96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5364 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5364  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  541  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.929346 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2935  hypothetical protein  64.87 
 
 		 286 aa  301  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3816  hypothetical protein  64.34 
 
 		 307 aa  289  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2087  LysR family transcriptional regulator  55.31 
 
 		 283 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  hitchhiker  0.0000000953173 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4266  hypothetical protein  51.65 
 
 		 295 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0781  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.74 
 
 		 295 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3109  hypothetical protein  55.56 
 
 		 289 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0895719 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1975  hypothetical protein  55.34 
 
 		 283 aa  269  4e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0979714  hitchhiker  0.00214562 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2000  hypothetical protein  55.34 
 
 		 283 aa  269  5e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389336  decreased coverage  0.00000000377823 
 
 
-
 
NC_003296  RS01739  hypothetical protein  55.11 
 
 		 303 aa  257  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0746  DMT family permease  50.52 
 
 		 297 aa  242  5e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4790  membrane protein  45.74 
 
 		 285 aa  236  4e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.278325  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1774  hypothetical protein  45.99 
 
 		 297 aa  229  4e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4102  hypothetical protein  46.04 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.576037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1656  hypothetical protein  51.81 
 
 		 297 aa  224  9e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0479067  normal  0.122332 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0646  hypothetical protein  45.42 
 
 		 288 aa  217  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00955347  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1068  hypothetical protein  42.01 
 
 		 311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3521  hypothetical protein  48.69 
 
 		 290 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1416  hypothetical protein  39 
 
 		 304 aa  205  6e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.239593 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38950  hypothetical protein  54.68 
 
 		 287 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1850  sensor protein GLPS  43.12 
 
 		 302 aa  196  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.829384 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2406  hypothetical protein  49.44 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1346  hypothetical protein  41.95 
 
 		 314 aa  193  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1891  hypothetical protein  41.95 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1433  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.91 
 
 		 296 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2254  hypothetical protein  49.44 
 
 		 290 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.290541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46360  hypothetical protein  58.2 
 
 		 285 aa  189  5.999999999999999e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.206778  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1446  hypothetical protein  38.38 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3318  hypothetical protein  54.15 
 
 		 286 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06636  hypothetical protein  44.89 
 
 		 289 aa  186  5e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001148  permease  41.61 
 
 		 289 aa  182  7e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270511  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6146  hypothetical protein  44.19 
 
 		 302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1087  hypothetical protein  58.3 
 
 		 281 aa  179  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.647653 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0856  hypothetical protein  52.31 
 
 		 288 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0559005  normal  0.228089 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6439  hypothetical protein  44.44 
 
 		 275 aa  168  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.719443 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1051  DMT superfamily efflux pump  39.73 
 
 		 254 aa  166  5e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.226473  normal  0.464817 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02132  permease of the drug/metabolite transporter superfamily protein  49.48 
 
 		 194 aa  165  6.9999999999999995e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.259073  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0600  hypothetical protein  41.94 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.172684 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2916  hypothetical protein  43.8 
 
 		 282 aa  158  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.264108  normal  0.862431 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3356  hypothetical protein  40 
 
 		 287 aa  149  7e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1689  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.91 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1613  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.33 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.76207  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2262  hypothetical protein  47.49 
 
 		 319 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.099345  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.54 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3388  hypothetical protein  29.75 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  26.3 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  26.67 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1383  hypothetical protein  26.84 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  26.33 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3820  hypothetical protein  25.68 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  24.29 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2135  hypothetical protein  27.12 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0459408  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  27.17 
 
 		 293 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  29.27 
 
 		 292 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  25.35 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  29.27 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  30.24 
 
 		 321 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 314 aa  52.4  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6431  hypothetical protein  28.87 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.275967  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.4 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0138  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.65 
 
 		 299 aa  50.4  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  24.65 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  28.23 
 
 		 289 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  23.86 
 
 		 307 aa  50.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  28.85 
 
 		 335 aa  49.7  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  28.64 
 
 		 343 aa  49.7  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  27.73 
 
 		 310 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  25.87 
 
 		 326 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  26.62 
 
 		 294 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2910  hypothetical protein  26.26 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  29.12 
 
 		 294 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4020  DMT family permease  28.52 
 
 		 330 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000861601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.08 
 
 		 306 aa  46.2  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  22.94 
 
 		 315 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2340  hypothetical protein  24.32 
 
 		 303 aa  45.8  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.83 
 
 		 299 aa  45.8  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.48 
 
 		 311 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8212  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.84 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.97 
 
 		 306 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2759  hypothetical protein  27.46 
 
 		 303 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  26.38 
 
 		 310 aa  43.9  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.46 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2139  puative integral membrane protein  26.84 
 
 		 297 aa  44.3  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.217486 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  28.32 
 
 		 311 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0519  hypothetical protein  23.98 
 
 		 301 aa  43.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0144274 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0441  hypothetical protein  24.78 
 
 		 301 aa  43.1  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3305  catalase  38.46 
 
 		 169 aa  42.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831237  normal  0.371892 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  27.34 
 
 		 325 aa  42.7  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0410  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 		 301 aa  42.7  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.88 
 
 		 311 aa  42.7  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0112  putative transporter  26.92 
 
 		 294 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0697635  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  26.92 
 
 		 294 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  26.92 
 
 		 294 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  26.92 
 
 		 294 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0395  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 		 301 aa  42.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  29.73 
 
 		 291 aa  42  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>