More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0769 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0769  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  559  1e-158  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27900  membrane protein  52.84 
 
 		 311 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0399576 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  38.41 
 
 		 308 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2316  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.43 
 
 		 302 aa  129  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.93 
 
 		 325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.94 
 
 		 321 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.16 
 
 		 297 aa  109  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2030  hypothetical protein  33.33 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0852704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7788  hypothetical protein  38.25 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0474  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.34 
 
 		 318 aa  97.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0279  hypothetical protein  35.94 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0627  hypothetical protein  35.36 
 
 		 290 aa  90.1  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03168  permease of the drug/metabolite transporter  28.2 
 
 		 347 aa  87  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11064  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2676  hypothetical protein  35.91 
 
 		 299 aa  85.9  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.955594  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.07 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0042e-23 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2593  hypothetical protein  32.04 
 
 		 316 aa  79  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0305  hypothetical protein  37.31 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3004  hypothetical protein  33.48 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315518  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  31.16 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.32 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  29.78 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  29.11 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.9 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3934  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.57 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0858224  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3040  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.49 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00529542  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1785  DMT family permease  25.84 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000100378  hitchhiker  2.8549e-18 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15760  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  31 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.941518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  27.99 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  26.19 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  26.48 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2155  hypothetical protein  27.01 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0201  hypothetical protein  32.1 
 
 		 301 aa  67  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0774  hypothetical protein  28.72 
 
 		 321 aa  67  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.834381  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  33.65 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  28.63 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  29.33 
 
 		 315 aa  67  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0216  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.23 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.11 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.22564 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  32.17 
 
 		 397 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  27.4 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  33.17 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  30.84 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.36 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1667  DMT family permease  27.81 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000699147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  34.3 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.85 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  25.17 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3359  hypothetical protein  29.36 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1701  hypothetical protein  28.38 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.228923  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  31.31 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  32.86 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  31.54 
 
 		 317 aa  62.4  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0189  hypothetical protein  35.59 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.41043  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  30.58 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  33.65 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5479  hypothetical protein  33.33 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.293066 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  33.65 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  32.32 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  33.65 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  32.32 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  31.25 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  25.93 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0379  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.91 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.234172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  28.4 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  33.17 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  33.63 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1880  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.16 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.010243 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  33.63 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2244  DMT family permease  26.18 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.705911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  25.32 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3106  hypothetical protein  29.93 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00200  predicted permease, DMT superfamily  32.14 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.71 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.12 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5209  hypothetical protein  30.27 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1777  transporter  25.7 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  31.31 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1666  hypothetical protein  22.18 
 
 		 304 aa  57  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.656198  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.5 
 
 		 299 aa  57  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  25.56 
 
 		 292 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  31.37 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  29.05 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.78 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.955687  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2838  hypothetical protein  35.92 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0882  hypothetical protein  28.06 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000008536  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.54 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.77 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.296277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.06 
 
 		 325 aa  55.8  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.86 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  31.14 
 
 		 299 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  28.52 
 
 		 294 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  29.32 
 
 		 312 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.96 
 
 		 314 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  28.52 
 
 		 294 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1128  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  26.42 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2279  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.32 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136903  normal  0.215844 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4124  hypothetical protein  29.63 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000621435  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  30.88 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3933  hypothetical protein  33.58 
 
 		 284 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000367698  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>