123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3040 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3040  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
317 aa  574  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00529542  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0305  hypothetical protein  56.5 
 
 
349 aa  183  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2676  hypothetical protein  43.96 
 
 
299 aa  172  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.955594  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0627  hypothetical protein  50.94 
 
 
290 aa  172  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.1 
 
 
282 aa  171  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0042e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3934  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.28 
 
 
306 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0858224  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.55 
 
 
313 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.22564 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0189  hypothetical protein  49.27 
 
 
299 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.41043  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0279  hypothetical protein  39.62 
 
 
321 aa  138  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03168  permease of the drug/metabolite transporter  32.17 
 
 
347 aa  124  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11064  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  39.27 
 
 
308 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1701  hypothetical protein  39.62 
 
 
330 aa  117  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.228923  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0201  hypothetical protein  40.66 
 
 
301 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0216  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.66 
 
 
301 aa  116  5e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2269  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.81 
 
 
293 aa  106  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.43 
 
 
297 aa  105  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2155  hypothetical protein  31.54 
 
 
307 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3359  hypothetical protein  30.59 
 
 
311 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0774  hypothetical protein  31.06 
 
 
321 aa  100  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.834381  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0331  hypothetical protein  37.37 
 
 
323 aa  93.2  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.08 
 
 
321 aa  93.2  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.43 
 
 
325 aa  92  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00200  predicted permease, DMT superfamily  35.61 
 
 
326 aa  85.9  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1897  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.31 
 
 
319 aa  82.4  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.454728 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  24.83 
 
 
317 aa  78.6  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0475  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.35 
 
 
381 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0474  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.36 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.9 
 
 
309 aa  71.2  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7788  hypothetical protein  38.86 
 
 
296 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27900  membrane protein  35.14 
 
 
311 aa  64.7  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0399576 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3308  drug/metabolite exporter (DME) family protein  39.34 
 
 
307 aa  62.8  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2030  hypothetical protein  32.96 
 
 
308 aa  62.8  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0852704 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4041  hypothetical protein  37.7 
 
 
307 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3004  hypothetical protein  29.8 
 
 
314 aa  60.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315518  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.24 
 
 
310 aa  59.7  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  30.79 
 
 
294 aa  59.3  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0769  hypothetical protein  34.15 
 
 
306 aa  58.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.21 
 
 
311 aa  55.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  27.6 
 
 
315 aa  54.3  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  28.36 
 
 
317 aa  53.9  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  25.87 
 
 
315 aa  53.1  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  23.49 
 
 
305 aa  52.8  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  31.53 
 
 
304 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.42 
 
 
309 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2435  hypothetical protein  26.01 
 
 
303 aa  51.2  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  22.22 
 
 
294 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  22.22 
 
 
294 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.92 
 
 
305 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0680  hypothetical protein  27.33 
 
 
305 aa  49.3  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  22.78 
 
 
303 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2111  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.47 
 
 
292 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.43 
 
 
291 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.94 
 
 
291 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.67 
 
 
314 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  22.3 
 
 
303 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.52 
 
 
330 aa  48.5  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  23.53 
 
 
294 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  25.13 
 
 
303 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  28.57 
 
 
308 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  28.36 
 
 
290 aa  47.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0371  hypothetical protein  22.59 
 
 
315 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0749298  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02645  Predicted permease  21.38 
 
 
294 aa  47  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.880959  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.61 
 
 
303 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  25.64 
 
 
303 aa  47  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  21.64 
 
 
303 aa  47  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  25.13 
 
 
303 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  25.13 
 
 
303 aa  46.6  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  25.13 
 
 
303 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3501  hypothetical protein  27.27 
 
 
291 aa  46.6  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3086  hypothetical protein  33.14 
 
 
300 aa  47  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3097  hypothetical protein  23.32 
 
 
295 aa  46.6  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.27047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  25.13 
 
 
303 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.88 
 
 
299 aa  46.2  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  22.92 
 
 
274 aa  46.2  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.73 
 
 
323 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  25.12 
 
 
293 aa  46.2  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  25.12 
 
 
293 aa  45.8  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  31.31 
 
 
319 aa  45.8  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.55 
 
 
300 aa  45.8  0.0009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  24.62 
 
 
303 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  22.22 
 
 
294 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  22.22 
 
 
294 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  22.22 
 
 
294 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.69 
 
 
310 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  24.74 
 
 
292 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3338  hypothetical protein  26.67 
 
 
309 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252912  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  29.14 
 
 
309 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2994  integral membrane protein  23.51 
 
 
303 aa  44.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.19 
 
 
293 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1853  transporter, EamA family  24.05 
 
 
294 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.82 
 
 
287 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  26.21 
 
 
287 aa  44.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3514  membrane protein  24.49 
 
 
298 aa  43.9  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  30.56 
 
 
292 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4331  hypothetical protein  26.48 
 
 
316 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3168  hypothetical protein  35.25 
 
 
290 aa  44.3  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.302712  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  25.09 
 
 
293 aa  44.3  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  29.96 
 
 
307 aa  43.9  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.21 
 
 
319 aa  43.5  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0068  hypothetical protein  30.37 
 
 
289 aa  43.9  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>