72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3305 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3305  catalase  100 
 
 		 169 aa  318  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831237  normal  0.371892 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4041  hypothetical protein  70.87 
 
 		 307 aa  142  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3308  drug/metabolite exporter (DME) family protein  70.87 
 
 		 307 aa  141  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2676  hypothetical protein  45.05 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.955594  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0279  hypothetical protein  38.06 
 
 		 321 aa  67.4  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0189  hypothetical protein  49.35 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.41043  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.96 
 
 		 282 aa  58.2  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0042e-23 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.78 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0600  hypothetical protein  42.86 
 
 		 297 aa  55.1  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.172684 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.66 
 
 		 311 aa  52.4  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3934  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50 
 
 		 306 aa  50.8  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0858224  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0882  hypothetical protein  31.25 
 
 		 296 aa  51.2  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000008536  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1068  hypothetical protein  37.84 
 
 		 311 aa  50.4  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0627  hypothetical protein  40.32 
 
 		 290 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0216  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.27 
 
 		 301 aa  48.9  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0201  hypothetical protein  47.27 
 
 		 301 aa  49.3  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3359  hypothetical protein  27.74 
 
 		 311 aa  48.1  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.71 
 
 		 313 aa  48.5  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.22564 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  40 
 
 		 308 aa  48.1  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  27.66 
 
 		 317 aa  48.1  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7788  hypothetical protein  37.35 
 
 		 296 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  35.64 
 
 		 379 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  29.79 
 
 		 308 aa  46.6  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  30.77 
 
 		 291 aa  45.4  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.51 
 
 		 289 aa  45.1  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.86 
 
 		 307 aa  45.4  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.99 
 
 		 290 aa  45.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36 
 
 		 309 aa  45.1  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  27.37 
 
 		 295 aa  45.1  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0331  hypothetical protein  56.1 
 
 		 323 aa  45.1  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  38.27 
 
 		 287 aa  44.3  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  34 
 
 		 290 aa  44.3  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  31.25 
 
 		 301 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  25.78 
 
 		 297 aa  44.3  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  38.1 
 
 		 303 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2994  hypothetical protein  39.02 
 
 		 303 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263501  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.59 
 
 		 325 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  28.06 
 
 		 274 aa  43.9  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0474  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.67 
 
 		 318 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5364  hypothetical protein  38.46 
 
 		 285 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.929346 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  34.72 
 
 		 293 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.9 
 
 		 321 aa  43.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.39 
 
 		 306 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0646  hypothetical protein  32.39 
 
 		 288 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00955347  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2560  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.34 
 
 		 290 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.711408  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  28.99 
 
 		 315 aa  42.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  34.31 
 
 		 319 aa  43.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.61 
 
 		 298 aa  43.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0416  hypothetical protein  31.48 
 
 		 312 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2087  LysR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 283 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  hitchhiker  0.0000000953173 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  30.77 
 
 		 290 aa  42.4  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.75 
 
 		 320 aa  42.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2935  hypothetical protein  38.67 
 
 		 286 aa  42  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0781  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.33 
 
 		 295 aa  42  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  30.86 
 
 		 307 aa  42  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3690  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.65 
 
 		 296 aa  41.6  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0058387  hitchhiker  0.0000000000902258 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4075  hypothetical protein  28.17 
 
 		 328 aa  41.6  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  26.19 
 
 		 308 aa  41.6  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6570  hypothetical protein  37.84 
 
 		 316 aa  41.6  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  31.71 
 
 		 317 aa  41.6  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  29.85 
 
 		 292 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2677  hypothetical protein  34.12 
 
 		 302 aa  41.2  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36 
 
 		 298 aa  41.2  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  33.33 
 
 		 312 aa  41.2  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0680  hypothetical protein  30.36 
 
 		 305 aa  41.2  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  37.88 
 
 		 306 aa  41.2  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.1 
 
 		 317 aa  40.8  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  36.9 
 
 		 297 aa  41.2  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  45.76 
 
 		 307 aa  40.8  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  35.38 
 
 		 293 aa  40.8  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.82 
 
 		 293 aa  40.8  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0251  hypothetical protein  26.25 
 
 		 305 aa  40.8  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>