131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0216 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0216  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 301 aa  549  1e-155  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0201  hypothetical protein  99.34 
 
 		 301 aa  546  1e-154  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0279  hypothetical protein  73.36 
 
 		 321 aa  361  7.0000000000000005e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0331  hypothetical protein  52.3 
 
 		 323 aa  196  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2676  hypothetical protein  43.49 
 
 		 299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.955594  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3934  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.39 
 
 		 306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0858224  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.03 
 
 		 282 aa  126  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0042e-23 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0189  hypothetical protein  41.54 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.41043  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3040  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.29 
 
 		 317 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00529542  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0627  hypothetical protein  42.86 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0305  hypothetical protein  43.06 
 
 		 349 aa  106  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.12 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.22564 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0774  hypothetical protein  32.47 
 
 		 321 aa  101  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.834381  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03168  permease of the drug/metabolite transporter  30.93 
 
 		 347 aa  99.8  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11064  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3308  drug/metabolite exporter (DME) family protein  47.83 
 
 		 307 aa  95.5  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3359  hypothetical protein  29.23 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1897  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.91 
 
 		 319 aa  94.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.454728 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4041  hypothetical protein  46.96 
 
 		 307 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1701  hypothetical protein  37.89 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.228923  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0475  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.51 
 
 		 381 aa  82.8  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00200  predicted permease, DMT superfamily  34.62 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2155  hypothetical protein  30.42 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.21 
 
 		 297 aa  68.9  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.27 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1861  hypothetical protein  31.2 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.654734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.92 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.19 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  24.32 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  28.88 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2030  hypothetical protein  27.57 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0852704 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  22.79 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  30.74 
 
 		 300 aa  57  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  28.62 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  30.46 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  30.46 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  34.75 
 
 		 312 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  24.66 
 
 		 296 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.9 
 
 		 287 aa  55.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0474  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.91 
 
 		 318 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5479  hypothetical protein  30.6 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.293066 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.82 
 
 		 310 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_924  transport protein  25.76 
 
 		 287 aa  55.1  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0491784  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  26.22 
 
 		 319 aa  53.1  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  25.38 
 
 		 287 aa  52.8  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01032  Transporter involved in threonine and homoserine efflux  27.51 
 
 		 290 aa  52.8  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.614417  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3305  catalase  39.55 
 
 		 169 aa  52.8  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831237  normal  0.371892 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2269  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.87 
 
 		 293 aa  52.4  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0769  hypothetical protein  30.92 
 
 		 306 aa  52  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  27.24 
 
 		 293 aa  51.6  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3662  hypothetical protein  30.99 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186688 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1835  EamA family protein  20.94 
 
 		 322 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.749092  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.88 
 
 		 289 aa  50.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  28.57 
 
 		 299 aa  50.4  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  22.26 
 
 		 295 aa  50.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1205  hypothetical protein  34.72 
 
 		 317 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0875949  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  26.94 
 
 		 294 aa  49.7  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  29.14 
 
 		 325 aa  49.3  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2802  hypothetical protein  29.87 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10684  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  26.39 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  31.69 
 
 		 315 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.76 
 
 		 282 aa  48.5  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  24.46 
 
 		 274 aa  48.9  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1633  hypothetical protein  21.13 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.67 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  32.17 
 
 		 317 aa  48.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  25 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2394  hypothetical protein  30.8 
 
 		 281 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.319154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5783  hypothetical protein  31.41 
 
 		 316 aa  47.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.614473  hitchhiker  0.00280675 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1892  transporter, EamA family  20.94 
 
 		 322 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0271761  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7788  hypothetical protein  31.4 
 
 		 296 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.04 
 
 		 292 aa  47  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0640  putative transmembrane protein  31.88 
 
 		 301 aa  46.6  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.110184 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  25.68 
 
 		 290 aa  46.6  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.37 
 
 		 293 aa  46.6  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1423  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.67 
 
 		 520 aa  46.2  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000166292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  29.41 
 
 		 312 aa  46.2  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2512  integral membrane domain-containing protein  29.49 
 
 		 303 aa  46.2  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.106417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  30.77 
 
 		 294 aa  45.8  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2372  hypothetical protein  31.15 
 
 		 311 aa  45.8  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187274  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00780  threonine and homoserine efflux system  29.35 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2829  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.35 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0520778  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  30.21 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.11 
 
 		 367 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.37 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  31.21 
 
 		 302 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  20.34 
 
 		 317 aa  45.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4038  hypothetical protein  26.09 
 
 		 287 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1383  hypothetical protein  30.21 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.02 
 
 		 290 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  22.7 
 
 		 307 aa  45.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0870  threonine and homoserine efflux system  29.35 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096225  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0883  threonine and homoserine efflux system  29.35 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000921417  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2830  threonine and homoserine efflux system  29.35 
 
 		 295 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2535  threonine and homoserine efflux system  29.35 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000316984  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0962  threonine and homoserine efflux system  29.35 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0232509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4094  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.3 
 
 		 317 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.466006  normal  0.380638 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.8 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00797  hypothetical protein  29.35 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  28.74 
 
 		 287 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  30.29 
 
 		 303 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>