251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0189 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0189  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  536  1e-151  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.41043  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2676  hypothetical protein  57.68 
 
 		 299 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.955594  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.94 
 
 		 282 aa  232  6e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0042e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3934  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.83 
 
 		 306 aa  216  5e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0858224  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3040  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.1 
 
 		 317 aa  178  9e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00529542  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0627  hypothetical protein  48.46 
 
 		 290 aa  162  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.63 
 
 		 313 aa  152  8e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.22564 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0279  hypothetical protein  41.31 
 
 		 321 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0305  hypothetical protein  49.76 
 
 		 349 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0201  hypothetical protein  43.08 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0216  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.08 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3308  drug/metabolite exporter (DME) family protein  43.52 
 
 		 307 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0774  hypothetical protein  34.63 
 
 		 321 aa  123  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.834381  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4041  hypothetical protein  42.33 
 
 		 307 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3359  hypothetical protein  35.23 
 
 		 311 aa  115  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00200  predicted permease, DMT superfamily  40.53 
 
 		 326 aa  108  7.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03168  permease of the drug/metabolite transporter  32.06 
 
 		 347 aa  106  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11064  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  33.44 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1701  hypothetical protein  35.86 
 
 		 330 aa  98.2  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.228923  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2155  hypothetical protein  28.05 
 
 		 307 aa  97.4  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1897  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.99 
 
 		 319 aa  96.3  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.454728 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0475  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.54 
 
 		 381 aa  96.3  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.03 
 
 		 297 aa  95.9  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.69 
 
 		 325 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.12 
 
 		 321 aa  92.4  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0331  hypothetical protein  38.75 
 
 		 323 aa  88.6  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0474  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.36 
 
 		 318 aa  88.6  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  33.58 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2269  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.33 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2030  hypothetical protein  33.89 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0852704 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  27.84 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3305  catalase  45.19 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831237  normal  0.371892 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  30.57 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.23 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  27.34 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.83 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  28.72 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7788  hypothetical protein  38.31 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  31.72 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.81 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  29.87 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.27 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  23.36 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27900  membrane protein  33.67 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0399576 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0769  hypothetical protein  34 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  29.34 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  25.59 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2593  hypothetical protein  34.34 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.56 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.74 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.77 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.43 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.55 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000007978  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1463  hypothetical protein  27.92 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  22.59 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  22.27 
 
 		 274 aa  55.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2394  hypothetical protein  29.74 
 
 		 281 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.319154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  32.1 
 
 		 397 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4044  carboxylate/amino acid/amine transporter  23.08 
 
 		 315 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0378511 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1891  hypothetical protein  28.09 
 
 		 300 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  32.01 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1666  hypothetical protein  22.56 
 
 		 304 aa  54.3  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.656198  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3972  carboxylate/amino acid/amine transporter  23.08 
 
 		 315 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4158  carboxylate/amino acid/amine transporter  23.08 
 
 		 315 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.565076  normal  0.615657 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  27.24 
 
 		 290 aa  54.3  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3990  carboxylate/amino acid/amine transporter  23.08 
 
 		 315 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  24.75 
 
 		 302 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.51 
 
 		 292 aa  53.5  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.92 
 
 		 317 aa  53.5  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.51 
 
 		 301 aa  53.1  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3337  hypothetical protein  27.92 
 
 		 298 aa  53.1  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.491654 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  26.46 
 
 		 315 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.77 
 
 		 323 aa  52.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  29.18 
 
 		 308 aa  52.4  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1835  EamA family protein  24.73 
 
 		 322 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.749092  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.11 
 
 		 307 aa  52.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4405  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.72 
 
 		 300 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.878991 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4295  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.72 
 
 		 313 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4095  carboxylate/amino acid/amine transporter  22.71 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  28.73 
 
 		 300 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3872  carboxylate/amino acid/amine transporter  22.75 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0764  DMT family permease  37.86 
 
 		 119 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.18822 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  21.89 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08620  predicted permease, DMT superfamily  24.46 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  25.13 
 
 		 304 aa  50.4  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5085  carboxylate/amino acid/amine transporter  22.75 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.35072 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  31.09 
 
 		 316 aa  50.8  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  35.39 
 
 		 286 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.07 
 
 		 299 aa  50.8  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  22.06 
 
 		 305 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.71 
 
 		 289 aa  50.4  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  35.14 
 
 		 292 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4015  carboxylate/amino acid/amine transporter  22.75 
 
 		 307 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  26.43 
 
 		 292 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0379  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.91 
 
 		 321 aa  50.1  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.234172  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0045  carboxylate/amino acid/amine transporter  22.75 
 
 		 307 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4167  carboxylate/amino acid/amine transporter  22.75 
 
 		 307 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  29.69 
 
 		 310 aa  49.7  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.63 
 
 		 286 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>