetical protein  23.98 
 
 		 301 aa  41.6  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.643088  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.14 
 
 		 296 aa  41.6  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.64 
 
 		 310 aa  41.2  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>